TARBP2

TARBP2
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2CPN, 3ADL, 3LLH, 4WYQ
Ідентифікатори
Символи	TARBP2, LOQS, TRBP, TRBP1, TRBP2, RISC loading complex RNA binding subunit, TARBP2 subunit of RISC loading complex
Зовнішні ІД	OMIM: 605053 MGI: 103027 HomoloGene: 7562 GeneCards: TARBP2
Онтологія гена
Молекулярна функція	• protein N-terminus binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • siRNA binding; • RNA binding; • enzyme binding; • pre-mRNA binding; • double-stranded RNA binding; • identical protein binding; • protein homodimerization activity; • pre-miRNA binding; • miRNA binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • гіалоплазма; • perinuclear region of cytoplasm; • клітинне ядро; • нуклеоплазма; • ядерні тільця; • RISC-loading complex; • RISC;
Біологічний процес	• regulation of viral transcription; • negative regulation of protein kinase activity; • multicellular organism growth; • positive regulation of translation; • single fertilization; • negative regulation of defense response to virus by host; • spermatid development; • positive regulation of viral genome replication; • regulation of translation; • production of miRNAs involved in gene silencing by miRNA; • GO:0061715 miRNA metabolic process; • Сайленсинг генів; • GO:0070919 production of siRNA involved in RNA interference; • pre-miRNA processing; • regulation of production of miRNAs involved in gene silencing by miRNA; • skeletal muscle tissue regeneration; • positive regulation of muscle cell differentiation; • neural precursor cell proliferation;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	6895
	21357
	ENSG00000139546
	ENSMUSG00000023051
	Q15633
	P97473
	NM_004178; NM_134323; NM_134324
	NM_001253795; NM_009319
	NP_004169; NP_599150; NP_599151
	NP_001240724; NP_033345
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

TARBP2 (англ. TARBP2, RISC loading complex RNA binding subunit) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 366 амінокислот, а молекулярна маса — 39 039^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSEEEQGSGT	TTGCGLPSIE	QMLAANPGKT	PISLLQEYGT	RIGKTPVYDL
LKAEGQAHQP	NFTFRVTVGD	TSCTGQGPSK	KAAKHKAAEV	ALKHLKGGSM
LEPALEDSSS	FSPLDSSLPE	DIPVFTAAAA	ATPVPSVVLT	RSPPMELQPP
VSPQQSECNP	VGALQELVVQ	KGWRLPEYTV	TQESGPAHRK	EFTMTCRVER
FIEIGSGTSK	KLAKRNAAAK	MLLRVHTVPL	DARDGNEVEP	DDDHFSIGVG
SRLDGLRNRG	PGCTWDSLRN	SVGEKILSLR	SCSLGSLGAL	GPACCRVLSE
LSEEQAFHVS	YLDIEELSLS	GLCQCLVELS	TQPATVCHGS	ATTREAARGE
AARRALQYLK	IMAGSK

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як регуляція трансляції, РНК-залежне заглушення генів. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література ред.

Gatignol A., Buckler-White A.J., Berkhout B., Jeang K.T. (1991). Characterization of a human TAR RNA-binding protein that activates the HIV-1 LTR. Science. 251: 1597—1600. PMID 2011739 DOI:10.1126/science.2011739
Kozak C.A., Gatignol A., Graham K., Jeang K.T., McBride O.W. (1995). Genetic mapping in human and mouse of the locus encoding TRBP, a protein that binds the TAR region of the human immunodeficiency virus (HIV-1). Genomics. 25: 66—72. PMID 7774957 DOI:10.1016/0888-7543(95)80110-8
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Gatignol A., Buckler C., Jeang K.T. (1993). Relatedness of an RNA-binding motif in human immunodeficiency virus type 1 TAR RNA-binding protein TRBP to human P1/dsI kinase and Drosophila staufen. Mol. Cell. Biol. 13: 2193—2202. PMID 8455607 DOI:10.1128/MCB.13.4.2193
Gregory R.I., Chendrimada T.P., Cooch N., Shiekhattar R. (2005). Human RISC couples microRNA biogenesis and posttranscriptional gene silencing. Cell. 123: 631—640. PMID 16271387 DOI:10.1016/j.cell.2005.10.022
Maniataki E., Mourelatos Z. (2005). A human, ATP-independent, RISC assembly machine fueled by pre-miRNA. Genes Dev. 19: 2979—2990. PMID 16357216 DOI:10.1101/gad.1384005

Примітки ред.

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11569 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, Q15633 (англ.) . Архів оригіналу за 24 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також ред.

Хромосома 12

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11569 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q15633 (англ.) . Архів оригіналу за 24 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

[3]

[4]

[1]

[2]