SPOCK1

SPOCK1 (англ. SPARC/osteonectin, cwcv and kazal like domains proteoglycan 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 439 амінокислот, а молекулярна маса — 49 124.

SPOCK1
Ідентифікатори
Символи	SPOCK1, SPOCK, TESTICAN, TIC1, sparc/osteonectin, cwcv and kazal-like domains proteoglycan (testican) 1, SPARC/osteonectin, cwcv and kazal like domains proteoglycan 1, SPARC (osteonectin), cwcv and kazal like domains proteoglycan 1
Зовнішні ІД	OMIM: 602264 MGI: 105371 HomoloGene: 80193 GeneCards: SPOCK1
Онтологія гена Молекулярна функція • calcium ion binding • cysteine-type endopeptidase inhibitor activity • metalloendopeptidase inhibitor activity • serine-type endopeptidase inhibitor activity • collagen binding • extracellular matrix binding Клітинна компонента • цитоплазма • GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення • neuromuscular junction • node of Ranvier • extracellular region • Саркоплазма • міжклітинний простір Біологічний процес • negative regulation of cell-substrate adhesion • Нейрогенез • negative regulation of neuron projection development • neuron migration • нейробіологія розвитку • адгезія клітин • regulation of cell growth • central nervous system neuron differentiation • GO:0072468 сигнальна трансдукція • negative regulation of endopeptidase activity Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6695	20745
Ensembl	ENSG00000152377	ENSMUSG00000056222
UniProt	Q08629	Q62288
RefSeq (мРНК)	NM_004598	NM_001166463 NM_001166464 NM_001166465 NM_001166466 NM_009262
RefSeq (білок)	NP_004589	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 5: 136.98 – 137.6 Mb	Хр. 13: 57.57 – 58.06 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MPAIAVLAAA		AAAWCFLQVE		SRHLDALAGG		AGPNHGNFLD		NDQWLSTVSQ
YDRDKYWNRF		RDDDYFRNWN		PNKPFDQALD		PSKDPCLKVK		CSPHKVCVTQ
DYQTALCVSR		KHLLPRQKKG		NVAQKHWVGP		SNLVKCKPCP		VAQSAMVCGS
DGHSYTSKCK		LEFHACSTGK		SLATLCDGPC		PCLPEPEPPK		HKAERSACTD
KELRNLASRL		KDWFGALHED		ANRVIKPTSS		NTAQGRFDTS		ILPICKDSLG
WMFNKLDMNY		DLLLDPSEIN		AIYLDKYEPC		IKPLFNSCDS		FKDGKLSNNE
WCYCFQKPGG		LPCQNEMNRI		QKLSKGKSLL		GAFIPRCNEE		GYYKATQCHG
STGQCWCVDK		YGNELAGSRK		QGAVSCEEEQ		ETSGDFGSGG		SVVLLDDLEY
ERELGPKDKE		GKLRVHTRAV		TEDDEDEDDD		KEDEVGYIW

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.

Література

• Alliel P.M., Perin J.-P., Jolles P., Bonnet F.J. (1993). Testican, a multidomain testicular proteoglycan resembling modulators of cell social behaviour. Eur. J. Biochem. 214: 347—350. PMID 8389704 DOI:10.1111/j.1432-1033.1993.tb17930.x
• Marr H.S., Basalamah M.A., Edgell C.J. (1997). Endothelial cell expression of testican mRNA. Endothelium. 5: 209—219. PMID 9272383 DOI:10.3109/10623329709053399
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Bonnet F., Perin J.-P., Maillet P., Jolles P., Alliel P.M. (1992). Characterization of a human seminal plasma glycosaminoglycan-bearing polypeptide. Biochem. J. 288: 565—569. PMID 1463459 DOI:10.1042/bj2880565
• Halim A., Ruetschi U., Larson G., Nilsson J. (2013). LC-MS/MS characterization of O-glycosylation sites and glycan structures of human cerebrospinal fluid glycoproteins. J. Proteome Res. 12: 573—584. PMID 23234360 DOI:10.1021/pr300963h

Див. також

• Хромосома 5