SRRM2
білок-кодуючий ген Homo Sapiens
SRRM2 (англ. Serine/arginine repetitive matrix 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми. [2] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 752 амінокислот, а молекулярна маса — 299 615[3].
SRRM2 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | SRRM2, 300-KD, CWF21, Cwc21, SRL300, SRm300, HSPC075, serine/arginine repetitive matrix 2 | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 606032 HomoloGene: 130678 GeneCards: SRRM2 | ||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
|
|||||||||||||||
Ensembl |
|
|
|||||||||||||||
UniProt |
|
|
|||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 16: 2.75 – 2.77 Mb | н/д | |||||||||||||||
PubMed search | [1] | н/д | |||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
Послідовність амінокислот
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MYNGIGLPTP | RGSGTNGYVQ | RNLSLVRGRR | GERPDYKGEE | ELRRLEAALV | ||||
KRPNPDILDH | ERKRRVELRC | LELEEMMEEQ | GYEEQQIQEK | VATFRLMLLE | ||||
KDVNPGGKEE | TPGQRPAVTE | THQLAELNEK | KNERLRAAFG | ISDSYVDGSS | ||||
FDPQRRAREA | KQPAPEPPKP | YSLVRESSSS | RSPTPKQKKK | KKKKDRGRRS | ||||
ESSSPRRERK | KSSKKKKHRS | ESESKKRKHR | SPTPKSKRKS | KDKKRKRSRS | ||||
TTPAPKSRRA | HRSTSADSAS | SSDTSRSRSR | SAAAKTHTTA | LAGRSPSPAS | ||||
GRRGEGDAPF | SEPGTTSTQR | PSSPETATKQ | PSSPYEDKDK | DKKEKSATRP | ||||
SPSPERSSTG | PEPPAPTPLL | AERHGGSPQP | LATTPLSQEP | VNPPSEASPT | ||||
RDRSPPKSPE | KLPQSSSSES | SPPSPQPTKV | SRHASSSPES | PKPAPAPGSH | ||||
REISSSPTSK | NRSHGRAKRD | KSHSHTPSRR | MGRSRSPATA | KRGRSRSRTP | ||||
TKRGHSRSRS | PQWRRSRSAQ | RWGRSRSPQR | RGRSRSPQRP | GWSRSRNTQR | ||||
RGRSRSARRG | RSHSRSPATR | GRSRSRTPAR | RGRSRSRTPA | RRRSRSRTPT | ||||
RRRSRSRTPA | RRGRSRSRTP | ARRRSRTRSP | VRRRSRSRSP | ARRSGRSRSR | ||||
TPARRGRSRS | RTPARRGRSR | SRTPARRSGR | SRSRTPARRG | RSRSRTPRRG | ||||
RSRSRSLVRR | GRSHSRTPQR | RGRSGSSSER | KNKSRTSQRR | SRSNSSPEMK | ||||
KSRISSRRSR | SLSSPRSKAK | SRLSLRRSLS | GSSPCPKQKS | QTPPRRSRSG | ||||
SSQPKAKSRT | PPRRSRSSSS | PPPKQKSKTP | SRQSHSSSSP | HPKVKSGTPP | ||||
RQGSITSPQA | NEQSVTPQRR | SCFESSPDPE | LKSRTPSRHS | CSGSSPPRVK | ||||
SSTPPRQSPS | RSSSPQPKVK | AIISPRQRSH | SGSSSPSPSR | VTSRTTPRRS | ||||
RSVSPCSNVE | SRLLPRYSHS | GSSSPDTKVK | PETPPRQSHS | GSISPYPKVK | ||||
AQTPPGPSLS | GSKSPCPQEK | SKDSLVQSCP | GSLSLCAGVK | SSTPPGESYF | ||||
GVSSLQLKGQ | SQTSPDHRSD | TSSPEVRQSH | SESPSLQSKS | QTSPKGGRSR | ||||
SSSPVTELAS | RSPIRQDRGE | FSASPMLKSG | MSPEQSRFQS | DSSSYPTVDS | ||||
NSLLGQSRLE | TAESKEKMAL | PPQEDATASP | PRQKDKFSPF | PVQDRPESSL | ||||
VFKDTLRTPP | RERSGAGSSP | ETKEQNSALP | TSSQDEELME | VVEKSEEPAG | ||||
QILSHLSSEL | KEMSTSNFES | SPEVEERPAV | SLTLDQSQSQ | ASLEAVEVPS | ||||
MASSWGGPHF | SPEHKELSNS | PLRENSFGSP | LEFRNSGPLG | TEMNTGFSSE | ||||
VKEDLNGPFL | NQLETDPSLD | MKEQSTRSSG | HSSSELSPDA | VEKAGMSSNQ | ||||
SISSPVLDAV | PRTPSRERSS | SASSPEMKDG | LPRTPSRRSR | SGSSPGLRDG | ||||
SGTPSRHSLS | GSSPGMKDIP | RTPSRGRSEC | DSSPEPKALP | QTPRPRSRSP | ||||
