SUPT20H

SUPT20H (англ. SPT20 homolog, SAGA complex component) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 13-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 779 амінокислот, а молекулярна маса — 85 789.

SUPT20H
Ідентифікатори
Символи	SUPT20H, C13, C13orf19, FAM48A, P38IP, SPT20, FP757, SPT20 homolog, SAGA complex component
Зовнішні ІД	OMIM: 613417 HomoloGene: 133929 GeneCards: SUPT20H
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001104 transcription coregulator activity Клітинна компонента • SAGA-type complex • SAGA complex • клітинне ядро • fibrillar center Біологічний процес • автофагія • multicellular organism development • гаструляція • regulation of nucleic acid-templated transcription • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	55578	568453
Ensembl	ENSG00000102710	ENSDARG00000078658
UniProt	Q8NEM7	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_001014286 NM_001278480 NM_001278481 NM_001278482 NM_017569	XM_001921561 XM_005172732 XM_005172733 XM_005172734
RefSeq (білок)	NP_001014308 NP_001265409 NP_001265410 NP_001265411 NP_060039	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 13: 37.01 – 37.06 Mb	н/д
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MQQALELALD		RAEYVIESAR		QRPPKRKYLS		SGRKSVFQKL		YDLYIEECEK
EPEVKKLRRN		VNLLEKLVMQ		ETLSCLVVNL		YPGNEGYSLM		LRGKNGSDSE
TIRLPYEEGE		LLEYLDAEEL		PPILVDLLEK		SQVNIFHCGC		VIAEIRDYRQ
SSNMKSPGYQ		SRHILLRPTM		QTLICDVHSI		TSDNHKWTQE		DKLLLESQLI
LATAEPLCLD		PSIAVTCTAN		RLLYNKQKMN		TRPMKRCFKR		YSRSSLNRQQ
DLSHCPPPPQ		LRLLDFLQKR		KERKAGQHYD		LKISKAGNCV		DMWKRSPCNL
AIPSEVDVEK		YAKVEKSIKS		DDSQPTVWPA		HDVKDDYVFE		CEAGTQYQKT
KLTILQSLGD		PLYYGKIQPC		KADEESDSQM		SPSHSSTDDH		SNWFIIGSKT
DAERVVNQYQ		ELVQNEAKCP		VKMSHSSSGS		ASLSQVSPGK		ETDQTETVSV
QSSVLGKGVK		HRPPPIKLPS		SSGNSSSGNY		FTPQQTSSFL		KSPTPPPSSK
PSSIPRKSSV		DLNQVSMLSP		AALSPASSSQ		RTTATQVMAN		SAGLNFINVV
GSVCGAQALM		SGSNPMLGCN		TGAITPAGIN		LSGLLPSGGL		LPNALPSAMQ
AASQAGVPFG		LKNTSSLRPL		NLLQLPGGSL		IFNTLQQQQQ		QLSQFTPQQP
QQPTTCSPQQ		PGEQGSEQGS		TSQEQALSAQ		QAAVINLTGV		GSFMQSQAAV
LSQLGSAENR		PEQSLPQQRF		QLSSAFQQQQ		QQIQQLRFLQ		HQMAMAAAAA
QTAQLHHHRH		TGSQSKSKMK		RGTPTTPKF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як автофагія, гаструляція, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Webber J.L., Tooze S.A. (2010). Coordinated regulation of autophagy by p38alpha MAPK through mAtg9 and p38IP. EMBO J. 29: 27—40. PMID 19893488 DOI:10.1038/emboj.2009.321

Див. також

• Хромосома 13