Відкрити головне меню

TARDBP (англ. TAR DNA binding protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 414 амінокислот, а молекулярна маса — 44 740[5].

TARDBP
Protein TARDBP PDB 1wf0.png
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи TARDBP, ALS10, TDP-43, TAR DNA binding protein
Зовнішні ІД OMIM: 605078 MGI: 2387629 HomoloGene: 7221 GeneCards: TARDBP
Пов'язані генетичні захворювання
amyotrophic lateral sclerosis type 10[1]
Шаблон експресії
PBB GE TARDBP 221264 s at fs.png
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_007375
RefSeq (білок)
NP_031401
NP_031401.1
Локус (UCSC) Хр. 1: 11.01 – 11.03 Mb Хр. 4: 148.61 – 148.63 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей
Послідовність амінокислот
1020304050
MSEYIRVTEDENDEPIEIPSEDDGTVLLSTVTAQFPGACGLRYRNPVSQC
MRGVRLVEGILHAPDAGWGNLVYVVNYPKDNKRKMDETDASSAVKVKRAV
QKTSDLIVLGLPWKTTEQDLKEYFSTFGEVLMVQVKKDLKTGHSKGFGFV
RFTEYETQVKVMSQRHMIDGRWCDCKLPNSKQSQDEPLRSRKVFVGRCTE
DMTEDELREFFSQYGDVMDVFIPKPFRAFAFVTFADDQIAQSLCGEDLII
KGISVHISNAEPKHNSNRQLERSGRFGGNPGGFGNQGGFGNSRGGGAGLG
NNQGSNMGGGMNFGAFSINPAMMAAAQAALQSSWGMMGMLASQQNQSGPS
GNNQNQGNMQREPNQAFGSGNNSYSGSNSGAAIGWGSASNAGSGSGFNGG
FGSSMDSKSSGWGM

Кодований геном білок за функцією належить до репресорів. Задіяний у таких біологічних процесах як процесінг мРНК, сплайсінг мРНК, транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з ДНК, РНК. Локалізований у ядрі.

ЛітератураРедагувати

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004.  PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
  • Buratti E., Baralle F.E. (2001). Characterization and functional implications of the RNA binding properties of nuclear factor TDP-43, a novel splicing regulator of CFTR exon 9.. J. Biol. Chem. 276: 36337 — 36343.  PubMed DOI:10.1074/jbc.M104236200
  • Cassel J.A., Reitz A.B. (2013). Ubiquilin-2 (UBQLN2) binds with high affinity to the C-terminal region of TDP-43 and modulates TDP-43 levels in H4 cells: characterization of inhibition by nucleic acids and 4-aminoquinolines.. Biochim. Biophys. Acta 1834: 964 — 971.  PubMed DOI:10.1016/j.bbapap.2013.03.020
  • Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage.. Cell Rep. 10: 1778 — 1791.  PubMed DOI:10.1016/j.celrep.2015.02.033
  • Luquin N., Yu B., Saunderson R.B., Trent R.J., Pamphlett R. (2009). Genetic variants in the promoter of TARDBP in sporadic amyotrophic lateral sclerosis.. Neuromuscul. Disord. 19: 696 — 700.  PubMed DOI:10.1016/j.nmd.2009.07.005
  • Ou S.-H.I., Wu F., Harrich D., Garcia-Martinez L.F., Gaynor R.B. (1995). Cloning and characterization of a novel cellular protein, TDP-43, that binds to human immunodeficiency virus type 1 TAR DNA sequence motifs.. J. Virol. 69: 3584 — 3596.  PubMed

ПриміткиРедагувати

Див. такожРедагувати