TAF1A

TAF1A
Ідентифікатори
Символи	TAF1A, MGC:17061, RAFI48, SL1, TAFI48, TATA-box binding protein associated factor, RNA polymerase I subunit A
Зовнішні ІД	OMIM: 604903 MGI: 109578 HomoloGene: 4155 GeneCards: TAF1A
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding;
Клітинна компонента	• microtubule cytoskeleton; • RNA polymerase I transcription regulator complex; • клітинне ядро; • нуклеоплазма;
Біологічний процес	• transcription initiation from RNA polymerase I promoter; • transcription by RNA polymerase I; • termination of RNA polymerase I transcription; • epigenetic maintenance of chromatin in transcription-competent conformation; • transcription by RNA polymerase II; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • transcription, DNA-templated; • GO:0001183 transcription elongation from RNA polymerase I promoter;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	9015
	21339
	ENSG00000143498
	ENSMUSG00000072258
	Q15573; Q5JRA7
	P97357
	NM_001201536; NM_005681; NM_139352
	NM_001277957; NM_001277958; NM_001277959; NM_021466
	NP_001188465; NP_005672; NP_647603
	NP_001264886; NP_001264887; NP_001264888; NP_067441
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

TAF1A (англ. TATA-box binding protein associated factor, RNA polymerase I subunit A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 450 амінокислот, а молекулярна маса — 52 676^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSDFSEELKG	PVTDDEEVET	SVLSGAGMHF	PWLQTYVETV	AIGGKRRKDF
AQTTSACLSF	IQEALLKHQW	QQAAEYMYSY	FQTLEDSDSY	KRQAAPEIIW
KLGSEILFYH	PKSNMESFNT	FANRMKNIGV	MNYLKISLQH	ALYLLHHGML
KDAKRNLSEA	ETWRHGENTS	SREILINLIQ	AYKGLLQYYT	WSEKKMELSK
LDKDDYAYNA	VAQDVFNHSW	KTSANISALI	KIPGVWDPFV	KSYVEMLEFY
GDRDGAQEVL	TNYAYDEKFP	SNPNAHIYLY	NFLKRQKAPR	SKLISVLKIL
YQIVPSHKLM	LEFHTLLRKS	EKEEHRKLGL	EVLFGVLDFA	GCTKNITAWK
YLAKYLKNIL	MGNHLAWVQE	EWNSRKNWWP	GFHFSYFWAK	SDWKEDTALA
CEKAFVAGLL	LGKGCRYFRY	ILKQDHQILG	KKIKRMKRSV	KKYSIVNPRL

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література ред.

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Beckmann H., Chen J.L., O'Brien T., Tjian R. (1995). Coactivator and promoter-selective properties of RNA polymerase I TAFs. Science. 270: 1506—1509. PMID 7491500 DOI:10.1126/science.270.5241.1506
Friedrich J.K., Panov K.I., Cabart P., Russell J., Zomerdijk J.C.B.M. (2005). TBP-TAF complex SL1 directs RNA polymerase I pre-initiation complex formation and stabilizes upstream binding factor at the rDNA promoter. J. Biol. Chem. 280: 29551—29558. PMID 15970593 DOI:10.1074/jbc.M501595200
Muller C., Bremer A., Schreiber S., Eichwald S., Calkhoven C.F. (2010). Nucleolar retention of a translational C/EBPalpha isoform stimulates rDNA transcription and cell size. EMBO J. 29: 897—909. PMID 20075868 DOI:10.1038/emboj.2009.404

Примітки ред.

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11532 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
↑ UniProt, Q15573 (англ.) . Архів оригіналу за 9 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також ред.

Хромосома 1

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11532 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q15573 (англ.) . Архів оригіналу за 9 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.

[3]

[4]

[1]

[2]