SMARCAL1
білок-кодуючий ген Homo Sapiens
SMARCAL1 (англ. SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a like 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 954 амінокислот, а молекулярна маса — 105 938[5].
Послідовність амінокислот
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MSLPLTEEQR | KKIEENRQKA | LARRAEKLLA | EQHQRTSSGT | SIAGNPFQAK | ||||
QGPSQNFPRE | SCKPVSHGVI | FKQQNLSSSS | NADQRPHDSH | SFQAKGIWKK | ||||
PEEMPTACPG | HSPRSQMALT | GISPPLAQSP | PEVPKQQLLS | YELGQGHAQA | ||||
SPEIRFTPFA | NPTHKPLAKP | KSSQETPAHS | SGQPPRDAKL | EAKTAKASPS | ||||
GQNISYIHSS | SESVTPRTEG | RLQQKSGSSV | QKGVNSQKGK | CVRNGDRFQV | ||||
LIGYNAELIA | VFKTLPSKNY | DPDTKTWNFS | MNDYSALMKA | AQSLPTVNLQ | ||||
PLEWAYGSSE | SPSTSSEGQA | GLPSAPSLSF | VKGRCMLISR | AYFEADISYS | ||||
QDLIALFKQM | DSRRYDVKTR | KWSFLLEEHS | KLIAKVRCLP | QVQLDPLPTT | ||||
LTLAFASQLK | KTSLSLTPDV | PEADLSEVDP | KLVSNLMPFQ | RAGVNFAIAK | ||||
GGRLLLADDM | GLGKTIQAIC | IAAFYRKEWP | LLVVVPSSVR | FTWEQAFLRW | ||||
LPSLSPDCIN | VVVTGKDRLT | AGLINIVSFD | LLSKLEKQLK | TPFKVVIIDE | ||||
SHFLKNSRTA | RCRAAMPVLK | VAKRVILLSG | TPAMSRPAEL | YTQIIAVKPT | ||||
FFPQFHAFGL | RYCDAKRMPW | GWDYSGSSNL | GELKLLLEEA | VMLRRLKSDV | ||||
LSQLPAKQRK | IVVIAPGRIN | ARTRAALDAA | AKEMTTKDKT | KQQQKDALIL | ||||
FFNRTAEAKI | PSVIEYILDL | LESGREKFLV | FAHHKVVLDA | ITQELERKHV | ||||
QHIRIDGSTS | SAEREDLCQQ | FQLSERHAVA | VLSITAANMG | LTFSSADLVV | ||||
FAELFWNPGV | LIQAEDRVHR | IGQTSSVGIH | YLVAKGTADD | YLWPLIQEKI | ||||
KVLAEAGLSE | TNFSEMTEST | DYLYKDPKQQ | KIYDLFQKSF | EKEGSDMELL | ||||
EAAESFDPGS | ASGTSGSSSQ | NMGDTLDESS | LTASPQKKRR | FEFFDNWDSF | ||||
TSPL |
Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, геліказ, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, ацетиляція. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у ядрі.
Література
ред.- Coleman M.A., Eisen J.A., Mohrenweiser H.W. (2000). Cloning and characterization of HARP/SMARCAL1: a prokaryotic HepA-related SNF2 helicase protein from human and mouse. Genomics. 65: 274—282. PMID 10857751 DOI:10.1006/geno.2000.6174
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Yusufzai T., Kong X., Yokomori K., Kadonaga J.T. (2009). The annealing helicase HARP is recruited to DNA repair sites via an interaction with RPA. Genes Dev. 23: 2400—2404. PMID 19793863 DOI:10.1101/gad.1831509
- Bansbach C.E., Betous R., Lovejoy C.A., Glick G.G., Cortez D. (2009). The annealing helicase SMARCAL1 maintains genome integrity at stalled replication forks. Genes Dev. 23: 2405—2414. PMID 19793861 DOI:10.1101/gad.1839909
- Yusufzai T., Kadonaga J.T. (2008). HARP is an ATP-driven annealing helicase. Science. 322: 748—750. PMID 18974355 DOI:10.1126/science.1161233
Примітки
ред.- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з SMARCAL1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11102 (англ.) . Архів оригіналу за 28 травня 2017. Процитовано 29 серпня 2017.
- ↑ UniProt, Q9NZC9 (англ.) . Архів оригіналу за 25 серпня 2017. Процитовано 29 серпня 2017.
Див. також
ред.Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |