SYNE2

SYNE2 (англ. Spectrin repeat containing nuclear envelope protein 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 6 885 амінокислот, а молекулярна маса — 796 442.

SYNE2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4DXS, 4FI9
Ідентифікатори
Символи	SYNE2, EDMD5, NUA, NUANCE, Nesp2, Nesprin-2, SYNE-2, TROPH, spectrin repeat containing nuclear envelope protein 2, KASH2
Зовнішні ІД	OMIM: 608442 MGI: 2449316 HomoloGene: 56700 GeneCards: SYNE2
Онтологія гена Молекулярна функція • actin filament binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • actin binding Клітинна компонента • цитоплазма • integral component of membrane • Ядерна мембрана • nuclear envelope • мембрана • focal adhesion • клітинна мембрана • sarcoplasmic reticulum • Нуклеоплазма • aggresome • Міжклітинні контакти • Міофібрила • Z disc • meiotic nuclear membrane microtubule tethering complex • мітохондрія • sarcoplasmic reticulum membrane • intermediate filament cytoskeleton • nuclear lumen • екзосома • nuclear outer membrane • lamellipodium membrane • Цитоскелет • клітинне ядро • filopodium membrane • центросома Біологічний процес • fibroblast migration • nuclear envelope organization • nuclear migration along microfilament • positive regulation of cell migration • centrosome localization • nuclear migration • establishment or maintenance of cell polarity • protein localization to nucleus • nucleokinesis involved in cell motility in cerebral cortex radial glia guided migration • regulation of cilium assembly • centriole-centriole cohesion Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	23224	319565
Ensembl	ENSG00000054654	ENSMUSG00000063450
UniProt	Q8WXH0	Q6ZWQ0
RefSeq (мРНК)	NM_015180 NM_182910 NM_182912 NM_182913 NM_182914	NM_001005510
RefSeq (білок)	NP_055995 NP_878914 NP_878917 NP_878918	NP_001005510
Локус (UCSC)	Хр. 14: 63.76 – 64.23 Mb	Хр. 12: 75.86 – 76.16 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MASSPELPTE		DEQGSWGIDD		LHISLQAEQE		DTQKKAFTCW		INSQLARHTS
PSVISDLFTD		IKKGHVLLDL		LEVLSGQQLP		RDKGSNTFQC		RINIEHALTF
LRNRSIKLIN		IHVTDIIDGN		PSIILGLIWT		IILHFHIEKL		AQTLSCNYNQ
PSLDDVSVVD		SSPASSPPAK		KCSKVQARWQ		MSARKALLLW		AQEQCATYES
VNVTDFKSSW		RNGMAFLAII		HALRPDLIDM		KSVKHRSNKD		NLREAFRIAE
QELKIPRLLE		PEDVDVVDPD		EKSIMTYVAQ		FLQYSKDAPG		TGEEAQGKVK
DAMGWLTLQK		EKLQKLLKDS		ENDTYFKKYN		SLLSFMESFN		EEKKSFLDVL
SIKRDLDELD		KDHLQLREAW		DGLDHQINAW		KIKLNYALPP		PLHQTEAWLQ
EVEELMDEDL		SASQDHSQAV		TLIQEKMTLF		KSLMDRFEHH		SNILLTFENK
DENHLPLVPP		NKLEEMKRRI		NNILEKKFIL		LLEFHYYKCL		VLGLVDEVKS
KLDIWNIKYG		SRESVELLLE		DWHKFIEEKE		FLARLDTSFQ		KCGEIYKNLA
GECQNINKQY		MMVKSDVCMY		RKNIYNVKST		LQKVLACWAT		YVENLRLLRA
CFEETKKEEI		KEVPFETLAQ		WNLEHATLNE		AGNFLVEVSN		DVVGSSISKE
LRRLNKRWRK		LVSKTQLEMN		LPLMIKKQDQ		PTFDNSGNIL		SKEEKATVEF
STDMSVELPE		NYNQNIKAGE		KHEKENEEFT		GQLKVAKDVE		KLIGQVEIWE
AEAKSVLDQD		DVDTSMEESL		KHLIAKGSMF		DELMARSEDM		LQMDIQNISS
QESFQHVLTT		GLQAKIQEAK		EKVQINVVKL		IAALKNLTDV		SPDLDIRLKM
EESQKELESY		MMRAQQLLGQ		RESPGELISK		HKEALIISNT		KSLAKYLKAV
EELKNNVTED		IKMSLEEKSR		DVCAKWESLH		HELSLYVQQL		KIDIEKGKLS
DNILKLEKQI		NKEKKLIRRG		RTKGLIKEHE		ACFSEEGCLY		QLNHHMEVLR
ELCEELPSQK		SQQEVKRLLK		DYEQKIERLL		KCASEIHMTL		QPTAGGTSKN
EGTITTSENR		GGDPHSEAPF		AKSDNQPSTE		KAMEPTMKFS		LASVLRPLQE
ESIMEKDYSA		SINSLLERYD		TYRDILEHHL		QNNKFRITSD		FSSEEDRSSS
CLQAKLTDLQ		VIKNETDARW		KEFEIISLKL		ENHVNDIKKP		FVIKERDTLK
ERERELQMTL		NTRMESLETA		LRLVLPVEKA		SLLLCGSDLP		LHKMAIQGFH
LIDADRIYQH		LRNIQDSIAK		QIEICNRLEE		PGNFVLKELH		PFDLHAMQNI
ILKYKTQFEG		MNHRVQRSED		TLKALEDFLA		SLRTAKLSAE		PVTDLSASDT
QVAQENTLTV		KNKEGEIHLM		KDKAKHLDKC		LKMLDMSFKD		AERGDDTSCE
NLLDAFSIKL		SETHGYGVQE		EFTEENKLLE		ACIFKNNELL		KNIQDVQSQI
SKIGLKDPTV		PAVKHRKKSL		IRLDKVLDEY		EEEKRHLQEM		ANSLPHFKDG
REKTVNQQCQ		NTVVLWENTK		ALVTECLEQC		GRVLELLKQY		QNFKSILTTL
IQKEESVISL		QASYMGKENL		KKRIAEIEIV		KEEFNEHLEV		VDKINQVCKN
LQFYLNKMKT		FEEPPFEKEA		NIIVDRWLDI		NEKTEDYYEN		LGRALALWDK
LFNLKNVIDE		WTEKALQKME		LHQLTEEDRE		RLKEELQVHE		QKTSEFSRRV
AEIQFLLQSS		EIPLELQVME		SSILNKMEHV		QKCLTGESNC		HALSGSTAEL
REDLDQAKTQ		IGMTESLLKA		LSPSDSLEIF		TKLEEIQQQI		LQQKHSMILL
ENQIGCLTPE		LSELKKQYES		VSDLFNTKKS		VLQDHFSKLL		NDQCKNFNDW
FSNIKVNLKE		CFESSETKKS		VEQKLQKLSD		FLTLEGRNSK		IKQVDSVLKH
VKKHLPKAHV		KELISWLVGQ		EFELEKMESI		CQARAKELED		SLQQLLRLQD
DHRNLRKWLT		NQEEKWKGME		EPGEKTELFC		QALARKREQF		ESVAQLNNSL
KEYGFTEEEE		IIMEATCLMD		RYQTLLRQLS		EIEEEDKLLP		TEDQSFNDLA
HDVIHWIKEI		KESLMVLNSS		EGKMPLEERI		QKIKEIILLK		PEGDARIETI
MKQAESSEAP		LVQKTLTDIS		NQWDNTLHLA		STYLSHQEKL		LLEGEKYLQS
KEDLRLMLIE		LKKKQEAGFA		LQHGLQEKKA		QLKIYKKFLK		KAQDLTSLLK
ELKSQGNYLL		ECTKNPSFSE		EPWLEIKHLH		ESLLQQLQDS		VQNLDGHVRE
HDSYQVCVTD		LNTTLDNFSK		EFVSFSDKPV		DQIAVEEKLQ		KLQELENRLS
LQDGTLKKIL		ALAKSVKQNT		SSVGQKIIKD		DIKSLQCKQK		DLENRLASAK
QEMECCLNSI		LKSKRSTEKK		GKFTLPGREK		QATSDVQEST		QESAAVEKLE
EDWEINKDSA		VEMAMSKQLS		LNAQESMKNT		EDERKVNELQ		NQPLELDTML
RNEQLEEIEK		LYTQLEAKKA		AIKPLEQTEC		LNKTETGALV		LHNIGYSAQH
LDNLLQALIT		LKKNKESQYC		VLRDFQEYLA		AVESSMKALL		TDKESLKVGP
LDSVTYLDKI		KKFIASIEKE		KDSLGNLKIK		WENLSNHVTD		MDKKLLESQI
KQLEHGWEQV		EQQIQKKYSQ		QVVEYDEFTT		LMNKVQDTEI		SLQQQQQHLQ
LRLKSPEERA		GNQSMIALTT		DLQATKHGFS		VLKGQAELQM		KRIWGEKEKK
NLEDGINNLK		KQWETLEPLH		LEAENQIKKC		DIRNKMKETI		LWAKNLLGEL
NPSIPLLPDD		ILSQIRKCKV		THDGILARQQ		SVESLAEEVK		DKVPSLTTYE
GSDLNNTLED		LRNQYQMLVL		KSTQRSQQLE		FKLEERSNFF		AIIRKFQLMV
QESETLIIPR		VETAATEAEL		KHHHVTLEAS		QKELQEIDSG		ISTHLQELTN
IYEELNVFER		LFLEDQLKNL		KIRTNRIQRF		IQNTCNEVEH		KIKFCRQFHE
KTSALQEEAD		SIQRNELLLN		QEVNKGVKEE		IYNLKDRLTA		IKCCILQVLK
LKKVFDYIGL		NWDFSQLDQL		QTQVFEKEKE		LEEKIKQLDT		FEEEHGKYQA
LLSKMRAIDL		QIKKMTEVVL		KAPDSSPESR		RLNAQILSQR		IEKAKCLCDE
IIKKLNENKT		FDDSFKEKEI		LQIKLNAEEN		DKLYKVLQNM		VLELSPKELD
EKNCQDKLET		SLHVLNQIKS		QLQQPLLINL		EIKHIQNEKD		NCEAFQEQVW
AEMCSIKAVT		AIEKQREENS		SEASDVETKL		REFEDLQMQL		NTSIDLRTNV
LNDAYENLTR		YKEAVTRAVE		SITSLEAIII		PYRVDVGNPE		ESLEMPLRKQ
EELESTVAHI		QDLTEKLGMI		SSPEAKLQLQ		YTLQELVSKN		SAMKEAFKAQ
ETEAERYLEN		YKCYRKMEED		IYTNLSKMET		VLGQSMSSLP		LSYREALERL
EQSKALVSNL		ISTKEELMKL		RQILRLLRLR		CTENDGICLL		KIVSALWEKW
LSLLEAAKEW		EMWCEELKQE		WKFVSEEIER		EAIILDNLQE		ELPEISKTKE
AATTEELSEL		LDCLCQYGEN		VEKQQLLLTL		LLQRIRSIQN		VPESSGAVET
VPAFQEITSM		KERCNKLLQK		VQKNKELVQT		EIQERHSFTK		EIIALKNFFQ
QTTTSFQNMA		FQDHPEKSEQ		FEELQSILKK		GKLTFENIME		KLRIKYSEMY
TIVPAEIESQ		VEECRKALED		IDEKISNEVL		KSSPSYAMRR		KIEEINNGLH
NVEKMLQQKS		KNIEKAQEIQ		KKMWDELDLW		HSKLNELDSE		VQDIVEQDPG
QAQEWMDNLM		IPFQQYQQVS		QRAECRTSQL		NKATVKMEEY		SDLLKSTEAW
IENTSHLLAN		PADYDSLRTL		SHHASTVQMA		LEDSEQKHNL		LHSIFMDLED
LSIIFETDEL		TQSIQELSNQ		VTALQQKIME		SLPQIQRMAD		DVVAIESEVK
SMEKRVSKIK		TILLSKEIFD		FSPEEHLKHG		EVILENIRPM		KKTIAEIVSY
QVELRLPQTG		MKPLPVFQRT		NQLLQDIKLL		ENVTQEQNEL		LKVVIKQTNE
WDEEIENLKQ		ILNNYSAQFS		LEHMSPDQAD		KLPQLQGEIE		RMEKQILSLN
QRKEDLLVDL		KATVLNLHQH		LKQEQEGVER		DRLPAVTSEE		GGVAERDASE
RKLNRRGSMS		YLAAVEEEVE		ESSVKSDNGD		EKAEPSPQSW		SSLWKHDKDM
EEDRASSSSG		TIVQEAYGKI		STSDNSMAQI		LTPDSLNTEQ		GPECSLRPNQ
TEEGTTPPIE		ADTLDSSDAQ		GGLEPRVEKT		RPEPTEVLHA		CKTQVAELEL
WLQQANVAVE		PETLNADMQQ		VLEQQLVGCQ		AMLTEIEHKV		AFLLETCKDQ
GLGDNGATQH		EAEALSLKLK		TVKCNLEKVQ		MMLQEKHSED		QHPTILKKSS
EPEHQEALQP		VNLSELESIV		TERPQFSRQK		DFQQQQVLEL		KPMEQKDFIK
FIEFNAKKMW		PQYCQHDNDT		TQESSASNQA		SSPENDVPDS		ILSPQGQNGD
KWQYLHHELS		SKIKLPLPQL		VEPQVSTNMG		ILPSVTMYNF		RYPTTEELKT
YTTQLEDLRQ		EASNLQTQEN		MTEEAYINLD		KKLFELFLTL		SQCLSSVEEM
LEMPRLYRED		GSGQQVHYET		LALELKKLYL		ALSDKKGDLL		KAMTWPGENT
NLLLECFDNL		QVCLEHTQAA		AVCRSKSLKA		GLDYNRSYQN		EIKRLYHQLI
KSKTSLQQSL		NEISGQSVAE		QLQKADAYTV		ELENAESRVA		KLRDEGERLH
LPYALLQEVY		KLEDVLDSMW		GMLRARYTEL		SSPFVTESQQ		DALLQGMVEL
VKIGKEKLAH		GHLKQTKSKV		ALQAQIENHK		VFFQKLVADM		LLIQAYSAKI
LPSLLQNRET		FWAEQVTEVK		ILEEKSRQCG		MKLQSLLQKW		EEFDENYASL
EKDLEILIST		LPSVSLVEET		EERLVERISF		YQQIKRNIGG		KHARLYQTLN
EGKQLVASVS		CPELEGQIAK		LEEQWLSLNK		KIDHELHRLQ		ALLKHLLSYN
RDSDQLTKWL		ESSQHTLNYW		KEQSLNVSQD		LDTIRSNINN		FFEFSKEVDE
KSSLKTAVIS		IGNQLLHLKE		TDTATLRASL		AQFEQKWTML		ITQLPDIQEK
LHQLQMEKLP		SRKAITEMIS		WMNNVEHQTS		DEDSVHSPSS		ASQVKHLLQK
HKEFRMEMDY		KQWIVDFVNQ		SLLQLSTCDV		ESKRYERTEF		AEHLGEMNRQ
WHRVHGMLNR		KIQHLEQLLE		SITESENKIQ		ILNNWLEAQE		ERLKTLQKPE
SVISVQKLLL		DCQDIENQLA		IKSKALDELK		QSYLTLESGA		VPLLEDTASR
IDELFQKRSS		VLTQVNQLKT		SMQSVLQEWK		IYDQLYDEVN		MMTIRFWYCM
EHSKPVVLSL		ETLRCQVENL		QSLQDEAESS		EGSWEKLQEV		IGKLKGLCPS
VAEIIEEKCQ		NTHKRWTQVN		QAIADQLQKA		QSLLQLWKAY		SNAHGEAAAR
LKQQEAKFQQ		LANISMSGNN		LAEILPPALQ		DIKELQHDVQ		KTKEAFLQNS
SVLDRLPQPA		ESSTHMLLPG		PLHSLQRAAY		LEKMLLVKAN		EFEFVLSQFK
DFGVRLESLK		GLIMHEEENL		DRLHQQEKEN		PDSFLNHVLA		LTAQSPDIEH
LNEVSLKLPL		SDVAVKTLQN		MNRQWIRATA		TALERCSELQ		GIGLNEKFLY
CCEKWIQLLE		KIEEALKVDV		ANSLPELLEQ		QKTYKMLEAE		VSINQTIADS
YVTQSLQLLD		TTEIENRPEF		ITEFSKLTDR		WQNAVQGVRQ		RKGDVDGLVR
QWQDFTTSVE		NLFRFLTDTS		HLLSAVKGQE		RFSLYQTRSL		IHELKNKEIH
FQRRRTTCAL		TLEAGEKLLL		TTDLKTKESV		GRRISQLQDS		WKDMEPQLAE
MIKQFQSTVE		TWDQCEKKIK		ELKSRLQVLK		AQSEDPLPEL		HEDLHNEKEL
IKELEQSLAS		WTQNLKELQT		MKADLTRHVL		VEDVMVLKEQ		IEHLHRQWED
LCLRVAIRKQ		EIEDRLNTWV		VFNEKNKELC		AWLVQMENKV		LQTADISIEE
MIEKLQKDCM		EEINLFSENK		LQLKQMGDQL		IKASNKSRAA		EIDDKLNKIN
DRWQHLFDVI		GSRVKKLKET		FAFIQQLDKN		MSNLRTWLAR		IESELSKPVV
YDVCDDQEIQ		KRLAEQQDLQ		RDIEQHSAGV		ESVFNICDVL		LHDSDACANE
TECDSIQQTT		RSLDRRWRNI		CAMSMERRMK		IEETWRLWQK		FLDDYSRFED
WLKSAERTAA		CPNSSEVLYT		SAKEELKRFE		AFQRQIHERL		TQLELINKQY
