TATDN1

TATDN1 (англ. TatD DNase domain containing 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 8-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 297 амінокислот, а молекулярна маса — 33 602.

TATDN1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2XIO
Ідентифікатори
Символи	TATDN1, CDA11, TatD DNase domain containing 1
Зовнішні ІД	MGI: 1916944 HomoloGene: 57158 GeneCards: TATDN1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nuclease activity • deoxyribonuclease activity • endodeoxyribonuclease activity, producing 5'-phosphomonoesters • hydrolase activity, acting on ester bonds • hydrolase activity • зв'язування з іоном металу • 3'-5'-exodeoxyribonuclease activity Клітинна компонента • нуклеоплазма • клітинне ядро Біологічний процес • nucleic acid phosphodiester bond hydrolysis • DNA catabolic process • DNA metabolic process Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	83940	69694
Ensembl	ENSG00000147687	ENSMUSG00000050891
UniProt	Q6P1N9	Q6P8M1
RefSeq (мРНК)	NM_001146160 NM_032026 NM_001317889 NM_001317890 NM_001317891	NM_175151 NM_001368428 NM_001368628 NM_001368629 NM_001368630 NM_001368631 NM_001368632 NM_001368633 NM_001368635 NM_001368636 NM_001368634
RefSeq (білок)	NP_001139632 NP_001304818 NP_001304819 NP_001304820 NP_114415	NP_780360 NP_001355357 NP_001355557 NP_001355558 NP_001355559 NP_001355560 NP_001355561 NP_001355562 NP_001355564 NP_001355565 NP_001355563
Локус (UCSC)	Хр. 8: 124.49 – 124.54 Mb	Хр. 15: 58.76 – 58.81 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSRFKFIDIG		INLTDPMFRG		IYRGVQKHQD		DLQDVIGRAV		EIGVKKFMIT
GGNLQDSKDA		LHLAQTNGMF		FSTVGCHPTR		CGEFEKNNPD		LYLKELLNLA
ENNKGKVVAI		GECGLDFDRL		QFCPKDTQLK		YFEKQFELSE		QTKLPMFLHC
RNSHAEFLDI		MKRNRDRCVG		GVVHSFDGTK		EAAAALIDLD		LYIGFNGCSL
KTEANLEVLK		SIPSEKLMIE		TDAPWCGVKS		THAGSKYIRT		AFPTKKKWES
GHCLKDRNEP		CHIIQILEIM		SAVRDEDPLE		LANTLYNNTI		KVFFPGI

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, нуклеаз. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 8