SPOP

SPOP
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2CR2, 3HQH, 3HQI, 3HQL, 3HQM, 3HTM, 3HU6, 3IVB, 3IVQ, 3IVV, 4EOZ, 4HS2, 4J8Z, 4O1V
Ідентифікатори
Символи	SPOP, BTBD32, TEF2, speckle type BTB/POZ protein, NEDMIDF, NSDVS1, NSDVS2, NEDMACE
Зовнішні ІД	OMIM: 602650 MGI: 1343085 HomoloGene: 68354 GeneCards: SPOP
Пов'язані генетичні захворювання
	prostate adenocarcinoma
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • ubiquitin protein ligase binding;
Клітинна компонента	• Cul3-RING ubiquitin ligase complex; • nuclear speck; • клітинне ядро; • нуклеоплазма; • цитоплазма; • SCF ubiquitin ligase complex;
Біологічний процес	• Убіквітин-залежний протеоліз; • regulation of proteolysis; • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • glucose homeostasis; • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process; • negative regulation of DNA-binding transcription factor activity; • positive regulation of endoplasmic reticulum stress-induced intrinsic apoptotic signaling pathway; • positive regulation of type B pancreatic cell apoptotic process; • ubiquitin-dependent protein catabolic process;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	8405
	20747
	ENSG00000121067
	ENSMUSG00000057522
	O43791
	Q6ZWS8
NM_001007226; NM_001007227; NM_001007228; NM_001007229; NM_001007230;
	NM_003563; NM_001370730; NM_001370731; NM_001370732
	NM_025287; NM_001359107
NP_001007227; NP_001007228; NP_001007229; NP_001007230; NP_001007231;
	NP_003554; NP_001357659; NP_001357660; NP_001357661
	NP_079563; NP_001346036
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

SPOP (англ. Speckle type BTB/POZ protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 374 амінокислот, а молекулярна маса — 42 132^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSRVPSPPPP	AEMSSGPVAE	SWCYTQIKVV	KFSYMWTINN	FSFCREEMGE
VIKSSTFSSG	ANDKLKWCLR	VNPKGLDEES	KDYLSLYLLL	VSCPKSEVRA
KFKFSILNAK	GEETKAMESQ	RAYRFVQGKD	WGFKKFIRRD	FLLDEANGLL
PDDKLTLFCE	VSVVQDSVNI	SGQNTMNMVK	VPECRLADEL	GGLWENSRFT
DCCLCVAGQE	FQAHKAILAA	RSPVFSAMFE	HEMEESKKNR	VEINDVEPEV
FKEMMCFIYT	GKAPNLDKMA	DDLLAAADKY	ALERLKVMCE	DALCSNLSVE
NAAEILILAD	LHSADQLKTQ	AVDFINYHAS	DVLETSGWKS	MVVSHPHLVA
EAYRSLASAQ	CPFLGPPRKR	LKQS

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як убіквітинування білків. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Furukawa M., He Y.J., Borchers C., Xiong Y. (2003). Targeting of protein ubiquitination by BTB-Cullin 3-Roc1 ubiquitin ligases. Nat. Cell Biol. 5: 1001—1007. PMID 14528312 DOI:10.1038/ncb1056
Kent D., Bush E.W., Hooper J.E. (2006). Roadkill attenuates Hedgehog responses through degradation of Cubitus interruptus. Development. 133: 2001—2010. PMID 16651542 DOI:10.1242/dev.02370