SMIM1

SMIM1 (англ. Small integral membrane protein 1 (Vel blood group)) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 1-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 78 амінокислот, а молекулярна маса — 8 749.

SMIM1
Ідентифікатори
Символи	SMIM1, Vel, small integral membrane protein 1 (Vel blood group)
Зовнішні ІД	OMIM: 615242 MGI: 1916109 HomoloGene: 130039 GeneCards: SMIM1
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	388588	68859
Ensembl	ENSG00000235169	ENSMUSG00000078350
UniProt	B2RUZ4	P0C8K7
RefSeq (мРНК)	NM_001288583 NM_001163724 NM_001379690 NM_001379691	NM_001033144 NM_001163721 NM_001163722 NM_001357248
RefSeq (білок)	NP_001157196 NP_001275512 NP_001366619 NP_001366620	NP_001157193 NP_001157194 NP_001344177
Локус (UCSC)	Хр. 1: 3.77 – 3.78 Mb	Хр. 4: 154.1 – 154.11 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MQPQESHVHY		SRWEDGSRDG		VSLGAVSSTE		EASRCRRISQ		RLCTGKLGIA
MKVLGGVALF		WIIFILGYLT		GYYVHKCK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як ацетилювання. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Arnaud L., Kelley L.P., Helias V., Cartron J.P., Ballif B.A. (2015). SMIM1 is a type II transmembrane phosphoprotein and displays the Vel blood group antigen at its carboxyl-terminus. FEBS Lett. 589: 3624—3630. PMID 26452714 DOI:10.1016/j.febslet.2015.09.029

Див. також

• Хромосома 1