TBC1D2

TBC1D2 (англ. TBC1 domain family member 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 9-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 928 амінокислот, а молекулярна маса — 105 414.

TBC1D2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2DHK
Ідентифікатори
Символи	TBC1D2, PARIS-1, PARIS1, TBC1D2A, TBC1 domain family member 2
Зовнішні ІД	OMIM: 609871 MGI: 2652885 HomoloGene: 10190 GeneCards: TBC1D2
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • cadherin binding • GO:0005097, GO:0005099, GO:0005100 GTPase activator activity Клітинна компонента • цитоплазма • міжклітинні контакти • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • система ендомембран • клітинне ядро • гіалоплазма Біологічний процес • regulation of cilium assembly • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity • regulation of vesicle fusion • intracellular protein transport • GO:0032861, GO:0032862, GO:0032856 activation of GTPase activity Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	55357	381605
Ensembl	ENSG00000095383	ENSMUSG00000039813
UniProt	Q9BYX2	B1AVH7
RefSeq (мРНК)	NM_001267571 NM_001267572 NM_018421	NM_198664
RefSeq (білок)	NP_001254500 NP_001254501 NP_060891 NP_001254501.1	NP_941066
Локус (UCSC)	Хр. 9: 98.2 – 98.26 Mb	Хр. 4: 46.6 – 46.65 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEGAGENAPE		SSSSAPGSEE		SARDPQVPPP		EEESGDCARS		LEAVPKKLCG
YLSKFGGKGP		IRGWKSRWFF		YDERKCQLYY		SRTAQDANPL		DSIDLSSAVF
DCKADAEEGI		FEIKTPSRVI		TLKAATKQAM		LYWLQQLQMK		RWEFHNSPPA
PPATPDAALA		GNGPVLHLEL		GQEEAELEEF		LCPVKTPPGL		VGVAAALQPF
PALQNISLKH		LGTEIQNTMH		NIRGNKQAQG		TGHEPPGEDS		PQSGEPQREE
QPLASDASTP		GREPEDSPKP		APKPSLTISF		AQKAKRQNNT		FPFFSEGITR
NRTAQEKVAA		LEQQVLMLTK		ELKSQKELVK		ILHKALEAAQ		QEKRASSAYL
AAAEDKDRLE		LVRHKVRQIA		ELGRRVEALE		QERESLAHTA		SLREQQVQEL
QQHVQLLMDK		NHAKQQVICK		LSEKVTQDFT		HPPDQSPLRP		DAANRDFLSQ
QGKIEHLKDD		MEAYRTQNCF		LNSEIHQVTK		IWRKVAEKEK		ALLTKCAYLQ
ARNCQVESKY		LAGLRRLQEA		LGDEASECSE		LLRQLVQEAL		QWEAGEASSD
SIELSPISKY		DEYGFLTVPD		YEVEDLKLLA		KIQALESRSH		HLLGLEAVDR
PLRERWAALG		DLVPSAELKQ		LLRAGVPREH		RPRVWRWLVH		LRVQHLHTPG
CYQELLSRGQ		AREHPAARQI		ELDLNRTFPN		NKHFTCPTSS		FPDKLRRVLL
AFSWQNPTIG		YCQGLNRLAA		IALLVLEEEE		SAFWCLVAIV		ETIMPADYYC
NTLTASQVDQ		RVLQDLLSEK		LPRLMAHLGQ		HHVDLSLVTF		NWFLVVFADS
LISNILLRVW		DAFLYEGTKV		VFRYALAIFK		YNEKEILRLQ		NGLEIYQYLR
FFTKTISNSR		KLMNIAFNDM		NPFRMKQLRQ		LRMVHRERLE		AELRELEQLK
AEYLERRASR		RRAVSEGCAS		EDEVEGEA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів гтфаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, клітинних контактах, цитоплазматичних везикулах.

Література

• Ishibashi K., Kanno E., Itoh T., Fukuda M. (2009). Identification and characterization of a novel Tre-2/Bub2/Cdc16 (TBC) protein that possesses Rab3A-GAP activity. Genes Cells. 14: 41—52. PMID 19077034 DOI:10.1111/j.1365-2443.2008.01251.x
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 9