TDP1
білок-кодуючий ген Homo Sapiens
TDP1 (англ. Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 608 амінокислот, а молекулярна маса — 68 420[5].
Послідовність амінокислот
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MSQEGDYGRW | TISSSDESEE | EKPKPDKPST | SSLLCARQGA | ANEPRYTCSE | ||||
AQKAAHKRKI | SPVKFSNTDS | VLPPKRQKSG | SQEDLGWCLS | SSDDELQPEM | ||||
PQKQAEKVVI | KKEKDISAPN | DGTAQRTENH | GAPACHRLKE | EEDEYETSGE | ||||
GQDIWDMLDK | GNPFQFYLTR | VSGVKPKYNS | GALHIKDILS | PLFGTLVSSA | ||||
QFNYCFDVDW | LVKQYPPEFR | KKPILLVHGD | KREAKAHLHA | QAKPYENISL | ||||
CQAKLDIAFG | THHTKMMLLL | YEEGLRVVIH | TSNLIHADWH | QKTQGIWLSP | ||||
LYPRIADGTH | KSGESPTHFK | ADLISYLMAY | NAPSLKEWID | VIHKHDLSET | ||||
NVYLIGSTPG | RFQGSQKDNW | GHFRLKKLLK | DHASSMPNAE | SWPVVGQFSS | ||||
VGSLGADESK | WLCSEFKESM | LTLGKESKTP | GKSSVPLYLI | YPSVENVRTS | ||||
LEGYPAGGSL | PYSIQTAEKQ | NWLHSYFHKW | SAETSGRSNA | MPHIKTYMRP | ||||
SPDFSKIAWF | LVTSANLSKA | AWGALEKNGT | QLMIRSYELG | VLFLPSAFGL | ||||
DSFKVKQKFF | AGSQEPMATF | PVPYDLPPEL | YGSKDRPWIW | NIPYVKAPDT | ||||
HGNMWVPS |
Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, екзонуклеаз, нуклеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як пошкодження ДНК, репарація ДНК, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.
Література
ред.- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Pouliot J.J., Yao K.C., Robertson C.A., Nash H.A. (1999). Yeast gene for a Tyr-DNA phosphodiesterase that repairs topoisomerase I complexes. Science. 286: 552—555. PMID 10521354 DOI:10.1126/science.286.5439.552
- Interthal H., Pouliot J.J., Champoux J.J. (2001). The tyrosyl-DNA phosphodiesterase Tdp1 is a member of the phospholipase D superfamily. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 98: 12009—12014. PMID 11572945 DOI:10.1073/pnas.211429198
- Raymond A.C., Rideout M.C., Staker B., Hjerrild K., Burgin A.B. Jr. (2004). Analysis of human tyrosyl-DNA phosphodiesterase I catalytic residues. J. Mol. Biol. 338: 895—906. PMID 15111055 DOI:10.1016/j.jmb.2004.03.013
- Raymond A.C., Staker B.L., Burgin A.B. Jr. (2005). Substrate specificity of tyrosyl-DNA phosphodiesterase I (Tdp1). J. Biol. Chem. 280: 22029—22035. PMID 15811850 DOI:10.1074/jbc.M502148200
- Interthal H., Chen H.J., Champoux J.J. (2005). Human Tdp1 cleaves a broad spectrum of substrates, including phosphoamide linkages. J. Biol. Chem. 280: 36518—36528. PMID 16141202 DOI:10.1074/jbc.M508898200
Примітки
ред.- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з TDP1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:18884 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q9NUW8 (англ.) . Архів оригіналу за 24 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
Див. також
ред.Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |