SNRNP48
білок-кодуючий ген Homo Sapiens
SNRNP48 (англ. Small nuclear ribonucleoprotein U11/U12 subunit 48) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 6-й хромосомі.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 339 амінокислот, а молекулярна маса — 39 965[4].
SNRNP48 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | SNRNP48, C6orf151, dJ336K20B.1, dJ512B11.2, small nuclear ribonucleoprotein U11/U12 subunit 48 | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | MGI: 1915047 HomoloGene: 12191 GeneCards: SNRNP48 | ||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
|
|||||||||||||||
Ensembl |
|
|
|||||||||||||||
UniProt |
|
|
|||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 6: 7.59 – 7.61 Mb | Хр. 13: 38.39 – 38.41 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | [1] | [2] | |||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
Послідовність амінокислот
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MEGEPPPVEE | RRRLQEELNE | FVESGCRTLE | EVTASLGWDL | DSLDPGEEEA | ||||
AEDEVVICPY | DSNHHMPKSS | LAKHMASCRL | RKMGYTKEEE | DEMYNPEFFY | ||||
ENVKIPSITL | NKDSQFQIIK | QARTAVGKDS | DCYNQRIYSS | LPVEVPLNHK | ||||
RFVCDLTQAD | RLALYDFVVE | ETKKKRSDSQ | IIENDSDLFV | DLAAKINQDN | ||||
SRKSPKSYLE | ILAEVRDYKR | RRQSYRAKNV | HITKKSYTEV | IRDVINVHME | ||||
ELSNHWQEEQ | EKAEDDAEKN | EERRSASVDS | RQSGGSYLDA | ECSRHRRDRS | ||||
RSPHKRKRNK | DKDKNCESRR | RKERDGERHH | SHKRRKQKI |
Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у ядрі.
Література
ред.- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Andreeva A., Tidow H. (2008). A novel CHHC Zn-finger domain found in spliceosomal proteins and tRNA modifying enzymes. Bioinformatics. 24: 2277—2280. PMID 18703587 DOI:10.1093/bioinformatics/btn431
- Tidow H., Andreeva A., Rutherford T.J., Fersht A.R. (2009). Solution structure of the U11-48K CHHC zinc-finger domain that specifically binds the 5' splice site of U12-type introns. Structure. 17: 294—302. PMID 19217400 DOI:10.1016/j.str.2008.11.013
Примітки
ред.- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:21368 (англ.) . Процитовано 19 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q6IEG0 (англ.) . Архів оригіналу за 20 грудня 2016. Процитовано 19 вересня 2017.
Див. також
ред.Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |