SORT1

SORT1 (англ. Sortilin 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 831 амінокислот, а молекулярна маса — 92 068.

SORT1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3F6K, 3G2U, 3G2V, 4MSL, 4N7E, 4PO7
Ідентифікатори
Символи	SORT1, Gp95, LDLCQ6, NT3, NTR3, Sortilin 1
Зовнішні ІД	OMIM: 602458 MGI: 1338015 HomoloGene: 136097 GeneCards: SORT1
Онтологія гена Молекулярна функція • nerve growth factor receptor activity • neurotensin receptor activity, non-G protein-coupled • nerve growth factor binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • enzyme binding Клітинна компонента • integral component of membrane • ендосома • комплекс Ґольджі • Ядерна мембрана • endoplasmic reticulum membrane • мембрана • внутрішньоклітинна мембранна органела • клітинна мембрана • Golgi cisterna membrane • cell surface • lysosomal membrane • neuronal cell body • дендрит (нейробіологія) • early endosome • ендоплазматичний ретикулум • perinuclear region of cytoplasm • clathrin-coated pit • trans-Golgi network transport vesicle • лізосома • endosome membrane • clathrin-coated vesicle • клітинне ядро • гіалоплазма • cytoplasmic vesicle membrane • GO:0016023 cytoplasmic vesicle Біологічний процес • G protein-coupled receptor signaling pathway • диференціація клітин • myotube differentiation • negative regulation of fat cell differentiation • ендоцитоз • neurotrophin TRK receptor signaling pathway • осифікація • endosome transport via multivesicular body sorting pathway • vesicle organization • endosome to lysosome transport • Golgi to endosome transport • positive regulation of epithelial cell apoptotic process • multicellular organism development • response to insulin • plasma membrane to endosome transport • регуляція експресії генів • negative regulation of lipoprotein lipase activity • glucose import • neuropeptide signaling pathway • extrinsic apoptotic signaling pathway via death domain receptors • nerve growth factor signaling pathway • post-Golgi vesicle-mediated transport Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6272	20661
Ensembl	ENSG00000134243	ENSMUSG00000068747
UniProt	Q99523	Q6PHU5
RefSeq (мРНК)	NM_001205228 NM_002959	NM_001271599 NM_019972
RefSeq (білок)	NP_001192157 NP_002950	NP_001258528 NP_064356
Локус (UCSC)	Хр. 1: 109.31 – 109.4 Mb	Хр. 3: 108.19 – 108.27 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MERPWGAADG		LSRWPHGLGL		LLLLQLLPPS		TLSQDRLDAP		PPPAAPLPRW
SGPIGVSWGL		RAAAAGGAFP		RGGRWRRSAP		GEDEECGRVR		DFVAKLANNT
HQHVFDDLRG		SVSLSWVGDS		TGVILVLTTF		HVPLVIMTFG		QSKLYRSEDY
GKNFKDITDL		INNTFIRTEF		GMAIGPENSG		KVVLTAEVSG		GSRGGRIFRS
SDFAKNFVQT		DLPFHPLTQM		MYSPQNSDYL		LALSTENGLW		VSKNFGGKWE
EIHKAVCLAK		WGSDNTIFFT		TYANGSCKAD		LGALELWRTS		DLGKSFKTIG
VKIYSFGLGG		RFLFASVMAD		KDTTRRIHVS		TDQGDTWSMA		QLPSVGQEQF
YSILAANDDM		VFMHVDEPGD		TGFGTIFTSD		DRGIVYSKSL		DRHLYTTTGG
ETDFTNVTSL		RGVYITSVLS		EDNSIQTMIT		FDQGGRWTHL		RKPENSECDA
TAKNKNECSL		HIHASYSISQ		KLNVPMAPLS		EPNAVGIVIA		HGSVGDAISV
MVPDVYISDD		GGYSWTKMLE		GPHYYTILDS		GGIIVAIEHS		SRPINVIKFS
TDEGQCWQTY		TFTRDPIYFT		GLASEPGARS		MNISIWGFTE		SFLTSQWVSY
TIDFKDILER		NCEEKDYTIW		LAHSTDPEDY		EDGCILGYKE		QFLRLRKSSV
CQNGRDYVVT		KQPSICLCSL		EDFLCDFGYY		RPENDSKCVE		QPELKGHDLE
FCLYGREEHL		TTNGYRKIPG		DKCQGGVNPV		REVKDLKKKC		TSNFLSPEKQ
NSKSNSVPII		LAIVGLMLVT		VVAGVLIVKK		YVCGGRFLVH		RYSVLQQHAE
ANGVDGVDAL		DTASHTNKSG		YHDDSDEDLL		E

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт, ендоцитоз, остеогенез, диференціація, поліморфізм. Локалізований у клітинній мембрані, ядрі, мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, лізосомі, апараті гольджі, ендосомах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Nielsen M.S., Jacobsen C., Olivecrona G., Gliemann J., Petersen C.M. (1999). Sortilin/neurotensin receptor-3 binds and mediates degradation of lipoprotein lipase. J. Biol. Chem. 274: 8832—8836. PMID 10085125 DOI:10.1074/jbc.274.13.8832
• Takatsu H., Katoh Y., Shiba Y., Nakayama K. (2001). Golgi-localizing, gamma-adaptin ear homology domain, ADP-ribosylation factor-binding (GGA) proteins interact with acidic dileucine sequences within the cytoplasmic domains of sorting receptors through their Vps27p/Hrs/STAM (VHS) domains. J. Biol. Chem. 276: 28541—28545. PMID 11390366 DOI:10.1074/jbc.C100218200
• Navarro V., Vincent J.-P., Mazella J. (2002). Shedding of the luminal domain of the neurotensin receptor-3/sortilin in the HT29 cell line. Biochem. Biophys. Res. Commun. 298: 760—764. PMID 12419319 DOI:10.1016/S0006-291X(02)02564-0
• Lefrancois S., Zeng J., Hassan A.J., Canuel M., Morales C.R. (2003). The lysosomal trafficking of sphingolipid activator proteins (SAPs) is mediated by sortilin. EMBO J. 22: 6430—6437. PMID 14657016 DOI:10.1093/emboj/cdg629
• Lewandrowski U., Moebius J., Walter U., Sickmann A. (2006). Elucidation of N-glycosylation sites on human platelet proteins: a glycoproteomic approach. Mol. Cell. Proteomics. 5: 226—233. PMID 16263699 DOI:10.1074/mcp.M500324-MCP200

Див. також

• Хромосома 1