SOGA1
білок-кодуючий ген Homo Sapiens
SOGA1 (англ. Suppressor of glucose, autophagy associated 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 423 амінокислот, а молекулярна маса — 159 760[4].
SOGA1 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | SOGA1, C20orf117, KIAA0889, SOGA, suppressor of glucose, autophagy associated 1 | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | MGI: 2444575 HomoloGene: 52382 GeneCards: SOGA1 | ||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
|
|||||||||||||||
Ensembl |
|
|
|||||||||||||||
UniProt |
|
|
|||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 20: 36.78 – 36.86 Mb | Хр. 2: 156.86 – 156.92 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | [1] | [2] | |||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
Послідовність амінокислот
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MLEMRDVYME | EDVYQLQELR | QQLDQASKTC | RILQYRLRKA | ERRSLRAAQT | ||||
GQVDGELIRG | LEQDVKVSKD | ISMRLHKELE | VVEKKRARLE | EENEELRQRL | ||||
IETELAKQVL | QTELERPREH | SLKKRGTRSL | GKADKKTLVQ | EDSADLKCQL | ||||
HFAKEESALM | CKKLTKLAKE | NDSMKEELLK | YRSLYGDLDS | ALSAEELADA | ||||
PHSRETELKV | HLKLVEEEAN | LLSRRIVELE | VENRGLRAEM | DDMKDHGGGC | ||||
GGPEARLAFS | ALGGGECGES | LAELRRHLQF | VEEEAELLRR | SSAELEDQNK | ||||
LLLNELAKFR | SEHELDVALS | EDSCSVLSEP | SQEELAAAKL | QIGELSGKVK | ||||
KLQYENRVLL | SNLQRCDLAS | CQSTRPMLET | DAEAGDSAQC | VPAPLGETHE | ||||
SHAVRLCRAR | EAEVLPGLRE | QAALVSKAID | VLVADANGFT | AGLRLCLDNE | ||||
CADFRLHEAP | DNSEGPRDTK | LIHAILVRLS | VLQQELNAFT | RKADAVLGCS | ||||
VKEQQESFSS | LPPLGSQGLS | KEILLAKDLG | SDFQPPDFRD | LPEWEPRIRE | ||||
AFRTGDLDSK | PDPSRSFRPY | RAEDNDSYAS | EIKELQLVLA | EAHDSLRGLQ | ||||
EQLSQERQLR | KEEADNFNQK | MVQLKEDQQR | ALLRREFELQ | SLSLQRRLEQ | ||||
KFWSQEKNML | VQESQQFKHN | FLLLFMKLRW | FLKRWRQGKV | LPSEGDDFLE | ||||
VNSMKELYLL | MEEEEINAQH | SDNKACTGDS | WTQNTPNEYI | KTLADMKVTL | ||||
KELCWLLRDE | RRGLTELQQQ | FAKAKATWET | ERAELKGHTS | QMELKTGKGA | ||||
GERAGPDWKA | ALQREREEQQ | HLLAESYSAV | MELTRQLQIS | ERNWSQEKLQ | ||||
LVERLQGEKQ | QVEQQVKELQ | NRLSQLQKAA | DPWVLKHSEL | EKQDNSWKET | ||||
RSEKIHDKEA | VSEVELGGNG | LKRTKSVSSM | SEFESLLDCS | PYLAGGDARG | ||||
KKLPNNPAFG | FVSSEPGDPE | KDTKEKPGLS | SRDCNHLGAL | ACQDPPGRQM | ||||
QRSYTAPDKT | GIRVYYSPPV | ARRLGVPVVH | DKEGKIIIEP | GFLFTTAKPK | ||||
ESAEADGLAE | SSYGRWLCNF | SRQRLDGGSA | GSPSAAGPGF | PAALHDFEMS | ||||
GNMSDDMKEI | TNCVRQAMRS | GSLERKVKST | SSQTVGLASV | GTQTIRTVSV | ||||
GLQTDPPRSS | LHGKAWSPRS | SSLVSVRSKQ | ISSSLDKVHS | RIERPCCSPK | ||||
YGSPKLQRRS | VSKLDSSKDR | SLWNLHQGKQ | NGSAWARSTT | TRDSPVLRNI | ||||
NDGLSSLFSV | VEHSGSTESV | WKLGMSETRA | KPEPPKYGIV | QEFFRNVCGR | ||||
APSPTSSAGE | EGTKKPEPLS | PASYHQPEGV | ARILNKKAAK | LGSSEEVRLT | ||||
MLPQVGKDGV | LRDGDGAVVL | PNEDAVCDCS | TQSLTSCFAR | SSRSAIRHSP | ||||
SKCRLHPSES | SWGGEERALP | PSE |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Секретований назовні.
Література
ред.- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Примітки
ред.- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16111 (англ.) . Архів оригіналу за 10 травня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
- ↑ UniProt, O94964 (англ.) . Архів оригіналу за 12 лютого 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
ред.Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |