SMNDC1
білок-кодуючий ген Homo Sapiens
SMNDC1 (англ. Survival motor neuron domain containing 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 238 амінокислот, а молекулярна маса — 26 711[4].
SMNDC1 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | SMNDC1, SMNR, SPF30, TDRD16C, Survival motor neuron domain containing 1 | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 603519 MGI: 1923729 HomoloGene: 4290 GeneCards: SMNDC1 | ||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
![]() |
|||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
|
|||||||||||||||
Ensembl |
|
|
|||||||||||||||
UniProt |
|
|
|||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 10: 110.29 – 110.3 Mb | Хр. 19: 53.37 – 53.38 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | [1] | [2] | |||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
Послідовність амінокислот
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MSEDLAKQLA | SYKAQLQQVE | AALSGNGENE | DLLKLKKDLQ | EVIELTKDLL | ||||
STQPSETLAS | SDSFASTQPT | HSWKVGDKCM | AVWSEDGQCY | EAEIEEIDEE | ||||
NGTAAITFAG | YGNAEVTPLL | NLKPVEEGRK | AKEDSGNKPM | SKKEMIAQQR | ||||
EYKKKKALKK | AQRIKELEQE | REDQKVKWQQ | FNNRAYSKNK | KGQVKRSIFA | ||||
SPESVTGKVG | VGTCGIADKP | MTQYQDTSKY | NVRHLMPQ |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як апоптоз, процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, ацетилювання. Локалізований у ядрі.
Література
ред.- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Talbot K., Miguel-Aliaga I., Mohaghegh P., Ponting C.P., Davies K.E. (1998). Characterization of a gene encoding survival motor neuron (SMN)-related protein, a constituent of the spliceosome complex. Hum. Mol. Genet. 7: 2149—2156. PMID 9817934 DOI:10.1093/hmg/7.13.2149
- Rappsilber J., Ajuh P., Lamond A.I., Mann M. (2001). SPF30 is an essential human splicing factor required for assembly of the U4/U5/U6 tri-small nuclear ribonucleoprotein into the spliceosome. J. Biol. Chem. 276: 31142—31150. PMID 11331295 DOI:10.1074/jbc.M103620200
- Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
Примітки
ред.- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16900 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
- ↑ UniProt, O75940 (англ.) . Архів оригіналу за 27 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
Див. також
ред.Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |