THRAP3

THRAP3
Ідентифікатори
Символи	THRAP3, TRAP150, thyroid hormone receptor associated protein 3, BCLAF2
Зовнішні ІД	OMIM: 603809 MGI: 2442637 HomoloGene: 31289 GeneCards: THRAP3
Онтологія гена
Молекулярна функція	• nucleotide binding; • GO:0001105 transcription coactivator activity; • GO:0001104 transcription coregulator activity; • thyroid hormone receptor binding; • phosphoprotein binding; • core promoter sequence-specific DNA binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • nuclear receptor coactivator activity; • ATP binding; • vitamin D receptor binding; • RNA binding; • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; • signaling receptor activity;
Клітинна компонента	• nuclear speck; • mediator complex; • exon-exon junction complex; • нуклеоплазма; • екзосома; • клітинне ядро;
Біологічний процес	• androgen receptor signaling pathway; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • positive regulation of mRNA splicing, via spliceosome; • ритмічний процес; • mRNA processing; • intracellular steroid hormone receptor signaling pathway; • regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome; • transcription, DNA-templated; • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated; • nuclear-transcribed mRNA catabolic process; • mRNA stabilization; • циркадний ритм; • Сплайсинг РНК; • positive regulation of circadian rhythm; • transcription initiation from RNA polymerase II promoter; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	9967
	230753
	ENSG00000054118
	ENSMUSG00000043962
	Q9Y2W1
	Q569Z6
	NM_005119; NM_001321471; NM_001321473
	NM_146153; NM_001356455; NM_001356456
	NP_001308400; NP_001308402; NP_005110
	NP_666265; NP_001343384; NP_001343385
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

THRAP3 (англ. Thyroid hormone receptor associated protein 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 955 амінокислот, а молекулярна маса — 108 666^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSKTNKSKSG	SRSSRSRSAS	RSRSRSFSKS	RSRSRSLSRS	RKRRLSSRSR
SRSYSPAHNR	ERNHPRVYQN	RDFRGHNRGY	RRPYYFRGRN	RGFYPWGQYN
RGGYGNYRSN	WQNYRQAYSP	RRGRSRSRSP	KRRSPSPRSR	SHSRNSDKSS
SDRSRRSSSS	RSSSNHSRVE	SSKRKSAKEK	KSSSKDSRPS	QAAGDNQGDE
AKEQTFSGGT	SQDTKASESS	KPWPDATYGT	GSASRASAVS	ELSPRERSPA
LKSPLQSVVV	RRRSPRPSPV	PKPSPPLSST	SQMGSTLPSG	AGYQSGTHQG
QFDHGSGSLS	PSKKSPVGKS	PPSTGSTYGS	SQKEESAASG	GAAYTKRYLE
EQKTENGKDK	EQKQTNTDKE	KIKEKGSFSD	TGLGDGKMKS	DSFAPKTDSE
KPFRGSQSPK	RYKLRDDFEK	KMADFHKEEM	DDQDKDKAKG	RKESEFDDEP
KFMSKVIGAN	KNQEEEKSGK	WEGLVYAPPG	KEKQRKTEEL	EEESFPERSK
KEDRGKRSEG	GHRGFVPEKN	FRVTAYKAVQ	EKSSSPPPRK	TSESRDKLGA
KGDFPTGKSS	FSITREAQVN	VRMDSFDEDL	ARPSGLLAQE	RKLCRDLVHS
NKKEQEFRSI	FQHIQSAQSQ	RSPSELFAQH	IVTIVHHVKE	HHFGSSGMTL
HERFTKYLKR	GTEQEAAKNK	KSPEIHRRID	ISPSTFRKHG	LAHDEMKSPR
EPGYKAEGKY	KDDPVDLRLD	IERRKKHKER	DLKRGKSRES	VDSRDSSHSR
ERSAEKTEKT	HKGSKKQKKH	RRARDRSRSS	SSSSQSSHSY	KAEEYTEETE
EREESTTGFD	KSRLGTKDFV	GPSERGGGRA	RGTFQFRARG	RGWGRGNYSG
NNNNNSNNDF	QKRNREEEWD	PEYTPKSKKY	YLHDDREGEG	SDKWVSRGRG
RGAFPRGRGR	FMFRKSSTSP	KWAHDKFSGE	EGEIEDDESG	TENREEKDNI
QPTTE

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, активаторів. Задіяний у таких біологічних процесах як процесінг мРНК, сплайсінг мРНК, транскрипція, регуляція транскрипції, біологічні ритми. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
Merz C., Urlaub H., Will C.L., Luhrmann R. (2007). Protein composition of human mRNPs spliced in vitro and differential requirements for mRNP protein recruitment. RNA. 13: 116—128. PMID 17095540 DOI:10.1261/rna.336807
Carrascal M., Ovelleiro D., Casas V., Gay M., Abian J. (2008). Phosphorylation analysis of primary human T lymphocytes using sequential IMAC and titanium oxide enrichment. J. Proteome Res. 7: 5167—5176. PMID 19367720 DOI:10.1021/pr800500r
Heyd F., Lynch K.W. (2010). Phosphorylation-dependent regulation of PSF by GSK3 controls CD45 alternative splicing. Mol. Cell. 40: 126—137. PMID 20932480 DOI:10.1016/j.molcel.2010.09.013
Lee K.M., Hsu I.W., Tarn W.Y. (2010). TRAP150 activates pre-mRNA splicing and promotes nuclear mRNA degradation. Nucleic Acids Res. 38: 3340—3350. PMID 20123736 DOI:10.1093/nar/gkq017

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:22964 (англ.) . Процитовано 21 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q9Y2W1 (англ.) . Архів оригіналу за 31 липня 2017. Процитовано 21 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 1

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:22964 (англ.) . Процитовано 21 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, Q9Y2W1 (англ.) . Архів оригіналу за 31 липня 2017. Процитовано 21 серпня 2017.

[3]

[4]

[1]

[2]