SRPK1

SRPK1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1WAK, 1WBP, 3BEG, 4WUA
Ідентифікатори
Символи	SRPK1, SFRSK1, SRSF protein kinase 1
Зовнішні ІД	OMIM: 601939 MGI: 106908 HomoloGene: 110962 GeneCards: SRPK1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• transferase activity; • protein kinase activity; • nucleotide binding; • kinase activity; • protein serine/threonine kinase activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • ATP binding; • magnesium ion binding; • RNA binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • внутрішньоклітинна мембранна органела; • nuclear matrix; • клітинна мембрана; • ендоплазматичний ретикулум; • клітинне ядро; • гіалоплазма;
Біологічний процес	• диференціація клітин; • GO:0007243 intracellular signal transduction; • фосфорилювання; • regulation of mRNA processing; • chromosome segregation; • mRNA processing; • regulation of mRNA splicing, via spliceosome; • protein phosphorylation; • negative regulation of viral genome replication; • Сплайсинг РНК; • positive regulation of viral genome replication; • вроджений імунітет; • GO:0022415 viral process; • GO:0035093 sperm DNA condensation; • spliceosomal complex assembly; • регуляція експресії генів;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	6732
	20815
	н/д
	ENSMUSG00000004865
	Q96SB4
	O70551
	NM_003137
	NM_016795
	NP_003128
	NP_058075
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

SRPK1 (англ. SRSF protein kinase 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 655 амінокислот, а молекулярна маса — 74 325^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MERKVLALQA	RKKRTKAKKD	KAQRKSETQH	RGSAPHSESD	LPEQEEEILG
SDDDEQEDPN	DYCKGGYHLV	KIGDLFNGRY	HVIRKLGWGH	FSTVWLSWDI
QGKKFVAMKV	VKSAEHYTET	ALDEIRLLKS	VRNSDPNDPN	REMVVQLLDD
FKISGVNGTH	ICMVFEVLGH	HLLKWIIKSN	YQGLPLPCVK	KIIQQVLQGL
DYLHTKCRII	HTDIKPENIL	LSVNEQYIRR	LAAEATEWQR	SGAPPPSGSA
VSTAPQPKPA	DKMSKNKKKK	LKKKQKRQAE	LLEKRMQEIE	EMEKESGPGQ
KRPNKQEESE	SPVERPLKEN	PPNKMTQEKL	EESSTIGQDQ	TLMERDTEGG
AAEINCNGVI	EVINYTQNSN	NETLRHKEDL	HNANDCDVQN	LNQESSFLSS
QNGDSSTSQE	TDSCTPITSE	VSDTMVCQSS	STVGQSFSEQ	HISQLQESIR
AEIPCEDEQE	QEHNGPLDNK	GKSTAGNFLV	NPLEPKNAEK	LKVKIADLGN
ACWVHKHFTE	DIQTRQYRSL	EVLIGSGYNT	PADIWSTACM	AFELATGDYL
FEPHSGEEYT	RDEDHIALII	ELLGKVPRKL	IVAGKYSKEF	FTKKGDLKHI
TKLKPWGLFE	VLVEKYEWSQ	EEAAGFTDFL	LPMLELIPEK	RATAAECLRH
PWLNS

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, серин/треонінових протеїнкіназ, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, розходження хромосом, диференціація клітин, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, ендоплазматичному ретикулумі, мікросомах.

Література

Gui J.F., Lane W.S., Fu X.-D. (1994). A serine kinase regulates intracellular localization of splicing factors in the cell cycle. Nature. 369: 678—682. PMID 8208298 DOI:10.1038/369678a0
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Tronchere H., Wang J., Fu X.D. (1997). A protein related to splicing factor U2AF35 that interacts with U2AF65 and SR proteins in splicing of pre-mRNA. Nature. 388: 397—400. PMID 9237760 DOI:10.1038/41137
Papoutsopoulou S., Nikolakaki E., Giannakouros T. (1999). SRPK1 and LBR protein kinases show identical substrate specificities. Biochem. Biophys. Res. Commun. 255: 602—607. PMID 10049757 DOI:10.1006/bbrc.1999.0249
Mylonis I., Giannakouros T. (2003). Protein kinase CK2 phosphorylates and activates the SR protein-specific kinase 1. Biochem. Biophys. Res. Commun. 301: 650—656. PMID 12565829 DOI:10.1016/S0006-291X(02)03055-3
Zheng Y., Fu X.D., Ou J.H. (2005). Suppression of hepatitis B virus replication by SRPK1 and SRPK2 via a pathway independent of the phosphorylation of the viral core protein. Virology. 342: 150—158. PMID 16122776 DOI:10.1016/j.virol.2005.07.030

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11305 (англ.) . Процитовано 6 вересня 2017.
↑ UniProt, Q96SB4 (англ.) . Архів оригіналу за 22 жовтня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 6

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11305 (англ.) . Процитовано 6 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q96SB4 (англ.) . Архів оригіналу за 22 жовтня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.

[3]

[4]

[1]

[2]