SPEF1

SPEF1 (англ. Sperm flagellar 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 236 амінокислот, а молекулярна маса — 26 987.

SPEF1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2EE7
Ідентифікатори
Символи	SPEF1, C20orf28, CLAMP, SPEF1A, sperm flagellar 1
Зовнішні ІД	OMIM: 610674 MGI: 3513546 HomoloGene: 15741 GeneCards: SPEF1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • microtubule binding • молекулярна функція Клітинна компонента • цитоплазма • GO:0035085 Аксонема • cell projection • motile cilium • війка • цитоскелет • компонент клітини Біологічний процес • negative regulation of microtubule depolymerization • cell migration • GO:0022610 життєдіяльність • cilium-dependent cell motility • regulation of cytoskeleton organization Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	25876	70997
Ensembl	ENSG00000101222	ENSMUSG00000027329
UniProt	Q9Y4P9	Q99JL1
RefSeq (мРНК)	NM_015417	NM_027641
RefSeq (білок)	NP_056232	NP_081917
Локус (UCSC)	Хр. 20: 3.78 – 3.78 Mb	Хр. 2: 131.01 – 131.03 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MASSVDEEAL		HQLYLWVDNI		PLSRPKRNLS		RDFSDGVLVA		EVIKFYFPKM
VEMHNYVPAN		SLQQKLSNWG		HLNRKVLKRL		NFSVPDDVMR		KIAQCAPGVV
ELVLIPLRQR		LEERQRRRKQ		GAGSLQELAP		QDGSGYMDVG		VSQKARGEGV
PDPQGGGQLS		WDRPPAPRPP		AYNRALQGDP		SFVLQIAEKE		QELLASQETV
QVLQMKVRRL		EHLLQLKNVR		IEDLSRRLQQ		AERKQR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, клітинних відростках, війках.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Chan S.W., Fowler K.J., Choo K.H.A., Kalitsis P. (2005). Spef1, a conserved novel testis protein found in mouse sperm flagella. Gene. 353: 189—199. PMID 15979255 DOI:10.1016/j.gene.2005.04.025

Див. також

• Хромосома 20