STX6

STX6
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2NPS, 4J2C
Ідентифікатори
Символи	STX6, syntaxin 6
Зовнішні ІД	OMIM: 603944 MGI: 1926235 HomoloGene: 115622 GeneCards: STX6
Пов'язані генетичні захворювання
	progressive supranuclear palsy
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • syntaxin binding; • SNAP receptor activity; • SNARE binding;
Клітинна компонента	• мембрана; • клітинна мембрана; • SNARE complex; • early endosome; • phagocytic vesicle; • perinuclear region of cytoplasm; • clathrin-coated vesicle; • trans-Golgi network; • integral component of membrane; • Golgi membrane; • trans-Golgi network membrane; • комплекс Ґольджі; • нуклеоплазма; • гіалоплазма; • Синаптичні бульбашки; • integral component of synaptic vesicle membrane; • система ендомембран;
Біологічний процес	• endosome organization; • regulation of protein localization; • vesicle docking; • retrograde transport, endosome to Golgi; • Golgi vesicle transport; • protein transport; • vesicle fusion; • Golgi ribbon formation; • vesicle-mediated transport; • intracellular protein transport; • endocytic recycling; • synaptic vesicle to endosome fusion;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	10228
	58244
	ENSG00000135823
	ENSMUSG00000026470
	O43752
	Q9JKK1
	NM_001286210; NM_005819
	NM_021433
	NP_001273139; NP_005810
	NP_067408
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

STX6 (англ. Syntaxin 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 255 амінокислот, а молекулярна маса — 29 176^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSMEDPFFVV	KGEVQKAVNT	AQGLFQRWTE	LLQDPSTATR	EEIDWTTNEL
RNNLRSIEWD	LEDLDETISI	VEANPRKFNL	DATELSIRKA	FITSTRQVVR
DMKDQMSTSS	VQALAERKNR	QALLGDSGSQ	NWSTGTTDKY	GRLDRELQRA
NSHFIEEQQA	QQQLIVEQQD	EQLELVSGSI	GVLKNMSQRI	GGELEEQAVM
LEDFSHELES	TQSRLDNVMK	KLAKVSHMTS	DRRQWCAIAI	LFAVLLVVLI
LFLVL

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт, транспорт білків, ацетиляція. Локалізований у мембрані, апараті гольджі.

Література ред.

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Charest A., Lane K., McMahon K., Housman D.E. (2001). Association of a novel PDZ domain-containing peripheral Golgi protein with the Q-SNARE (Q-soluble N-ethylmaleimide-sensitive fusion protein (NSF) attachment protein receptor) protein syntaxin 6. J. Biol. Chem. 276: 29456—29465. PMID 11384996 DOI:10.1074/jbc.M104137200
Martin-Martin B., Nabokina S.M., Lazo P.A., Mollinedo F. (1999). Co-expression of several human syntaxin genes in neutrophils and differentiating HL-60 cells: variant isoforms and detection of syntaxin 1. J. Leukoc. Biol. 65: 397—406. PMID 10080545