SSPELNNKCL | TPQRERSGSE | SSVDQKTVAR | TPLGQRSRSG | SSQELDVKPS | ||||
ASPQERSESD | SSPDSKAKTR | TPLRQRSRSG | SSPEVDSKSR | LSPRRSRSGS | ||||
SPEVKDKPRA | APRAQSGSDS | SPEPKAPAPR | ALPRRSRSGS | SSKGRGPSPE | ||||
GSSSTESSPE | HPPKSRTARR | GSRSSPEPKT | KSRTPPRRRS | SRSSPELTRK | ||||
ARLSRRSRSA | SSSPETRSRT | PPRHRRSPSV | SSPEPAEKSR | SSRRRRSASS | ||||
PRTKTTSRRG | RSPSPKPRGL | QRSRSRSRRE | KTRTTRRRDR | SGSSQSTSRR | ||||
RQRSRSRSRV | TRRRRGGSGY | HSRSPARQES | SRTSSRRRRG | RSRTPPTSRK | ||||
RSRSRTSPAP | WKRSRSRASP | ATHRRSRSRT | PLISRRRSRS | RTSPVSRRRS | ||||
RSRTSVTRRR | SRSRASPVSR | RRSRSRTPPV | TRRRSRSRTP | TTRRRSRSRT | ||||
PPVTRRRSRS | RTPPVTRRRS | RSRTSPITRR | RSRSRTSPVT | RRRSRSRTSP | ||||
VTRRRSRSRT | SPVTRRRSRS | RTPPAIRRRS | RSRTPLLPRK | RSRSRSPLAI | ||||
RRRSRSRTPR | TARGKRSLTR | SPPAIRRRSA | SGSSSDRSRS | ATPPATRNHS | ||||
GSRTPPVALN | SSRMSCFSRP | SMSPTPLDRC | RSPGMLEPLG | SSRTPMSVLQ | ||||
QAGGSMMDGP | GPRIPDHQRT | SVPENHAQSR | IALALTAISL | GTARPPPSMS | ||||
AAGLAARMSQ | VPAPVPLMSL | RTAPAANLAS | RIPAASAAAM | NLASARTPAI | ||||
PTAVNLADSR | TPAAAAAMNL | ASPRTAVAPS | AVNLADPRTP | TAPAVNLAGA | ||||
RTPAALAALS | LTGSGTPPTA | ANYPSSSRTP | QAPASANLVG | PRSAHATAPV | ||||
NIAGSRTAAA | LAPASLTSAR | MAPALSGANL | TSPRVPLSAY | ERVSGRTSPP | ||||
LLDRARSRTP | PSAPSQSRMT | SERAPSPSSR | MGQAPSQSLL | PPAQDQPRSP | ||||
VPSAFSDQSR | CLIAQTTPVA | GSQSLSSGAV | ATTTSSAGDH | NGMLSVPAPG | ||||
VPHSDVGEPP | ASTGAQQPSA | LAALQPAKER | RSSSSSSSSS | SSSSSSSSSS | ||||
SSSSSSGSSS | SDSEGSSLPV | QPEVALKRVP | SPTPAPKEAV | REGRPPEPTP | ||||
AKRKRRSSSS | SSSSSSSSSS | SSSSSSSSSS | SSSSSSSSSS | SSSSSSSSPS | ||||
PAKPGPQALP | KPASPKKPPP | GERRSRSPRK | PIDSLRDSRS | LSYSPVERRR | ||||
PSPQPSPRDQ | QSSSSERGSR | RGQRGDSRSP | SHKRRRETPS | PRPMRHRSSR | ||||
SP |
Задіяний у таких біологічних процесах як процесінг мРНК, сплайсінг мРНК. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі.
Література ред.
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Blencowe B.J., Issner R., Nickerson J.A., Sharp P.A. (1998). A coactivator of pre-mRNA splicing. Genes Dev. 12: 996—1009. PMID 9531537 DOI:10.1101/gad.12.7.996
- Jurica M.S., Licklider L.J., Gygi S.P., Grigorieff N., Moore M.J. (2002). Purification and characterization of native spliceosomes suitable for three-dimensional structural analysis. RNA. 8: 426—439. PMID 11991638 DOI:10.1017/S1355838202021088
- Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
- Grainger R.J., Barrass J.D., Jacquier A., Rain J.-C., Beggs J.D. (2009). Physical and genetic interactions of yeast Cwc21p, an ortholog of human SRm300/SRRM2, suggest a role at the catalytic center of the spliceosome. RNA. 15: 2161—2173. PMID 19854871 DOI:10.1261/rna.1908309
Примітки ред.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16639 (англ.) . Процитовано 27 лютого 2017.
- ↑ UniProt, Q9UQ35 (англ.) . Архів оригіналу за 8 березня 2017. Процитовано 27 лютого 2017.
Див. також ред.
Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |