SMPD4
білок-кодуючий ген Homo Sapiens
SMPD4 (англ. Sphingomyelin phosphodiesterase 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 827 амінокислот, а молекулярна маса — 93 352[4].
Послідовність амінокислот
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MAFPHLQQPS | FLLASLKADS | INKPFAQQCQ | DLVKVIEDFP | AKELHTIFPW | ||||
LVESIFGSLD | GVLVGWNLRC | LQGRVNPVEY | SIVMEFLDPG | GPMMKLVYKL | ||||
QAEDYKFDFP | VSYLPGPVKA | SIQECILPDS | PLYHNKVQFT | PTGGLGLNLA | ||||
LNPFEYYIFF | FALSLITQKP | LPVSLHVRTS | DCAYFILVDR | YLSWFLPTEG | ||||
SVPPPLSSSP | GGTSPSPPPR | TPAIPFASYG | LHHTSLLKRH | ISHQTSVNAD | ||||
PASHEIWRSE | TLLQVFVEMW | LHHYSLEMYQ | KMQSPHAKLE | VLHYRLSVSS | ||||
ALYSPAQPSL | QALHAYQESF | TPTEEHVLVV | RLLLKHLHAF | ANSLKPEQAS | ||||
PSAHSHATSP | LEEFKRAAVP | RFVQQKLYLF | LQHCFGHWPL | DASFRAVLEM | ||||
WLSYLQPWRY | APDKQAPGSD | SQPRCVSEKW | APFVQENLLM | YTKLFVGFLN | ||||
RALRTDLVSP | KHALMVFRVA | KVFAQPNLAE | MIQKGEQLFL | EPELVIPHRQ | ||||
HRLFTAPTFT | GSFLSPWPPA | VTDASFKVKS | HVYSLEGQDC | KYTPMFGPEA | ||||
RTLVLRLAQL | ITQAKHTAKS | ISDQCAESPA | GHSFLSWLGF | SSMDTNGSYT | ||||
ANDLDEMGQD | SVRKTDEYLE | KALEYLRQIF | RLSEAQLRQF | TLALGTTQDE | ||||
NGKKQLPDCI | VGEDGLILTP | LGRYQIINGL | RRFEIEYQGD | PELQPIRSYE | ||||
IASLVRTLFR | LSSAINHRFA | GQMAALCSRD | DFLGSFCRYH | LTEPGLASRH | ||||
LLSPVGRRQV | AGHTRGPRLS | LRFLGSYRTL | VSLLLAFFVA | SLFCVGPLPC | ||||
TLLLTLGYVL | YASAMTLLTE | RGKLHQP |
Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном магнію. Локалізований у мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, апараті гольджі.
Література
ред.- Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVI. The complete sequences of 150 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 65—73. PMID 10718198 DOI:10.1093/dnares/7.1.65
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Krut O., Wiegmann K., Kashkar H., Yazdanpanah B., Kroenke M. (2006). Novel tumor necrosis factor-responsive mammalian neutral sphingomyelinase-3 is a C-tail-anchored protein. J. Biol. Chem. 281: 13784—13793. PMID 16517606 DOI:10.1074/jbc.M511306200
Примітки
ред.- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:32949 (англ.) . Процитовано 29 серпня 2017.
- ↑ UniProt, Q9NXE4 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 29 серпня 2017.
Див. також
ред.Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |