SQSTM1

SQSTM1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1Q02, 2JY7, 2JY8, 2K0B, 2KNV, 4MJS, 4UF8, 4UF9
Ідентифікатори
Символи	SQSTM1, A170, OSIL, PDB3, ZIP3, p60, p62, p62B, FTDALS3, Sequestosome 1, NADGP, DMRV
Зовнішні ІД	OMIM: 601530 MGI: 107931 HomoloGene: 31202 GeneCards: SQSTM1
Пов'язані генетичні захворювання
	хвороба Альцгеймера, FTDALS3, хвороба Педжета
Онтологія гена
Молекулярна функція	• protein homodimerization activity; • receptor tyrosine kinase binding; • zinc ion binding; • SH2 domain binding; • зв'язування з іоном металу; • protein serine/threonine kinase activity; • K63-linked polyubiquitin modification-dependent protein binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • identical protein binding; • protein kinase binding; • protein kinase C binding; • ubiquitin binding; • enzyme binding; • ubiquitin protein ligase binding; • ionotropic glutamate receptor binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • ендосома; • PML body; • late endosome; • P-body; • phagophore assembly site; • Нуклеоплазма; • aggresome; • autophagosome; • amphisome; • ендоплазматичний ретикулум; • inclusion body; • лізосома; • sperm midpiece; • екзосома; • GO:0016023 cytoplasmic vesicle; • клітинне ядро; • гіалоплазма; • внутрішньоклітинна мембранна органела; • autolysosome; • мітохондрія; • Саркомера; • Тільця Леві;
Біологічний процес	• GO:0097285 апоптоз; • GO:0034613 protein localization; • диференціація клітин; • positive regulation of protein phosphorylation; • GO:0007243 intracellular signal transduction; • ubiquitin-dependent protein catabolic process; • regulation of mitochondrion organization; • protein heterooligomerization; • процес імунної системи; • response to stress; • regulation of Ras protein signal transduction; • negative regulation of apoptotic process; • Автофагія; • endosomal transport; • regulation of protein complex stability; • autophagy of mitochondrion; • positive regulation of apoptotic process; • regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • protein phosphorylation; • mitophagy; • response to mitochondrial depolarisation; • macroautophagy; • endosome organization; • protein localization to perinuclear region of cytoplasm; • response to ischemia; • mitochondrion organization; • aggrephagy; • selective autophagy; • interleukin-1-mediated signaling pathway; • positive regulation of long-term synaptic potentiation; • positive regulation of protein localization to plasma membrane;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	8878
	18412
	ENSG00000161011; ENSG00000284099
	ENSMUSG00000015837
	Q13501
	Q64337
	NM_001142298; NM_001142299; NM_003900
	NM_001290769; NM_011018
	NP_001135770; NP_001135771; NP_003891
	NP_001277698; NP_035148
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

SQSTM1 (англ. Sequestosome 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 440 амінокислот, а молекулярна маса — 47 687^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MASLTVKAYL	LGKEDAAREI	RRFSFCCSPE	PEAEAEAAAG	PGPCERLLSR
VAALFPALRP	GGFQAHYRDE	DGDLVAFSSD	EELTMAMSYV	KDDIFRIYIK
EKKECRRDHR	PPCAQEAPRN	MVHPNVICDG	CNGPVVGTRY	KCSVCPDYDL
CSVCEGKGLH	RGHTKLAFPS	PFGHLSEGFS	HSRWLRKVKH	GHFGWPGWEM
GPPGNWSPRP	PRAGEARPGP	TAESASGPSE	DPSVNFLKNV	GESVAAALSP
LGIEVDIDVE	HGGKRSRLTP	VSPESSSTEE	KSSSQPSSCC	SDPSKPGGNV
EGATQSLAEQ	MRKIALESEG	RPEEQMESDN	CSGGDDDWTH	LSSKEVDPST
GELQSLQMPE	SEGPSSLDPS	QEGPTGLKEA	ALYPHLPPEA	DPRLIESLSQ
MLSMGFSDEG	GWLTRLLQTK	NYDIGAALDT	IQYSKHPPPL

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як апоптоз, імунітет, автофагія, диференціація клітин, ацетилювання, альтернативний сплайсинг, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, ендоплазматичному ретикулумі, цитоплазматичних везикулах, лізосомі, ендосомах.

Література ред.

Joung I., Strominger J.L., Shin J. (1996). Molecular cloning of a phosphotyrosine-independent ligand of the p56lck SH2 domain. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 93: 5991—5995. PMID 8650207 DOI:10.1073/pnas.93.12.5991
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Vadlamudi R.K., Shin J. (1998). Genomic structure and promoter analysis of the p62 gene encoding a non-proteasomal multiubiquitin chain binding protein. FEBS Lett. 435: 138—142. PMID 9762895 DOI:10.1016/S0014-5793(98)01021-7
Vadlamudi R.K., Joung I., Strominger J.L., Shin J. (1996). p62, a phosphotyrosine-independent ligand of the SH2 domain of p56lck, belongs to a new class of ubiquitin-binding proteins. J. Biol. Chem. 271: 20235—20237. PMID 8702753 DOI:10.1074/jbc.271.34.20235
Marcus S.L., Winrow C.J., Capone J.P., Rachubinski R.A. (1996). A p56(lck) ligand serves as a coactivator of an orphan nuclear hormone receptor. J. Biol. Chem. 271: 27197—27200. PMID 8910285 DOI:10.1074/jbc.271.44.27197
Sanchez P., De Carcer G., Sandoval I.V., Moscat J., Diaz-Meco M.T. (1998). Localization of atypical protein kinase C isoforms into lysosome-targeted endosomes through interaction with p62. Mol. Cell. Biol. 18: 3069—3080. PMID 9566925 DOI:10.1128/MCB.18.5.3069