SRBD1
білок-кодуючий ген Homo Sapiens
SRBD1 (англ. S1 RNA binding domain 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 2-й хромосомі.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 995 амінокислот, а молекулярна маса — 111 776[5].
SRBD1 | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
Ідентифікатори | |||||||
Символи | SRBD1, S1 RNA binding domain 1 | ||||||
Зовнішні ІД | MGI: 1925836 HomoloGene: 9994 GeneCards: SRBD1 | ||||||
Пов'язані генетичні захворювання | |||||||
глаукома[1] | |||||||
Ортологи | |||||||
Види | Людина | Миша | |||||
Entrez |
|
|
|||||
Ensembl |
|
|
|||||
UniProt |
|
|
|||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||
Локус (UCSC) | Хр. 2: 45.39 – 45.61 Mb | Хр. 17: 86.29 – 86.45 Mb | |||||
PubMed search | [2] | [3] | |||||
Вікідані | |||||||
|
Послідовність амінокислот
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MSSLPRRAKV | QVQDVVLKDE | FSSFSELSSA | SEEDDKEDSA | WEPQKKVPRS | ||||
RKQPPPKESK | PKRMPRVKKN | APQISDGSEV | VVVKEELNSS | VAIADTALED | ||||
RKNKLDTVQT | LKTAKTKQKC | AAQPHTVRRT | KKLKVEEETS | KASNLEGESN | ||||
SSETPSTSTV | WGGTCKKEEN | DDDFTFGQSA | LKKIKTETYP | QGQPVKFPAN | ||||
ANSTKEEVEM | NWDMVQVLSE | RTNIEPWVCA | NIIRLFNDDN | TIPFIIRYRK | ||||
ELINNLDADS | LREVQQTLEE | LRAVAKKVHS | TIQKIKKEGK | MSECLLKAML | ||||
NCKTFEELEH | VSAPYKTGSK | GTKAQRARQL | GLEGAARALL | EKPGELSLLS | ||||
YIRPDVKGLS | TLQDIEIGVQ | HILADMIAKD | KDTLDFIRNL | CQKRHVCIQS | ||||
SLAKVSSKKV | NEKDVDKFLL | YQHFSCNIRN | IHHHQILAIN | RGENLKVLTV | ||||
KVNISDGVKD | EFCRWCIQNR | WRPRSFARPE | LMKILYNSLN | DSFKRLIYPL | ||||
LCREFRAKLT | SDAEKESVMM | FGRNLRQLLL | TSPVPGRTLM | GVDPGYKHGC | ||||
KLAIISPTSQ | ILHTDVVYLH | CGQGFREAEK | IKTLLLNFNC | STVVIGNGTA | ||||
CRETEAYFAD | LIMKNYFAPL | DVVYCIVSEA | GASIYSVSPE | ANKEMPGLDP | ||||
NLRSAVSIAR | RVQDPLAELV | KIEPKHIGVG | MYQHDVSQTL | LKATLDSVVE | ||||
ECVSFVGVDI | NICSEVLLRH | IAGLNANRAK | NIIEWREKNG | PFINREQLKK | ||||
VKGLGPKSFQ | QCAGFIRINQ | DYIRTFCSQQ | TETSGQIQGV | AVTSSADVEV | ||||
TNEKQGKKKS | KTAVNVLLKP | NPLDQTCIHP | ESYDIAMRFL | SSIGGTLYEV | ||||
GKPEMQQKIN | SFLEKEGMEK | IAERLQTTVH | TLQVIIDGLS | QPESFDFRTD | ||||
FDKPDFKRSI | VCLEDLQIGT | VLTGKVENAT | LFGIFVDIGV | GKSGLIPIRN | ||||
VTEAKLSKTK | KRRSLGLGPG | ERVEVQVLNI | DIPRSRITLD | LIRVL |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК.
Література ред.
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Impens F., Radoshevich L., Cossart P., Ribet D. (2014). Mapping of SUMO sites and analysis of SUMOylation changes induced by external stimuli. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 111: 12432—12437. PMID 25114211 DOI:10.1073/pnas.1413825111
- Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep. 10: 1778—1791. PMID 25772364 DOI:10.1016/j.celrep.2015.02.033
Примітки ред.
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з SRBD1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:25521 (англ.) . Процитовано 18 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q8N5C6 (англ.) . Архів оригіналу за 4 червня 2017. Процитовано 18 вересня 2017.
Див. також ред.
Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |