STBD1

STBD1
Ідентифікатори
Символи	STBD1, GENEX3414, GENX-3414, starch binding domain 1
Зовнішні ІД	OMIM: 607406 MGI: 1261768 HomoloGene: 2929 GeneCards: STBD1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• крохмалеве зв’язування; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • carbohydrate binding; • enzyme binding; • polysaccharide binding; • glycogen binding;
Клітинна компонента	• perinuclear region of cytoplasm; • integral component of membrane; • phagophore assembly site membrane; • endoplasmic reticulum membrane; • внутрішньоклітинний; • ендоплазматичний ретикулум; • гіалоплазма; • клітинна мембрана; • integral component of plasma membrane; • мембрана; • T-tubule; • tertiary granule membrane; • ficolin-1-rich granule membrane;
Біологічний процес	• glycogen metabolic process; • автофагія; • Глікогеноліз; • glycophagy; • neutrophil degranulation; • intracellular transport; • carbohydrate metabolic process;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	8987
	52331
	ENSG00000118804
	ENSMUSG00000047963
	O95210
	Q8C7E7
	NM_003943
	NM_175096
	NP_003934
	NP_780305
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

STBD1 (англ. Starch binding domain 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 4-й хромосомі.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 358 амінокислот, а молекулярна маса — 39 007^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGAVWSALLV	GGGLAGALFV	WLLRGGPGDT	GKDGDAEQEK	DAPLGGAAIP
GGHQSGSSGL	SPGPSGQELV	TKPEHLQESN	GHLISKTKDL	GKLQAASWRL
QNPSREVCDN	SREHVPSGQF	PDTEAPATSE	TSNSRSYSEV	SRNESLESPM
GEWGFQKGQE	ISAKAATCFA	EKLPSSNLLK	NRAKEEMSLS	DLNSQDRVDH
EEWEMVPRHS	SWGDVGVGGS	LKAPVLNLNQ	GMDNGRSTLV	EARGQQVHGK
MERVAVMPAG	SQQVSVRFQV	HYVTSTDVQF	IAVTGDHECL	GRWNTYIPLH
YNKDGFWSHS	IFLPADTVVE	WKFVLVENGG	VTRWEECSNR	FLETGHEDKV
VHAWWGIH

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як автофагія, вуглеводний обмін, метаболізм глікогену. Локалізований у мембрані, ендоплазматичному ретикулумі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Jiang S., Wells C.D., Roach P.J. (2011). Starch-binding domain-containing protein 1 (Stbd1) and glycogen metabolism: Identification of the Atg8 family interacting motif (AIM) in Stbd1 required for interaction with GABARAPL1. Biochem. Biophys. Res. Commun. 413: 420—425. PMID 21893048 DOI:10.1016/j.bbrc.2011.08.106
Zhu Y., Zhang M., Kelly A.R., Cheng A. (2014). The carbohydrate-binding domain of overexpressed STBD1 is important for its stability and protein-protein interactions. Biosci. Rep. 34: —. PMID 24837458 DOI:10.1042/BSR20140053
Janecek S. (2002). A motif of a microbial starch-binding domain found in human genethonin. Bioinformatics. 18: 1534—1537. PMID 12424126 DOI:10.1093/bioinformatics/18.11.1534

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:24854 (англ.) . Процитовано 18 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, O95210 (англ.) . Архів оригіналу за 14 лютого 2018. Процитовано 18 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 4

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:24854 (англ.) . Процитовано 18 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, O95210 (англ.) . Архів оригіналу за 14 лютого 2018. Процитовано 18 вересня 2017.

[3]

[4]

[1]

[2]