TFIP11

TFIP11 (англ. Tuftelin interacting protein 11) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 837 амінокислот, а молекулярна маса — 96 820.

TFIP11
Ідентифікатори
Символи	TFIP11, NTR1, Spp382, TIP39, bK445C9.6, hNtr1, tuftelin interacting protein 11, STIP, STIP-1
Зовнішні ІД	OMIM: 612747 MGI: 1930075 HomoloGene: 40813 GeneCards: TFIP11
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleic acid binding Клітинна компонента • цитоплазма • nuclear speck • catalytic step 2 spliceosome • U2-type post-mRNA release spliceosomal complex • ядерце • spliceosomal complex • клітинне ядро • нуклеоплазма • GO:0005578 Позаклітинна матриця Біологічний процес • GO:0033168, GO:0036404, GO:1902360 RNA processing • protection from non-homologous end joining at telomere • GO:0106160 negative regulation of protein-containing complex assembly • biomineral tissue development • mRNA processing • spliceosomal complex disassembly • negative regulation of protein binding • negative regulation of double-strand break repair via nonhomologous end joining • Сплайсинг РНК • negative regulation of DNA ligase activity • mRNA splicing, via spliceosome Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	24144	54723
Ensembl	ENSG00000100109	ENSMUSG00000029345
UniProt	Q9UBB9	Q9ERA6
RefSeq (мРНК)	NM_001008697 NM_001346857 NM_001346858 NM_001346859 NM_001346861 NM_001346862 NM_012143	NM_018783
RefSeq (білок)	NP_001008697 NP_001333786 NP_001333787 NP_001333788 NP_001333790 NP_001333791 NP_036275	NP_061253
Локус (UCSC)	Хр. 22: 26.49 – 26.51 Mb	Хр. 5: 112.47 – 112.49 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSLSHLYRDG		EGRIDDDDDE		RENFEITDWD		LQNEFNPNRQ		RHWQTKEEAT
YGVWAERDSD		DERPSFGGKR		ARDYSAPVNF		ISAGLKKGAA		EEAELEDSDD
EEKPVKQDDF		PKDFGPRKLK		TGGNFKPSQK		GFAGGTKSFM		DFGSWERHTK
GIGQKLLQKM		GYVPGRGLGK		NAQGIINPIE		AKQRKGKGAV		GAYGSERTTQ
SMQDFPVVDS		EEEAEEEFQK		ELSQWRKDPS		GSKKKPKYSY		KTVEELKAKG
RISKKLTAPQ		KELSQVKVID		MTGREQKVYY		SYSQISHKHN		VPDDGLPLQS
QQLPQSGKEA		KAPGFALPEL		EHNLQLLIDL		TEQEIIQNDR		QLQYERDMVV
NLFHELEKMT		EVLDHEERVI		SNLSKVLEMV		EECERRMQPD		CSNPLTLDEC
ARIFETLQDK		YYEEYRMSDR		VDLAVAIVYP		LMKEYFKEWD		PLKDCTYGTE
IISKWKSLLE		NDQLLSHGGQ		DLSADAFHRL		IWEVWMPFVR		NIVTQWQPRN
CDPMVDFLDS		WVHIIPVWIL		DNILDQLIFP		KLQKEVENWN		PLTDTVPIHS
WIHPWLPLMQ		ARLEPLYSPI		RSKLSSALQK		WHPSDSSAKL		ILQPWKDVFT
PGSWEAFMVK		NIVPKLGMCL		GELVINPHQQ		HMDAFYWVID		WEGMISVSSL
VGLLEKHFFP		KWLQVLCSWL		SNSPNYEEIT		KWYLGWKSMF		SDQVLAHPSV
KDKFNEALDI		MNRAVSSNVG		AYMQPGAREN		IAYLTHTERR		KDFQYEAMQE
RREAENMAQR		GIGVAASSVP		MNFKDLIETK		AEEHNIVFMP		VIGKRHEGKQ
LYTFGRIVIY		IDRGVVFVQG		EKTWVPTSLQ		SLIDMAK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Jurica M.S., Licklider L.J., Gygi S.P., Grigorieff N., Moore M.J. (2002). Purification and characterization of native spliceosomes suitable for three-dimensional structural analysis. RNA. 8: 426—439. PMID 11991638 DOI:10.1017/S1355838202021088
• Yoshimoto R., Kataoka N., Okawa K., Ohno M. (2009). Isolation and characterization of post-splicing lariat-intron complexes. Nucleic Acids Res. 37: 891—902. PMID 19103666 DOI:10.1093/nar/gkn1002
• Yoshimoto R., Okawa K., Yoshida M., Ohno M., Kataoka N. (2014). Identification of a novel component C2ORF3 in the lariat-intron complex: lack of C2ORF3 interferes with pre-mRNA splicing via intron turnover pathway. Genes Cells. 19: 78—87. PMID 24304693 DOI:10.1111/gtc.12114

Див. також

• Хромосома 22