THOC5

THOC5 (англ. THO complex 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 683 амінокислот, а молекулярна маса — 78 508.

THOC5
Ідентифікатори
Символи	THOC5, C22orf19, Fmip, PK1.3, fSAP79, THO complex 5
Зовнішні ІД	OMIM: 612733 MGI: 1351333 HomoloGene: 37836 GeneCards: THOC5
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding • mRNA binding Клітинна компонента • цитоплазма • THO complex • THO complex part of transcription export complex • transcription export complex • клітинне ядро • нуклеоплазма • nuclear chromosome Біологічний процес • positive regulation of DNA-templated transcription, elongation • primitive hemopoiesis • mRNA processing • диференціація клітин • mRNA transport • viral mRNA export from host cell nucleus • negative regulation of DNA damage checkpoint • monocyte differentiation • Сплайсинг РНК • RNA export from nucleus • mRNA export from nucleus • mRNA 3'-end processing Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	8563	107829
Ensembl	ENSG00000100296	ENSMUSG00000034274
UniProt	Q13769	Q8BKT7
RefSeq (мРНК)	NM_001002877 NM_001002878 NM_001002879 NM_003678	NM_172438
RefSeq (білок)	NP_001002877 NP_001002878 NP_001002879 NP_003669	NP_766026
Локус (UCSC)	Хр. 22: 29.51 – 29.56 Mb	Хр. 11: 4.85 – 4.88 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSSESSKKRK		PKVIRSDGAP		AEGKRNRSDT		EQEGKYYSEE		AEVDLRDPGR
DYELYKYTCQ		ELQRLMAEIQ		DLKSRGGKDV		AIEIEERRIQ		SCVHFMTLKK
LNRLAHIRLK		KGRDQTHEAK		QKVDAYHLQL		QNLLYEVMHL		QKEITKCLEF
KSKHEEIDLV		SLEEFYKEAP		PDISKAEVTM		GDPHQQTLAR		LDWELEQRKR
LAEKYRECLS		NKEKILKEIE		VKKEYLSSLQ		PRLNSIMQAS		LPVQEYLFMP
FDQAHKQYET		ARHLPPPLYV		LFVQATAYGQ		ACDKTLSVAI		EGSVDEAKAL
FKPPEDSQDD		ESDSDAEEEQ		TTKRRRPTLG		VQLDDKRKEM		LKRHPLSVML
DLKCKDDSVL		HLTFYYLMNL		NIMTVKAKVT		TAMELITPIS		AGDLLSPDSV
LSCLYPGDHG		KKTPNPANQY		QFDKVGILTL		SDYVLELGHP		YLWVQKLGGL
HFPKEQPQQT		VIADHSLSAS		HMETTMKLLK		TRVQSRLALH		KQFASLEHGI
VPVTSDCQYL		FPAKVVSRLV		KWVTVAHEDY		MELHFTKDIV		DAGLAGDTNL
YYMALIERGT		AKLQAAVVLN		PGYSSIPPVF		QLCLNWKGEK		TNSNDDNIRA
MEGEVNVCYK		ELCGPWPSHQ		LLTNQLQRLC		VLLDVYLETE		SHDDSVEGPK
EFPQEKMCLR		LFRGPSRMKP		FKYNHPQGFF		SHR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, транспорт, транспорт мРНК, диференціація клітин, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Boyne J.R., Colgan K.J., Whitehouse A. (2008). Recruitment of the complete hTREX complex is required for Kaposi's sarcoma-associated herpesvirus intronless mRNA nuclear export and virus replication. PLoS Pathog. 4: E1000194—E1000194. PMID 18974867 DOI:10.1371/journal.ppat.1000194
• Katahira J., Inoue H., Hurt E., Yoneda Y. (2009). Adaptor Aly and co-adaptor Thoc5 function in the Tap-p15-mediated nuclear export of HSP70 mRNA. EMBO J. 28: 556—567. PMID 19165146 DOI:10.1038/emboj.2009.5
• Dominguez-Sanchez M.S., Barroso S., Gomez-Gonzalez B., Luna R., Aguilera A. (2011). Genome instability and transcription elongation impairment in human cells depleted of THO/TREX. PLoS Genet. 7: E1002386—E1002386. PMID 22144908 DOI:10.1371/journal.pgen.1002386

Див. також

• Хромосома 22