TBC1D20

TBC1D20
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	4HL4, 4HLQ
Ідентифікатори
Символи	TBC1D20, C20orf140, WARBM4, TBC1 domain family member 20
Зовнішні ІД	OMIM: 611663 MGI: 1914481 HomoloGene: 32574 GeneCards: TBC1D20
Пов'язані генетичні захворювання
	Warburg micro syndrome 4, Warburg micro syndrome
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0005097, GO:0005099, GO:0005100 GTPase activator activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding;
Клітинна компонента	• Ядерна мембрана; • integral component of membrane; • integral component of Golgi membrane; • мембрана; • ендоплазматичний ретикулум; • endoplasmic reticulum membrane; • endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment membrane;
Біологічний процес	• lens fiber cell morphogenesis; • camera-type eye development; • acrosome assembly; • Сперматогенез; • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity; • positive regulation by virus of viral protein levels in host cell; • COPII-coated vesicle cargo loading; • lipid droplet organization; • positive regulation by host of viral genome replication; • endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport; • GO:0022415 viral process; • lens development in camera-type eye; • regulation of cilium assembly; • positive regulation of ER to Golgi vesicle-mediated transport; • male gonad development; • seminiferous tubule development; • Golgi organization; • COPII vesicle coating;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	128637
	67231
	ENSG00000125875
	ENSMUSG00000027465
	Q96BZ9
	Q9D9I4
	NM_144628
	NM_024196
	NP_653229
	NP_077158
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

TBC1D20 (англ. TBC1 domain family member 20) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 403 амінокислот, а молекулярна маса — 45 855^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MALRSAQGDG	PTSGHWDGGA	EKADFNAKRK	KKVAEIHQAL	NSDPTDVAAL
RRMAISEGGL	LTDEIRRKVW	PKLLNVNAND	PPPISGKNLR	QMSKDYQQVL
LDVRRSLRRF	PPGMPEEQRE	GLQEELIDII	LLILERNPQL	HYYQGYHDIV
VTFLLVVGER	LATSLVEKLS	THHLRDFMDP	TMDNTKHILN	YLMPIIDQVN
PELHDFMQSA	EVGTIFALSW	LITWFGHVLS	DFRHVVRLYD	FFLACHPLMP
IYFAAVIVLY	REQEVLDCDC	DMASVHHLLS	QIPQDLPYET	LISRAGDLFV
QFPPSELARE	AAAQQQAERT	AASTFKDFEL	ASAQQRPDMV	LRQRFRGLLR
PEDRTKDVLT	KPRTNRFVKL	AVMGLTVALG	AAALAVVKSA	LEWAPKFQLQ
LFP

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до активаторів гтфаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані.

Література ред.

Ishibashi K., Kanno E., Itoh T., Fukuda M. (2009). Identification and characterization of a novel Tre-2/Bub2/Cdc16 (TBC) protein that possesses Rab3A-GAP activity. Genes Cells. 14: 41—52. PMID 19077034 DOI:10.1111/j.1365-2443.2008.01251.x
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504