SSC5D

SSC5D
Ідентифікатори
Символи	SSC5D, S5D-SRCRB, scavenger receptor cysteine rich family member with 5 domains
Зовнішні ІД	OMIM: 618194 MGI: 3606211 HomoloGene: 77555 GeneCards: SSC5D
Онтологія гена
Молекулярна функція	• extracellular matrix binding; • fibronectin binding; • scavenger receptor activity; • laminin binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding;
Клітинна компонента	• extracellular region; • GO:0005578 Позаклітинна матриця; • мембрана; • цитоплазма; • внутрішньоклітинний; • міжклітинний простір; • external side of plasma membrane; • collagen-containing extracellular matrix;
Біологічний процес	• multicellular organism development; • вроджений імунітет; • GO:0051637 defense response to Gram-positive bacterium; • рецептор-опосередкований ендоцитоз; • GO:0051636 defense response to Gram-negative bacterium; • процес імунної системи; • defense response; • detection of bacterial lipoprotein; • vesicle-mediated transport; • ендоцитоз;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	284297
	269855
	ENSG00000179954
	ENSMUSG00000035279
	A1L4H1
	Q8BV57
	NM_001144950; NM_001195267; NM_182571
	NM_173008
	NP_001138422; NP_001182196
	NP_766596
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

SSC5D (англ. Scavenger receptor cysteine rich family member with 5 domains) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на довгому плечі 19-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 573 амінокислот, а молекулярна маса — 165 743^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MRVLACLLAA	LVGIQAVERL	RLADGPHGCA	GRLEVWHGGR	WGTVCDDGWD
LRDAAVACRQ	LGCGGALAAP	GGAFFGEGAG	PVWLSELACR	GNEGQLGLCH
HRGWKAHICS	HEEDAGVVCA	GQRVANSRDD	STSPLDGAPW	PGLLLELSPS
TEEPLVTHAP	RPAGNPQNAS	RKKSPRPKQA	KSTRAPLLTT	GAPRQERLRL
VSGPHRCAGR	LEVWHGGRWG	TVCDDGWDLR	DAAVACRELG	CGGALAAPGG
ARFGPGAGPV	WMDDVGCGGG	EQALRDCPRS	PWGRSNCDHS	EDAGLVCTGP
APRLRLADGP	HGCAGRLEVW	HGGRWGSVCD	DAWDLRDAAV	ACRELGCGGA
LAAPGGAFFG	EGSGPIILDD	LRCRGNETAL	RFCPARPWGQ	HDCHHREDAG
AVCDGMPLGY	VPPTAPTDSN	NSTPREAASR	PPSTMTSQAP	GTAGVSPPPA
SPTVLWEPGP	EAGSPQLRLV	AGPSKCSGRL	EVWHDQRWGT	VCDDSWDMRD
SAVVCRELGC	GGPQQPDPAA	GRFGWGAGPI	WLDDVGCVGT	EASLSDCPAA
PWGKHNCAHN	EDVGVTCTGP	PGLDSISDPF	SWSWIPGLGR	DRDAWLPGEL
ATKPSASVTA	SVLEKTTTKA	PGKMPKSTKK	WVTKNAKRPT	TQPPVMPTTK
HSRAQSPPDL	TSQTTAALTT	EASRRPTSEF	TRRPTTEAPQ	RWTSHTTATL
TPQAPRERTT	KTMAMLTTQG	PQEMTSESTI	KSIPQASLEP	SAEIPEGSPE
SPKDPAPSPS	VSTTGESGLF	RVRLADGPNR	CAGRLEVWHA	GRWGTVCDDN
WDLRDATVAC	WELGCGKVRP	RVGKTHYGPG	TGPIWLDDMG	CKGSEASLSD
CPSGAWGKHN	CDHEEDVGLT	CTGYTDYDDY	PPWTWDPTSR	EDLAKGTTTA
GVPGHTLPWR	TTRRPGSSSP	AIRRLPDTGS	KDGYKLPWTW	DTPSGRGLAE
GTPTAGKLGP	TLGAGTTRSP	GSPPTLRVHG	DTGSPRKPWP	ERRPPRPAAT
RTAPPTPSPG	PSASPGPPGP	ALTSDSSREL	TPHSALTSEA	TSDAPDTSPP
TPDPASRTNP	DLILTSPDFA	LSTPDSSVVP	ALTPEPSPTP	LPTLPKELTS
DPSTPSEVTS	LSPTSEQVPE	SDTTPDLDTT	PYSSTVSEYS	RSPDPSPSPH
PTTTPDPTMA	PDPITTLNPT	VTPHFPTTPH	PTTTPHPTTI	THSTMIPDPT
TTPQPFTTIT	HSTMIPDPTT	TPQPFTTMQP	TTTPHSTTPH	PTTTPHPTTI
THSTMIPDPT	TTPQPFTTMQ	PTTMPHPTTT	PHPTTTPHPT	TTPHPTTTPH
PTMTPDPTTT	PYPTTTPDPT	TTPHPTTPDP	SSTPVITTVS	LPTSLGTELS
SPTLAPTVKP	SLHPQLTFTA	PAPHTSTSQI	PTLEPSPALE	SSPSRSSTAT
SMDPLSTEDF	KPPRSQSPNL	TPPPTHTPHS	ASDLTVSPDP	LLSPTAHPLD
HPPLDPLTLG	PTPGQSPGPH	GPCVAPTPPV	RVMACEPPAL	VELVAAVRDV
GGQLQRLTQV	VEQERQERQA	LLLGLTQLVE	AARGLGQLGE	AVKRLAEMAW
TTSMPAPTTT	TPEEEERPLR	GDV

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, вроджений імунітет, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі. Також секретований назовні.

Література ред.

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки ред.

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:26641 (англ.) . Процитовано 21 вересня 2017.
↑ UniProt, A1L4H1 (англ.) . Архів оригіналу за 23 серпня 2016. Процитовано 21 вересня 2017.

Див. також ред.

Хромосома 19

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:26641 (англ.) . Процитовано 21 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, A1L4H1 (англ.) . Архів оригіналу за 23 серпня 2016. Процитовано 21 вересня 2017.

[3]

[4]

[1]

[2]