SYDE1

SYDE1 (англ. Synapse defective Rho GTPase homolog 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 735 амінокислот, а молекулярна маса — 79 793.

SYDE1
Ідентифікатори
Символи	SYDE1, 7h3, SYD1, synapse defective Rho GTPase homolog 1
Зовнішні ІД	OMIM: 617377 MGI: 1918959 HomoloGene: 13195 GeneCards: SYDE1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0005097, GO:0005099, GO:0005100 GTPase activator activity Клітинна компонента • гіалоплазма • цитоплазма Біологічний процес • regulation of small GTPase mediated signal transduction • GO:0032861, GO:0032862, GO:0032856 activation of GTPase activity • GO:0043087, GO:0032313, GO:0032319, GO:0032314, GO:0043088 regulation of GTPase activity • GO:0072468 сигнальна трансдукція • regulation of cytoskeleton organization • positive regulation of trophoblast cell migration Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	85360	71709
Ensembl	ENSG00000105137	ENSMUSG00000032714
UniProt	Q6ZW31	Q9DBZ9
RefSeq (мРНК)	NM_033025 NM_001300910	NM_027875
RefSeq (білок)	NP_001287839 NP_149014	NP_082151
Локус (UCSC)	Хр. 19: 15.11 – 15.11 Mb	Хр. 10: 78.42 – 78.43 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAEPLLRKTF		SRLRGREKLP		RKKSDAKERG		HPAQRPEPSP		PEPEPQAPEG
SQAGAEGPSS		PEASRSPARG		AYLQSLEPSS		RRWVLGGAKP		AEDTSLGPGV
PGTGEPAGEI		WYNPIPEEDP		RPPAPEPPGP		QPGSAESEGL		APQGAAPASP
PTKASRTKSP		GPARRLSIKM		KKLPELRRRL		SLRGPRAGRE		RERAAPAGSV
ISRYHLDSSV		GGPGPAAGPG		GTRSPRAGYL		SDGDSPERPA		GPPSPTSFRP
YEVGPAARAP		PAALWGRLSL		HLYGLGGLRP		APGATPRDLC		CLLQVDGEAR
ARTGPLRGGP		DFLRLDHTFH		LELEAARLLR		ALVLAWDPGV		RRHRPCAQGT
VLLPTVFRGC		QAQQLAVRLE		PQGLLYAKLT		LSEQQEAPAT		AEPRVFGLPL
PLLVERERPP		GQVPLIIQKC		VGQIERRGLR		VVGLYRLCGS		AAVKKELRDA
FERDSAAVCL		SEDLYPDINV		ITGILKDYLR		ELPTPLITQP		LYKVVLEAMA
RDPPNRVPPT		TEGTRGLLSC		LPDVERATLT		LLLDHLRLVS		SFHAYNRMTP
QNLAVCFGPV		LLPARQAPTR		PRARSSGPGL		ASAVDFKHHI		EVLHYLLQSW
PDPRLPRQSP		DVAPYLRPKR		QPPLHLPLAD		PEVVTRPRGR		GGPESPPSNR
YAGDWSVCGR		DFLPCGRDFL		SGPDYDHVTG		SDSEDEDEEV		GEPRVTGDFE
DDFDAPFNPH		LNLKDFDALI		LDLERELSKQ		INVCL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів гтфаз, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 19