SNU13

SNU13 (англ. Small nuclear ribonucleoprotein 13) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 128 амінокислот, а молекулярна маса — 14 174.

SNU13
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1E7K, 2JNB, 2OZB, 3SIU, 3SIV, 3JCR
Ідентифікатори
Символи	SNU13, 15.5K, FA-1, FA1, NHPX, OTK27, SNRNP15-5, SPAG12, SSFA1, NHP2L1, SNU13 homolog, small nuclear ribonucleoprotein (U4/U6.U5), small nuclear ribonucleoprotein 13
Зовнішні ІД	OMIM: 601304 MGI: 893586 HomoloGene: 3672 GeneCards: SNU13
Онтологія гена Молекулярна функція • U3 snoRNA binding • ATPase binding • U4 snRNA binding • U4atac snRNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • snoRNA binding • RNA binding • box C/D RNA binding Клітинна компонента • нуклеоплазма • spliceosomal complex • клітинне ядро • small-subunit processome • U4/U6 x U5 tri-snRNP complex • ядерце • dense fibrillar component • cytosolic large ribosomal subunit • precatalytic spliceosome • box C/D RNP complex • U4atac snRNP • GO:0009327 protein-containing complex • U2-type precatalytic spliceosome • Рибонуклеопротеїни Біологічний процес • mRNA processing • ribosome biogenesis • mRNA splicing, via spliceosome • Сплайсинг РНК • maturation of LSU-rRNA • maturation of SSU-rRNA • Біосинтез білків • rRNA processing • single fertilization • box C/D snoRNP assembly Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	4809	20826
Ensembl	ENSG00000100138	ENSMUSG00000063480
UniProt	P55769	Q9D0T1
RefSeq (мРНК)	NM_001003796 NM_005008	NM_011482
RefSeq (білок)	NP_001003796 NP_004999	NP_035612
Локус (UCSC)	Хр. 22: 41.67 – 41.69 Mb	н/д
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MTEADVNPKA		YPLADAHLTK		KLLDLVQQSC		NYKQLRKGAN		EATKTLNRGI
SEFIVMAADA		EPLEIILHLP		LLCEDKNVPY		VFVRSKQALG		RACGVSRPVI
ACSVTIKEGS		QLKQQIQSIQ		QSIERLLV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рибонуклеопротеїнів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Liu S., Rauhut R., Vornlocher H.-P., Luehrmann R. (2006). The network of protein-protein interactions within the human U4/U6.U5 tri-snRNP. RNA. 12: 1418—1430. PMID 16723661 DOI:10.1261/rna.55406
• Vidovic I., Nottrott S., Hartmuth K., Luehrmann R., Ficner R. (2000). Crystal structure of the spliceosomal 15.5kD protein bound to a U4 snRNA fragment. Mol. Cell. 6: 1331—1342. PMID 11163207 DOI:10.1016/S1097-2765(00)00131-3
• Soss S.E., Flynn P.F. (2007). Functional implications for a prototypical K-turn binding protein from structural and dynamical studies of 15.5K. Biochemistry. 46: 14979—14986. PMID 18044964 DOI:10.1021/bi701254q
• Saito H., Fujiwara T., Shin S., Okui K., Nakamura Y. (1996). Cloning and mapping of a human novel cDNA (NHP2L1) that encodes a protein highly homologous to yeast nuclear protein NHP2. Cytogenet. Cell Genet. 72: 191—193. PMID 8978773

Див. також

• Хромосома 22