SYNE3

SYNE3 (англ. Spectrin repeat containing nuclear envelope family member 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 14-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 975 амінокислот, а молекулярна маса — 112 216.

SYNE3
Ідентифікатори
Символи	SYNE3, C14orf49, NET53, Nesp3, spectrin repeat containing nuclear envelope family member 3, C14orf139, KASH3, LINC00341, NCRNA00341
Зовнішні ІД	OMIM: 610861 MGI: 2442408 HomoloGene: 17625 GeneCards: SYNE3
Онтологія гена Молекулярна функція • actin filament binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • cytoskeletal protein binding Клітинна компонента • integral component of membrane • rough endoplasmic reticulum • nuclear outer membrane • nuclear envelope • мембрана • meiotic nuclear membrane microtubule tethering complex • клітинне ядро • ендоплазматичний ретикулум • ядерна мембрана • цитоплазма Біологічний процес • establishment of protein localization to membrane • cytoskeleton organization • regulation of cell shape • nuclear migration • nucleus localization Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	161176	212073
Ensembl	ENSG00000176438	ENSMUSG00000054150
UniProt	Q6ZMZ3	Q4FZC9
RefSeq (мРНК)	NM_024633 NM_152592 NM_001363692 NM_001384281 NM_001384282 NM_001384283 NM_001384284	NM_001042699 NM_172500
RefSeq (білок)	NP_689805 NP_001350621	NP_001036164 NP_766088 NP_001390387
Локус (UCSC)	Хр. 14: 95.41 – 95.52 Mb	Хр. 12: 104.9 – 104.98 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MTQQPQDDFD		RSVEDAQAWM		KAVQDQLQVN		DNTQGPRAAL		EARLWETEKI
CQLEPEGRVR		VDLVLRMAEA		LLACCPGDQK		PGILARLKDI		KAQWEETVTY
MTHCHSRIEW		VWLHWSEYLL		ARDEFYRWFQ		KMMVTLEPHI		ELQLGLKEKQ
WQLSHAQVLL		HNVDNQAVLL		DRLLEEAASL		FNRIGDPSVD		EDAQKRMKAE
YDAVKAKAQK		RVDLLEQVAR		EHEEYQAGVD		EFQLWLKAVV		EKVNGCLGRN
CKLPITQRLS		TLQDIAKDFP		RGEESLETLE		EQSAGVIRNT		SPLGAEKITG
ELEEMRKVLE		KLRALWEEEE		ERLRGLLRSR		GAWEQQIKQL		EAELSEFRMV
LQRLAQEGLQ		PAAKAGTEDE		LVAHWRRYSA		TRAALASEEP		RVDRLQAQLK
ELIVFPHNLK		PLSDSVIATI		QEYQSLKVKS		ARLRNAAAVE		LWQHFQRPLQ
DLQLWKALAQ		RLLEVTASLP		DLPSLHTFLP		QIEAALMESS		RLKELLTMLQ
LKKDLLIGIF		GQERATALLE		QVAGSMRDRD		LLHNSLLQRK		SKLQSLLAQH
KDFGAAFEPL		QRKLLDLQVR		VQAEKGLQRD		LPGKQAQLSR		LQGLQEEGLD
LGAQMEAARP		LVQENPNHQH		KMDQLSSDFQ		ALQRSLEDLV		DRCRQSVQEH
CTFSHQLLEL		RQWIVVTTQK		LEAHRGEAGP		GDAESQEAEF		ERLVAEFPEK
EAQLSLVEAQ		GWLVMEKSSP		EGAAVVQEEL		RELAESWRAL		RLLEESLLSL
IRNWHLQRME		VDSGKKMVFT		NNIPKSGFLI		NPMDPIPRHR		RRANLLQEEE
GSHEDFSQLL		RNFGQWLQVE		NSKLVRIIAM		RTSTAEDLRT		RKSKLQELEA
RVPEGQHLFE		NLLRLGPARG		TSDELEDLRY		QWMLYKSKLK		DSGHLLTQSS
PGEPTGFQKT		RRWRGLGSLF		RRACCVALPL		QLLLLLFLLL		LFLLPIREED
RSCTLANNFA		RSFTLMLRYN		GPPPT

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі, мембрані, ендоплазматичному ретикулумі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Stewart-Hutchinson P.J., Hale C.M., Wirtz D., Hodzic D. (2008). Structural requirements for the assembly of LINC complexes and their function in cellular mechanical stiffness. Exp. Cell Res. 314: 1892—1905. PMID 18396275 DOI:10.1016/j.yexcr.2008.02.022

Див. також

• Хромосома 14