TBC1D7

TBC1D7 (англ. TBC1D7-LOC100130357 readthrough) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 6-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 293 амінокислот, а молекулярна маса — 33 972.

TBC1D7
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3QWL, 5EJC, 4Z6Y
Ідентифікатори
Символи	TBC1D7, MGCPH, PIG51, TBC7, TBC1 domain family member 7
Зовнішні ІД	OMIM: 612655 MGI: 1914296 HomoloGene: 9538 GeneCards: TBC1D7
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0005097, GO:0005099, GO:0005100 GTPase activator activity Клітинна компонента • ciliary basal body • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • гіалоплазма Біологічний процес • negative regulation of TOR signaling • response to growth factor • positive regulation of protein ubiquitination • negative regulation of cilium assembly • GO:0032861, GO:0032862, GO:0032856 activation of GTPase activity • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	51256	67046
Ensembl	ENSG00000145979	ENSMUSG00000021368
UniProt	Q9P0N9	Q9D0K0
RefSeq (мРНК)	NM_001143964 NM_001143965 NM_001143966 NM_001258457 NM_016495 NM_001318805 NM_001318806	NM_001252639 NM_001252640 NM_025935
RefSeq (білок)	NP_001137436 NP_001137437 NP_001137438 NP_001245386 NP_001305734 NP_001305735 NP_057579	NP_001239568 NP_001239569 NP_080211
Локус (UCSC)	Хр. 6: 13.27 – 13.33 Mb	Хр. 13: 43.31 – 43.32 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MTEDSQRNFR		SVYYEKVGFR		GVEEKKSLEI		LLKDDRLDTE		KLCTFSQRFP
LPSMYRALVW		KVLLGILPPH		HESHAKVMMY		RKEQYLDVLH		ALKVVRFVSD
ATPQAEVYLR		MYQLESGKLP		RSPSFPLEPD		DEVFLAIAKA		MEEMVEDSVD
CYWITRRFVN		QLNTKYRDSL		PQLPKAFEQY		LNLEDGRLLT		HLRMCSAAPK
LPYDLWFKRC		FAGCLPESSL		QRVWDKVVSG		SCKILVFVAV		EILLTFKIKV
MALNSAEKIT		KFLENIPQDS		SDAIVSKAID		LWHKHCGTPV		HSS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до активаторів гтфаз. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазматичних везикулах.

Література

• Ishibashi K., Kanno E., Itoh T., Fukuda M. (2009). Identification and characterization of a novel Tre-2/Bub2/Cdc16 (TBC) protein that possesses Rab3A-GAP activity. Genes Cells. 14: 41—52. PMID 19077034 DOI:10.1111/j.1365-2443.2008.01251.x
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 6