SRRM1
білок-кодуючий ген Homo Sapiens
SRRM1 (англ. Serine and arginine repetitive matrix 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 904 амінокислот, а молекулярна маса — 102 335[4].
Послідовність амінокислот
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MDAGFFRGTS | AEQDNRFSNK | QKKLLKQLKF | AECLEKKVDM | SKVNLEVIKP | ||||
WITKRVTEIL | GFEDDVVIEF | IFNQLEVKNP | DSKMMQINLT | GFLNGKNARE | ||||
FMGELWPLLL | SAQENIAGIP | SAFLELKKEE | IKQRQIEQEK | LASMKKQDED | ||||
KDKRDKEEKE | SSREKRERSR | SPRRRKSRSP | SPRRRSSPVR | RERKRSHSRS | ||||
PRHRTKSRSP | SPAPEKKEKT | PELPEPSVKV | KEPSVQEATS | TSDILKVPKP | ||||
EPIPEPKEPS | PEKNSKKEKE | KEKTRPRSRS | RSKSRSRTRS | RSPSHTRPRR | ||||
RHRSRSRSYS | PRRRPSPRRR | PSPRRRTPPR | RMPPPPRHRR | SRSPVRRRRR | ||||
SSASLSGSSS | SSSSSRSRSP | PKKPPKRTSS | PPRKTRRLSP | SASPPRRRHR | ||||
PSPPATPPPK | TRHSPTPQQS | NRTRKSRVSV | SPGRTSGKVT | KHKGTEKRES | ||||
PSPAPKPRKV | ELSESEEDKG | GKMAAADSVQ | QRRQYRRQNQ | QSSSDSGSSS | ||||
SSEDERPKRS | HVKNGEVGRR | RRHSPSRSAS | PSPRKRQKET | SPRGRRRRSP | ||||
SPPPTRRRRS | PSPAPPPRRR | RTPTPPPRRR | TPSPPPRRRS | PSPRRYSPPI | ||||
QRRYSPSPPP | KRRTASPPPP | PKRRASPSPP | PKRRVSHSPP | PKQRSSPVTK | ||||
RRSPSLSSKH | RKGSSPSRST | REARSPQPNK | RHSPSPRPRA | PQTSSSPPPV | ||||
RRGASSSPQR | RQSPSPSTRP | IRRVSRTPEP | KKIKKAASPS | PQSVRRVSSS | ||||
RSVSGSPEPA | AKKPPAPPSP | VQSQSPSTNW | SPAVPVKKAK | SPTPSPSPPR | ||||
NSDQEGGGKK | KKKKKDKKHK | KDKKHKKHKK | HKKEKAVAAA | AAAAVTPAAI | ||||
AAATTTLAQE | EPVAAPEPKK | ETESEAEDNL | DDLEKHLREK | ALRSMRKAQV | ||||
SPQS |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як процесінг мРНК, сплайсінг мРНК, поліморфізм, ацетиляція. Білок має сайт для зв'язування з ДНК, РНК. Локалізований у ядрі.
Література
ред.- Blencowe B.J., Issner R., Nickerson J.A., Sharp P.A. (1998). A coactivator of pre-mRNA splicing. Genes Dev. 12: 996—1009. PMID 9531537 DOI:10.1101/gad.12.7.996
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Eldridge A.G., Li Y., Sharp P.A., Blencowe B.J. (1999). The SRm160/300 splicing coactivator is required for exon-enhancer function. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 96: 6125—6130. PMID 10339552 DOI:10.1073/pnas.96.11.6125
- Le Hir H., Izaurralde E., Maquat L.E., Moore M.J. (2000). The spliceosome deposits multiple proteins 20-24 nucleotides upstream of mRNA exon-exon junctions. EMBO J. 19: 6860—6869. PMID 11118221 DOI:10.1093/emboj/19.24.6860
- Lykke-Andersen J., Shu M.-D., Steitz J.A. (2001). Communication of the position of exon-exon junctions to the mRNA surveillance machinery by the protein RNPS1. Science. 293: 1836—1839. PMID 11546874 DOI:10.1126/science.1062786
- Lejeune F., Ishigaki Y., Li X., Maquat L.E. (2002). The exon junction complex is detected on CBP80-bound but not eIF4E-bound mRNA in mammalian cells: dynamics of mRNP remodeling. EMBO J. 21: 3536—3545. PMID 12093754 DOI:10.1093/emboj/cdf345
Примітки
ред.- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16638 (англ.) . Архів оригіналу за 22 серпня 2016. Процитовано 28 серпня 2017.
- ↑ UniProt, Q8IYB3 (англ.) . Архів оригіналу за 29 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.
Див. також
ред.Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |