SMARCAD1
білок-кодуючий ген Homo Sapiens
SMARCAD1 (англ. SWI/SNF-related, matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin, subfamily a, containing DEAD/H box 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 026 амінокислот, а молекулярна маса — 117 402[5].
Послідовність амінокислот
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MNLFNLDRFR | FEKRNKIEEA | PEATPQPSQP | GPSSPISLSA | EEENAEGEVS | ||||
RANTPDSDIT | EKTEDSSVPE | TPDNERKASI | SYFKNQRGIQ | YIDLSSDSED | ||||
VVSPNCSNTV | QEKTFNKDTV | IIVSEPSEDE | ESQGLPTMAR | RNDDISELED | ||||
LSELEDLKDA | KLQTLKELFP | QRSDNDLLKL | IESTSTMDGA | IAAALLMFGD | ||||
AGGGPRKRKL | SSSSEPYEED | EFNDDQSIKK | TRLDHGEESN | ESAESSSNWE | ||||
KQESIVLKLQ | KEFPNFDKQE | LREVLKEHEW | MYTEALESLK | VFAEDQDMQY | ||||
VSQSEVPNGK | EVSSRSQNYP | KNATKTKLKQ | KFSMKAQNGF | NKKRKKNVFN | ||||
PKRVVEDSEY | DSGSDVGSSL | DEDYSSGEEV | MEDGYKGKIL | HFLQDASIGE | ||||
LTLIPQCSQK | KAQKITELRP | FNSWEALFTK | MSKTNGLSED | LIWHCKTLIQ | ||||
ERDVVIRLMN | KCEDISNKLT | KQVTMLTGNG | GGWNIEQPSI | LNQSLSLKPY | ||||
QKVGLNWLAL | VHKHGLNGIL | ADEMGLGKTI | QAIAFLAYLY | QEGNNGPHLI | ||||
VVPASTIDNW | LREVNLWCPT | LKVLCYYGSQ | EERKQIRFNI | HSRYEDYNVI | ||||
VTTYNCAISS | SDDRSLFRRL | KLNYAIFDEG | HMLKNMGSIR | YQHLMTINAN | ||||
NRLLLTGTPV | QNNLLELMSL | LNFVMPHMFS | SSTSEIRRMF | SSKTKSADEQ | ||||
SIYEKERIAH | AKQIIKPFIL | RRVKEEVLKQ | LPPKKDRIEL | CAMSEKQEQL | ||||
YLGLFNRLKK | SINNLEKNTE | MCNVMMQLRK | MANHPLLHRQ | YYTAEKLKEM | ||||
SQLMLKEPTH | CEANPDLIFE | DMEVMTDFEL | HVLCKQYRHI | NNFQLDMDLI | ||||
LDSGKFRVLG | CILSELKQKG | DRVVLFSQFT | MMLDILEVLL | KHHQHRYLRL | ||||
DGKTQISERI | HLIDEFNTDM | DIFVFLLSTK | AGGLGINLTS | ANVVILHDID | ||||
CNPYNDKQAE | DRCHRVGQTK | EVLVIKLISQ | GTIEESMLKI | NQQKLKLEQD | ||||
MTTVDEGDEG | SMPADIATLL | KTSMGL |
Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, геліказ, регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як пошкодження ДНК, репарація ДНК, поліморфізм, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, ДНК. Локалізований у ядрі, хромосомах.
Література
ред.- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Marks K.C., Banks W.R. III, Cunningham D., Witman P.M., Herman G.E. (2014). Analysis of two candidate genes for Basan syndrome. Am. J. Med. Genet. A. 164A: 1188—1191. PMID 24664640 DOI:10.1002/ajmg.a.36438
Примітки
ред.- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з SMARCAD1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:18398 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, Q9H4L7 (англ.) . Архів оригіналу за 26 лютого 2018. Процитовано 30 серпня 2017.
Див. також
ред.Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |