THRAP3

THRAP3 (англ. Thyroid hormone receptor associated protein 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 955 амінокислот, а молекулярна маса — 108 666.

THRAP3
Ідентифікатори
Символи	THRAP3, TRAP150, thyroid hormone receptor associated protein 3, BCLAF2
Зовнішні ІД	OMIM: 603809 MGI: 2442637 HomoloGene: 31289 GeneCards: THRAP3
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleotide binding • GO:0001105 transcription coactivator activity • GO:0001104 transcription coregulator activity • thyroid hormone receptor binding • phosphoprotein binding • core promoter sequence-specific DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nuclear receptor coactivator activity • ATP binding • vitamin D receptor binding • RNA binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • signaling receptor activity Клітинна компонента • nuclear speck • mediator complex • exon-exon junction complex • нуклеоплазма • екзосома • клітинне ядро Біологічний процес • androgen receptor signaling pathway • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of mRNA splicing, via spliceosome • ритмічний процес • mRNA processing • intracellular steroid hormone receptor signaling pathway • regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome • transcription, DNA-templated • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • nuclear-transcribed mRNA catabolic process • mRNA stabilization • циркадний ритм • Сплайсинг РНК • positive regulation of circadian rhythm • transcription initiation from RNA polymerase II promoter • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	9967	230753
Ensembl	ENSG00000054118	ENSMUSG00000043962
UniProt	Q9Y2W1	Q569Z6
RefSeq (мРНК)	NM_005119 NM_001321471 NM_001321473	NM_146153 NM_001356455 NM_001356456
RefSeq (білок)	NP_001308400 NP_001308402 NP_005110	NP_666265 NP_001343384 NP_001343385
Локус (UCSC)	Хр. 1: 36.22 – 36.31 Mb	Хр. 4: 126.16 – 126.2 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSKTNKSKSG		SRSSRSRSAS		RSRSRSFSKS		RSRSRSLSRS		RKRRLSSRSR
SRSYSPAHNR		ERNHPRVYQN		RDFRGHNRGY		RRPYYFRGRN		RGFYPWGQYN
RGGYGNYRSN		WQNYRQAYSP		RRGRSRSRSP		KRRSPSPRSR		SHSRNSDKSS
SDRSRRSSSS		RSSSNHSRVE		SSKRKSAKEK		KSSSKDSRPS		QAAGDNQGDE
AKEQTFSGGT		SQDTKASESS		KPWPDATYGT		GSASRASAVS		ELSPRERSPA
LKSPLQSVVV		RRRSPRPSPV		PKPSPPLSST		SQMGSTLPSG		AGYQSGTHQG
QFDHGSGSLS		PSKKSPVGKS		PPSTGSTYGS		SQKEESAASG		GAAYTKRYLE
EQKTENGKDK		EQKQTNTDKE		KIKEKGSFSD		TGLGDGKMKS		DSFAPKTDSE
KPFRGSQSPK		RYKLRDDFEK		KMADFHKEEM		DDQDKDKAKG		RKESEFDDEP
KFMSKVIGAN		KNQEEEKSGK		WEGLVYAPPG		KEKQRKTEEL		EEESFPERSK
KEDRGKRSEG		GHRGFVPEKN		FRVTAYKAVQ		EKSSSPPPRK		TSESRDKLGA
KGDFPTGKSS		FSITREAQVN		VRMDSFDEDL		ARPSGLLAQE		RKLCRDLVHS
NKKEQEFRSI		FQHIQSAQSQ		RSPSELFAQH		IVTIVHHVKE		HHFGSSGMTL
HERFTKYLKR		GTEQEAAKNK		KSPEIHRRID		ISPSTFRKHG		LAHDEMKSPR
EPGYKAEGKY		KDDPVDLRLD		IERRKKHKER		DLKRGKSRES		VDSRDSSHSR
ERSAEKTEKT		HKGSKKQKKH		RRARDRSRSS		SSSSQSSHSY		KAEEYTEETE
EREESTTGFD		KSRLGTKDFV		GPSERGGGRA		RGTFQFRARG		RGWGRGNYSG
NNNNNSNNDF		QKRNREEEWD		PEYTPKSKKY		YLHDDREGEG		SDKWVSRGRG
RGAFPRGRGR		FMFRKSSTSP		KWAHDKFSGE		EGEIEDDESG		TENREEKDNI
QPTTE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, активаторів. Задіяний у таких біологічних процесах як процесінг мРНК, сплайсінг мРНК, транскрипція, регуляція транскрипції, біологічні ритми. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
• Merz C., Urlaub H., Will C.L., Luhrmann R. (2007). Protein composition of human mRNPs spliced in vitro and differential requirements for mRNP protein recruitment. RNA. 13: 116—128. PMID 17095540 DOI:10.1261/rna.336807
• Carrascal M., Ovelleiro D., Casas V., Gay M., Abian J. (2008). Phosphorylation analysis of primary human T lymphocytes using sequential IMAC and titanium oxide enrichment. J. Proteome Res. 7: 5167—5176. PMID 19367720 DOI:10.1021/pr800500r
• Heyd F., Lynch K.W. (2010). Phosphorylation-dependent regulation of PSF by GSK3 controls CD45 alternative splicing. Mol. Cell. 40: 126—137. PMID 20932480 DOI:10.1016/j.molcel.2010.09.013
• Lee K.M., Hsu I.W., Tarn W.Y. (2010). TRAP150 activates pre-mRNA splicing and promotes nuclear mRNA degradation. Nucleic Acids Res. 38: 3340—3350. PMID 20123736 DOI:10.1093/nar/gkq017

Див. також

• Хромосома 1