TAF1B

TAF1B
Ідентифікатори
Символи	TAF1B, MGC:9349, RAF1B, RAFI63, SL1, TAFI63, TATA-box binding protein associated factor, RNA polymerase I subunit B
Зовнішні ІД	OMIM: 604904 MGI: 109577 HomoloGene: 31331 GeneCards: TAF1B
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding; • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • зв'язування з іоном металу; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • TBP-class protein binding; • GO:0001187 RNA polymerase I core promoter sequence-specific DNA binding;
Клітинна компонента	• нуклеоплазма; • RNA polymerase transcription factor SL1 complex; • ядерце; • клітинне ядро; • RNA polymerase I core factor complex;
Біологічний процес	• termination of RNA polymerase I transcription; • epigenetic maintenance of chromatin in transcription-competent conformation; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • transcription initiation from RNA polymerase I promoter; • transcription, DNA-templated; • transcription by RNA polymerase I; • RNA polymerase I preinitiation complex assembly; • nucleolar large rRNA transcription by RNA polymerase I; • GO:0001183 transcription elongation from RNA polymerase I promoter;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	9014
	21340
	ENSG00000115750
	ENSMUSG00000059669
	Q53T94
	P97358
	NM_005680; NM_001318976; NM_001318977
	NM_020614
	NP_001305905; NP_001305906; NP_005671
	NP_065639
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

TAF1B (англ. TATA-box binding protein associated factor, RNA polymerase I subunit B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 588 амінокислот, а молекулярна маса — 68 832^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MDLEEAEEFK	ERCTQCAAVS	WGLTDEGKYY	CTSCHNVTER	YQEVTNTDLI
PNTQIKALNR	GLKKKNNTEK	GWDWYVCEGF	QYILYQQAEA	LKNLGVGPEL
KNDVLHNFWK	RYLQKSKQAY	CKNPVYTTGR	KPTVLEDNLS	HSDWASEPEL
LSDVSCPPFL	ESGAESQSDI	HTRKPFPVSK	ASQSETSVCS	GSLDGVEYSQ
RKEKGIVKMT	MPQTLAFCYL	SLLWQREAIT	LSDLLRFVEE	DHIPYINAFQ
HFPEQMKLYG	RDRGIFGIES	WPDYEDIYKK	TVEVGTFLDL	PRFPDITEDC
YLHPNILCMK	YLMEVNLPDE	MHSLTCHVVK	MTGMGEVDFL	TFDPIAKMAK
TVKYDVQAVA	IIVVVLKLLF	LLDDSFEWSL	SNLAEKHNEK	NKKDKPWFDF
RKWYQIMKKA	FDEKKQKWEE	ARAKYLWKSE	KPLYYSFVDK	PVAYKKREMV
VNLQKQFSTL	VESTATAGKK	SPSSFQFNWT	EEDTDRTCFH	GHSLQGVLKE
KGQSLLTKNS	LYWLSTQKFC	RCYCTHVTTY	EESNYSLSYQ	FILNLFSFLL
RIKTSLLHEE	VSLVEKKLFE	KKYSVKRKKS	RSKKVRRH

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, поліморфізм, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література ред.

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Zomerdijk J.C., Beckmann H., Comai L., Tjian R. (1994). Assembly of transcriptionally active RNA polymerase I initiation factor SL1 from recombinant subunits. Science. 266: 2015—2018. PMID 7801130 DOI:10.1126/science.7801130
Beckmann H., Chen J.L., O'Brien T., Tjian R. (1995). Coactivator and promoter-selective properties of RNA polymerase I TAFs. Science. 270: 1506—1509. PMID 7491500 DOI:10.1126/science.270.5241.1506
Friedrich J.K., Panov K.I., Cabart P., Russell J., Zomerdijk J.C.B.M. (2005). TBP-TAF complex SL1 directs RNA polymerase I pre-initiation complex formation and stabilizes upstream binding factor at the rDNA promoter. J. Biol. Chem. 280: 29551—29558. PMID 15970593 DOI:10.1074/jbc.M501595200
Knutson B.A., Hahn S. (2011). Yeast Rrn7 and human TAF1B are TFIIB-related RNA polymerase I general transcription factors. Science. 333: 1637—1640. PMID 21921198 DOI:10.1126/science.1207699
Naidu S., Friedrich J.K., Russell J., Zomerdijk J.C. (2011). TAF1B is a TFIIB-like component of the basal transcription machinery for RNA polymerase I. Science. 333: 1640—1642. PMID 21921199 DOI:10.1126/science.1207656

Примітки ред.

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11533 (англ.) . Архів оригіналу за 24 березня 2016. Процитовано 28 серпня 2017.
↑ UniProt, Q53T94 (англ.) . Архів оригіналу за 29 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також ред.

Хромосома 2

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11533 (англ.) . Архів оригіналу за 24 березня 2016. Процитовано 28 серпня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q53T94 (англ.) . Архів оригіналу за 29 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.

[3]

[4]

[1]

[2]