TAP1

TAP1 (англ. Transporter 1, ATP binding cassette subfamily B member) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 808 амінокислот, а молекулярна маса — 87 218.

TAP1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1JJ7
Ідентифікатори
Символи	TAP1, ABC17, ABCB2, APT1, D6S114E, PSF-1, PSF1, RING4, TAP1*0102N, TAP1N, transporter 1, ATP-binding cassette, sub-family B (MDR/TAP), transporter 1, ATP binding cassette subfamily B member
Зовнішні ІД	OMIM: 170260 MGI: 98483 HomoloGene: 495 GeneCards: TAP1
Онтологія гена Молекулярна функція • MHC protein binding • nucleotide binding • protein homodimerization activity • ABC-type peptide transporter activity • TAP2 binding • MHC class Ib protein binding • ATPase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • MHC class I protein binding • TAP1 binding • ATP binding • peptide antigen binding • ADP binding • ATPase-coupled transmembrane transporter activity • ABC-type peptide antigen transporter activity • peptide transmembrane transporter activity Клітинна компонента • integral component of membrane • endoplasmic reticulum membrane • мембрана • TAP complex • integral component of endoplasmic reticulum membrane • мітохондрія • ендоплазматичний ретикулум • центр організації мікротрубочок • phagocytic vesicle membrane • endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment membrane • MHC class I peptide loading complex Біологічний процес • defense response • адаптивна імунна відповідь • процес імунної системи • antigen processing and presentation of peptide antigen via MHC class I • antigen processing and presentation of endogenous peptide antigen via MHC class I • protein transport • peptide transport • GO:0022415 viral process • cytosol to endoplasmic reticulum transport • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class I, TAP-dependent • vesicle fusion with endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment (ERGIC) membrane • трансмембранний транспорт • GO:0015915 транспорт Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6890	21354
Ensembl	ENSG00000226173 ENSG00000168394 ENSG00000224212 ENSG00000230705 ENSG00000206297 ENSG00000227816 ENSG00000224748 ENSG00000232367	ENSMUSG00000037321
UniProt	Q03518	P21958
RefSeq (мРНК)	NM_001292022 NM_000593	NM_001161730 NM_013683
RefSeq (білок)	NP_000584 NP_001278951	NP_001155202 NP_038711
Локус (UCSC)	Хр. 6: 32.85 – 32.85 Mb	Хр. 17: 34.41 – 34.42 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAELLASAGS		ACSWDFPRAP		PSFPPPAASR		GGLGGTRSFR		PHRGAESPRP
GRDRDGVRVP		MASSRCPAPR		GCRCLPGASL		AWLGTVLLLL		ADWVLLRTAL
PRIFSLLVPT		ALPLLRVWAV		GLSRWAVLWL		GACGVLRATV		GSKSENAGAQ
GWLAALKPLA		AALGLALPGL		ALFRELISWG		APGSADSTRL		LHWGSHPTAF
VVSYAAALPA		AALWHKLGSL		WVPGGQGGSG		NPVRRLLGCL		GSETRRLSLF
LVLVVLSSLG		EMAIPFFTGR		LTDWILQDGS		ADTFTRNLTL		MSILTIASAV
LEFVGDGIYN		NTMGHVHSHL		QGEVFGAVLR		QETEFFQQNQ		TGNIMSRVTE
DTSTLSDSLS		ENLSLFLWYL		VRGLCLLGIM		LWGSVSLTMV		TLITLPLLFL
LPKKVGKWYQ		LLEVQVRESL		AKSSQVAIEA		LSAMPTVRSF		ANEEGEAQKF
REKLQEIKTL		NQKEAVAYAV		NSWTTSISGM		LLKVGILYIG		GQLVTSGAVS
SGNLVTFVLY		QMQFTQAVEV		LLSIYPRVQK		AVGSSEKIFE		YLDRTPRCPP
SGLLTPLHLE		GLVQFQDVSF		AYPNRPDVLV		LQGLTFTLRP		GEVTALVGPN
GSGKSTVAAL		LQNLYQPTGG		QLLLDGKPLP		QYEHRYLHRQ		VAAVGQEPQV
FGRSLQENIA		YGLTQKPTME		EITAAAVKSG		AHSFISGLPQ		GYDTEVDEAG
SQLSGGQRQA		VALARALIRK		PCVLILDDAT		SALDANSQLQ		VEQLLYESPE
RYSRSVLLIT		QHLSLVEQAD		HILFLEGGAI		REGGTHQQLM		EKKGCYWAMV
QAPADAPE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як адаптивний імунітет, імунітет, взаємодія хазяїн-вірус, транспорт, транспорт білків. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у мембрані, ендоплазматичному ретикулумі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Jackson D.G., Capra J.D. (1993). TAP1 alleles in insulin-dependent diabetes mellitus: a newly defined centromeric boundary of disease susceptibility. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 90: 11079—11083. PMID 8248212 DOI:10.1073/pnas.90.23.11079
• Szafer F., Oksenberg J.R., Steinman L. (1994). New allelic polymorphisms in TAP genes. Immunogenetics. 39: 374—374. PMID 8168860 DOI:10.1007/BF00189240
• Bahram S., Arnold D., Bresnahan M., Strominger J.L., Spies T. (1991). Two putative subunits of a peptide pump encoded in the human major histocompatibility complex class II region. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 88: 10094—10098. PMID 1946428 DOI:10.1073/pnas.88.22.10094
• Hewitt E.W., Gupta S.S., Lehner P.J. (2001). The human cytomegalovirus gene product US6 inhibits ATP binding by TAP. EMBO J. 20: 387—396. PMID 11157746 DOI:10.1093/emboj/20.3.387
• Begley G.S., Horvath A.R., Taylor J.C., Higgins C.F. (2005). Cytoplasmic domains of the transporter associated with antigen processing and P-glycoprotein interact with subunits of the proteasome. Mol. Immunol. 42: 137—141. PMID 15488952 DOI:10.1016/j.molimm.2004.07.005

Див. також

• Хромосома 6