STX16

STX16 (англ. Syntaxin 16) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 325 амінокислот, а молекулярна маса — 37 031.

STX16
Ідентифікатори
Символи	STX16, SYN16, syntaxin 16, SYN-16
Зовнішні ІД	OMIM: 603666 MGI: 1923396 HomoloGene: 2791 GeneCards: STX16
Онтологія гена Молекулярна функція • SNAP receptor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • syntaxin binding • SNARE binding Клітинна компонента • цитоплазма • integral component of membrane • комплекс Ґольджі • мембрана • внутрішньоклітинна мембранна органела • Golgi cisterna • focal adhesion • trans-Golgi network • SNARE complex • ендоплазматичний ретикулум • perinuclear region of cytoplasm • гіалоплазма • trans-Golgi network membrane • Golgi membrane • система ендомембран • integral component of synaptic vesicle membrane Біологічний процес • vesicle docking • retrograde transport, endosome to Golgi • protein transport • intracellular protein transport • vesicle fusion • Golgi ribbon formation • vesicle-mediated transport • GO:0015915 транспорт Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	8675	228960
Ensembl	ENSG00000124222	ENSMUSG00000027522
UniProt	O14662	Q8BVI5
RefSeq (мРНК)	NM_001001433 NM_001001434 NM_001134772 NM_001134773 NM_001204868 NM_003763	NM_001102423 NM_001102424 NM_001102425 NM_172675 NM_001363029 NM_001363030 NM_001363031
RefSeq (білок)	NP_001001433 NP_001128244 NP_001128245 NP_001191797 NP_003754	NP_001095893 NP_001095894 NP_001095895 NP_766263 NP_001349958 NP_001349959 NP_001349960
Локус (UCSC)	Хр. 20: 58.65 – 58.68 Mb	Хр. 2: 173.92 – 173.94 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MATRRLTDAF		LLLRNNSIQN		RQLLAEQVSS		HITSSPLHSR		SIAAELDELA
DDRMALVSGI		SLDPEAAIGV		TKRPPPKWVD		GVDEIQYDVG		RIKQKMKELA
SLHDKHLNRP		TLDDSSEEEH		AIEITTQEIT		QLFHRCQRAV		QALPSRARAC
SEQEGRLLGN		VVASLAQALQ		ELSTSFRHAQ		SGYLKRMKNR		EERSQHFFDT
SVPLMDDGDD		NTLYHRGFTE		DQLVLVEQNT		LMVEEREREI		RQIVQSISDL
NEIFRDLGAM		IVEQGTVLDR		IDYNVEQSCI		KTEDGLKQLH		KAEQYQKKNR
KMLVILILFV		IIIVLIVVLV		GVKSR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, мембрані, апараті гольджі.

Література

• Tang B.L., Low D.Y.H., Lee S.S., Tan A.E.H., Ho W. (1998). Molecular cloning and localization of human syntaxin 16, a member of the syntaxin family of SNARE proteins. Biochem. Biophys. Res. Commun. 242: 673—679. PMID 9464276 DOI:10.1006/bbrc.1997.8029
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Linglart A., Gensure R.C., Olney R.C., Jueppner H., Bastepe M. (2005). A novel STX16 deletion in autosomal dominant pseudohypoparathyroidism type Ib redefines the boundaries of a cis-acting imprinting control element of GNAS. Am. J. Hum. Genet. 76: 804—814. PMID 15800843 DOI:10.1086/429932
• Ganley I.G., Espinosa E., Pfeffer S.R. (2008). A syntaxin 10-SNARE complex distinguishes two distinct transport routes from endosomes to the trans-Golgi in human cells. J. Cell Biol. 180: 159—172. PMID 18195106 DOI:10.1083/jcb.200707136
• Simonsen A., Bremnes B., Ronning E., Aasland R., Stenmark H. (1998). Syntaxin-16, a putative Golgi t-SNARE. Eur. J. Cell Biol. 75: 223—231. PMID 9587053

Див. також

• Хромосома 20