SPECC1
білок-кодуючий ген Homo Sapiens
SPECC1 (англ. Sperm antigen with calponin homology and coiled-coil domains 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 068 амінокислот, а молекулярна маса — 118 585[5].
SPECC1 | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
Ідентифікатори | |||||||
Символи | SPECC1, CYTSB, HCMOGT-1, HCMOGT1, NSP, sperm antigen with calponin homology and coiled-coil domains 1, NSP5 | ||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 608793 MGI: 2442356 HomoloGene: 45157 GeneCards: SPECC1 | ||||||
Пов'язані генетичні захворювання | |||||||
ожиріння[1] | |||||||
Ортологи | |||||||
Види | Людина | Миша | |||||
Entrez |
|
|
|||||
Ensembl |
|
|
|||||
UniProt |
|
|
|||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||
Локус (UCSC) | Хр. 17: 20.01 – 20.32 Mb | Хр. 11: 61.85 – 62.11 Mb | |||||
PubMed search | [2] | [3] | |||||
Вікідані | |||||||
|
Послідовність амінокислот
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MRSAAKPWNP | AIRAGGHGPD | RVRPLPAASS | GMKSSKSSTS | LAFESRLSRL | ||||
KRASSEDTLN | KPGSTAASGV | VRLKKTATAG | AISELTESRL | RSGTGAFTTT | ||||
KRTGIPAPRE | FSVTVSRERS | VPRGPSNPRK | SVSSPTSSNT | PTPTKHLRTP | ||||
STKPKQENEG | GEKAALESQV | RELLAEAKAK | DSEINRLRSE | LKKYKEKRTL | ||||
NAEGTDALGP | NVDGTSVSPG | DTEPMIRALE | EKNKNFQKEL | SDLEEENRVL | ||||
KEKLIYLEHS | PNSEGAASHT | GDSSCPTSIT | QESSFGSPTG | NQMSSDIDEY | ||||
KKNIHGNALR | TSGSSSSDVT | KASLSPDASD | FEHITAETPS | RPLSSTSNPF | ||||
KSSKCSTAGS | SPNSVSELSL | ASLTEKIQKM | EENHHSTAEE | LQATLQELSD | ||||
QQQMVQELTA | ENEKLVDEKT | ILETSFHQHR | ERAEQLSQEN | EKLMNLLQER | ||||
VKNEEPTTQE | GKIIELEQKC | TGILEQGRFE | REKLLNIQQQ | LTCSLRKVEE | ||||
ENQGALEMIK | RLKEENEKLN | EFLELERHNN | NMMAKTLEEC | RVTLEGLKME | ||||
NGSLKSHLQG | EKQKATEASA | VEQTAESCEV | QEMLKVARAE | KDLLELSCNE | ||||
LRQELLKANG | EIKHVSSLLA | KVEKDYSYLK | EICDHQAEQL | SRTSLKLQEK | ||||
ASESDAEIKD | MKETIFELED | QVEQHRAVKL | HNNQLISELE | SSVIKLEEQK | ||||
SDLERQLKTL | TKQMKEETEE | WRRFQADLQT | AVVVANDIKC | EAQQELRTVK | ||||
RKLLEEEEKN | ARLQKELGDV | QGHGRVVTSR | AAPPPVDEEP | ESSEVDAAGR | ||||
WPGVCVSRTS | PTPPESATTV | KSLIKSFDLG | RPGGAGQNIS | VHKTPRSPLS | ||||
GIPVRTAPAA | AVSPMQRHST | YSSVRPASRG | VTQRLDLPDL | PLSDILKGRT | ||||
ETLKPDPHLR | KSPSLESLSR | PPSLGFGDTR | LLSASTRAWK | PQSKLSVERK | ||||
DPLAALAREY | GGSKRNALLK | WCQKKTQGYA | NIDITNFSSS | WSDGLAFCAL | ||||
LHTYLPAHIP | YQELNSQEKK | RNLLLAFEAA | ESVGIKPSLE | LSEMLYTDRP | ||||
DWQSVMQYVA | QIYKYFET |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі, мембрані.
Література
ред.- Sang N., Fath D.M., Giordano A. (2004). A gene highly expressed in tumor cells encodes novel structure proteins. Oncogene. 23: 9438—9446. PMID 15602574 DOI:10.1038/sj.onc.1207988
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Примітки
ред.- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з SPECC1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:30615 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q5M775 (англ.) . Архів оригіналу за 16 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
ред.Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |