STAU1

STAU1 (англ. Staufen double-stranded RNA binding protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 577 амінокислот, а молекулярна маса — 63 182.

STAU1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4DKK
Ідентифікатори
Символи	STAU1, PPP1R150, STAU, staufen double-stranded RNA binding protein 1
Зовнішні ІД	OMIM: 601716 MGI: 1338864 HomoloGene: 3384 GeneCards: STAU1
Онтологія гена Молекулярна функція • protein phosphatase 1 binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • double-stranded RNA binding • RNA binding Клітинна компонента • цитоплазма • cell body • rough endoplasmic reticulum • мембрана • клітинна мембрана • microtubule associated complex • neuronal cell body • дендрит (нейробіологія) • ендоплазматичний ретикулум • cytoplasmic ribonucleoprotein granule • neuron projection • cytoplasmic stress granule • екзосома • гіалоплазма • glutamatergic synapse Біологічний процес • positive regulation of long-term synaptic potentiation • positive regulation by virus of viral protein levels in host cell • cellular response to oxidative stress • positive regulation of viral genome replication • modulation of chemical synaptic transmission • modification of postsynaptic structure • GO:0022415 viral process Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6780	20853
Ensembl	ENSG00000124214	ENSMUSG00000039536
UniProt	O95793	Q9Z108
RefSeq (мРНК)	NM_001037328 NM_004602 NM_017452 NM_017453 NM_017454 NM_001319134 NM_001319135 NM_001322927 NM_001322928 NM_001322929 NM_001322930 NM_001322931 NM_001322932 NM_001322933	NM_001109905 NM_001109906 NM_001291160 NM_011490
RefSeq (білок)	NP_001032405 NP_001306063 NP_001306064 NP_001309856 NP_001309857 NP_001309858 NP_001309859 NP_001309860 NP_001309861 NP_001309862 NP_004593 NP_059346 NP_059347 NP_059348	NP_001103375 NP_001103376 NP_001278089 NP_035620
Локус (UCSC)	Хр. 20: 49.11 – 49.19 Mb	Хр. 2: 166.79 – 166.84 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSQVQVQVQN		PSAALSGSQI		LNKNQSLLSQ		PLMSIPSTTS		SLPSENAGRP
IQNSALPSAS		ITSTSAAAES		ITPTVELNAL		CMKLGKKPMY		KPVDPYSRMQ
STYNYNMRGG		AYPPRYFYPF		PVPPLLYQVE		LSVGGQQFNG		KGKTRQAAKH
DAAAKALRIL		QNEPLPERLE		VNGRESEEEN		LNKSEISQVF		EIALKRNLPV
NFEVARESGP		PHMKNFVTKV		SVGEFVGEGE		GKSKKISKKN		AAIAVLEELK
KLPPLPAVER		VKPRIKKKTK		PIVKPQTSPE		YGQGINPISR		LAQIQQAKKE
KEPEYTLLTE		RGLPRRREFV		MQVKVGNHTA		EGTGTNKKVA		KRNAAENMLE
ILGFKVPQAQ		PTKPALKSEE		KTPIKKPGDG		RKVTFFEPGS		GDENGTSNKE
DEFRMPYLSH		QQLPAGILPM		VPEVAQAVGV		SQGHHTKDFT		RAAPNPAKAT
VTAMIARELL		YGGTSPTAET		ILKNNISSGH		VPHGPLTRPS		EQLDYLSRVQ
GFQVEYKDFP		KNNKNEFVSL		INCSSQPPLI		SHGIGKDVES		CHDMAALNIL
KLLSELDQQS		TEMPRTGNGP		MSVCGRC

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі, ендоплазматичному ретикулумі.

Література

• Wickham L., Duchaine T., Luo M., Nabi I.R., DesGroseillers L. (1999). Mammalian Staufen is a double-stranded-RNA- and tubulin-binding protein which localizes to the rough endoplasmic reticulum. Mol. Cell. Biol. 19: 2220—2230. PMID 10022909 DOI:10.1128/MCB.19.3.2220
• Falcon A.M., Fortes P., Marion R.M., Beloso A., Ortin J. (1999). Interaction of influenza virus NS1 protein and the human homologue of Staufen in vivo and in vitro. Nucleic Acids Res. 27: 2241—2247. PMID 10325410 DOI:10.1093/nar/27.11.2241
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 20