RRLARENRTD		TASRLKQMVH		EGNQRWDNLQ		RRVTAVLRRL		RHFTNQREEF
EGTRESILVW		LTEMDLQLTN		VEHFSESDAD		DKMRQLNGFQ		QEITLNTNKI
DQLIVFGEQL		IQKSEPLDAV		LIEDELEELH		RYCQEVFGRV		SRFHRRLTSC
TPGLEDEKEA		SENETDMEDP		REIQTDSWRK		RGESEEPSSP		QSLCHLVAPG
HERSGCETPV		SVDSIPLEWD		HTGDVGGSSS		HEEDEEGPYY		SALSGKSISD
GHSWHVPDSP		SCPEHHYKQM		EGDRNVPPVP		PASSTPYKPP		YGKLLLPPGT
DGGKEGPRVL		NGNPQQEDGG		LAGITEQQSG		AFDRWEMIQA		QELHNKLKIK
QNLQQLNSDI		SAITTWLKKT		EAELEMLKMA		KPPSDIQEIE		LRVKRLQEIL
KAFDTYKALV		VSVNVSSKEF		LQTESPESTE		LQSRLRQLSL		LWEAAQGAVD
SWRGGLRQSL		MQCQDFHQLS		QNLLLWLASA		KNRRQKAHVT		DPKADPRALL
ECRRELMQLE		KELVERQPQV		DMLQEISNSL		LIKGHGEDCI		EAEEKVHVIE
KKLKQLREQV		SQDLMALQGT		QNPASPLPSF		DEVDSGDQPP		ATSVPAPRAK
QFRAVRTTEG		EEETESRVPG		STRPQRSFLS		RVVRAALPLQ		LLLLLLLLLA
CLLPSSEEDY		SCTQANNFAR		SFYPMLRYTN		GPPPT

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з молекулою актину. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі, мембрані, мітохондрії, клітинних контактах, саркоплазматичному ретикулумі.

Література

• Zhang Q., Ragnauth C., Greener M.J., Shanahan C.M., Roberts R.G. (2002). The nesprins are giant actin-binding proteins, orthologous to Drosophila melanogaster muscle protein MSP-300. Genomics. 80: 473—481. PMID 12408964 DOI:10.1006/geno.2002.6859
• Rajgor D., Mellad J.A., Autore F., Zhang Q., Shanahan C.M. (2012). Multiple novel nesprin-1 and nesprin-2 variants act as versatile tissue-specific intracellular scaffolds. PLoS ONE. 7: E40098—E40098. PMID 22768332 DOI:10.1371/journal.pone.0040098
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Schirmer E.C., Florens L., Guan T., Yates J.R. III, Gerace L. (2003). Nuclear membrane proteins with potential disease links found by subtractive proteomics. Science. 301: 1380—1382. PMID 12958361 DOI:10.1126/science.1088176
• Stewart-Hutchinson P.J., Hale C.M., Wirtz D., Hodzic D. (2008). Structural requirements for the assembly of LINC complexes and their function in cellular mechanical stiffness. Exp. Cell Res. 314: 1892—1905. PMID 18396275 DOI:10.1016/j.yexcr.2008.02.022
• Luxton G.W., Gomes E.R., Folker E.S., Vintinner E., Gundersen G.G. (2010). Linear arrays of nuclear envelope proteins harness retrograde actin flow for nuclear movement. Science. 329: 956—959. PMID 20724637 DOI:10.1126/science.1189072

Див. також

• Хромосома 14