TBC1D1

TBC1D1 (англ. TBC1 domain family member 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 168 амінокислот, а молекулярна маса — 133 084.

TBC1D1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3QYE
Ідентифікатори
Символи	TBC1D1, TBC, TBC1, TBC1 domain family member 1
Зовнішні ІД	OMIM: 609850 MGI: 1889508 HomoloGene: 56856 GeneCards: TBC1D1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0005097, GO:0005099, GO:0005100 GTPase activator activity Клітинна компонента • гіалоплазма • клітинне ядро • система ендомембран • внутрішньоклітинний Біологічний процес • regulation of cilium assembly • membrane organization • regulation of protein localization • GO:0032861, GO:0032862, GO:0032856 activation of GTPase activity • regulation of vesicle fusion • intracellular protein transport Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	23216	57915
Ensembl	ENSG00000065882	ENSMUSG00000029174
UniProt	Q86TI0	Q60949
RefSeq (мРНК)	NM_001253912 NM_001253913 NM_001253914 NM_001253915 NM_015173 NM_001396959	NM_001289514 NM_019636 NM_001310611
RefSeq (білок)	NP_001240841 NP_001240842 NP_001240843 NP_001240844 NP_055988	NP_001276443 NP_001297540 NP_062610
Локус (UCSC)	Хр. 4: 37.89 – 38.14 Mb	Хр. 5: 64.31 – 64.51 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEPITFTARK		HLLSNEVSVD		FGLQLVGSLP		VHSLTTMPML		PWVVAEVRRL
SRQSTRKEPV		TKQVRLCVSP		SGLRCEPEPG		RSQQWDPLIY		SSIFECKPQR
VHKLIHNSHD		PSYFACLIKE		DAVHRQSICY		VFKADDQTKV		PEIISSIRQA
GKIARQEELH		CPSEFDDTFS		KKFEVLFCGR		VTVAHKKAPP		ALIDECIEKF
NHVSGSRGSE		SPRPNPPHAA		PTGSQEPVRR		PMRKSFSQPG		LRSLAFRKEL
QDGGLRSSGF		FSSFEESDIE		NHLISGHNIV		QPTDIEENRT		MLFTIGQSEV
YLISPDTKKI		ALEKNFKEIS		FCSQGIRHVD		HFGFICRESS		GGGGFHFVCY
VFQCTNEALV		DEIMMTLKQA		FTVAAVQQTA		KAPAQLCEGC		PLQSLHKLCE
RIEGMNSSKT		KLELQKHLTT		LTNQEQATIF		EEVQKLRPRN		EQRENELIIS
FLRCLYEEKQ		KEHIHIGEMK		QTSQMAAENI		GSELPPSATR		FRLDMLKNKA
KRSLTESLES		ILSRGNKARG		LQEHSISVDL		DSSLSSTLSN		TSKEPSVCEK
EALPISESSF		KLLGSSEDLS		SDSESHLPEE		PAPLSPQQAF		RRRANTLSHF
PIECQEPPQP		ARGSPGVSQR		KLMRYHSVST		ETPHERKDFE		SKANHLGDSG
GTPVKTRRHS		WRQQIFLRVA		TPQKACDSSS		RYEDYSELGE		LPPRSPLEPV
CEDGPFGPPP		EEKKRTSREL		RELWQKAILQ		QILLLRMEKE		NQKLQASEND
LLNKRLKLDY		EEITPCLKEV		TTVWEKMLST		PGRSKIKFDM		EKMHSAVGQG
VPRHHRGEIW		KFLAEQFHLK		HQFPSKQQPK		DVPYKELLKQ		LTSQQHAILI
DLGRTFPTHP		YFSAQLGAGQ		LSLYNILKAY		SLLDQEVGYC		QGLSFVAGIL
LLHMSEEEAF		KMLKFLMFDM		GLRKQYRPDM		IILQIQMYQL		SRLLHDYHRD
LYNHLEEHEI		GPSLYAAPWF		LTMFASQFPL		GFVARVFDMI		FLQGTEVIFK
VALSLLGSHK		PLILQHENLE		TIVDFIKSTL		PNLGLVQMEK		TINQVFEMDI
AKQLQAYEVE		YHVLQEELID		SSPLSDNQRM		DKLEKTNSSL		RKQNLDLLEQ
LQVANGRIQS		LEATIEKLLS		SESKLKQAML		TLELERSALL		QTVEELRRRS
AEPSDREPEC		TQPEPTGD

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів гтфаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Park S.Y., Jin W., Woo J.R., Shoelson S.E. (2011). Crystal structures of human TBC1D1 and TBC1D4 (AS160) RabGTPase-activating protein (RabGAP) domains reveal critical elements for GLUT4 translocation. J. Biol. Chem. 286: 18130—18138. PMID 21454505 DOI:10.1074/jbc.M110.217323

Див. також

• Хромосома 4