SLMAP

SLMAP
Ідентифікатори
Символи	SLMAP, SLAP, sarcolemma associated protein
Зовнішні ІД	OMIM: 602701 MGI: 1933549 HomoloGene: 31428 GeneCards: SLMAP
Пов'язані генетичні захворювання
	ожиріння
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding;
Клітинна компонента	• smooth endoplasmic reticulum; • цитоплазма; • integral component of membrane; • Сарколема; • клітинна мембрана; • integral component of plasma membrane; • цитоскелет; • мембрана; • центр організації мікротрубочок;
Біологічний процес	• м'язове скорочення; • protein localization to plasma membrane; • regulation of membrane depolarization during cardiac muscle cell action potential; • regulation of sodium ion transmembrane transport; • regulation of voltage-gated sodium channel activity;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	7871
	83997
	ENSG00000163681
	ENSMUSG00000021870
	Q14BN4
	Q3URD3
NM_001304420; NM_001304421; NM_001304422; NM_001304423; NM_001311178;
	NM_001311179; NM_007159; NM_001377538; NM_001377539; NM_001377540; NM_001377541; NM_001377542; NM_001377545; NM_001377549; NM_001377551; NM_001377552; NM_001377555; NM_001377557; NM_001377559; NM_001377562; NM_001377921; NM_001377922; NM_001377923; NM_001377924; NM_001377925; NM_001377926; NM_001377927; NM_001377928
	NM_032008; NM_001310445; NM_001347494
NP_001291349; NP_001291350; NP_001291351; NP_001291352; NP_001298107;
	NP_001298108; NP_009090
	NP_001297374; NP_001334423; NP_114397
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

SLMAP (англ. Sarcolemma associated protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 828 амінокислот, а молекулярна маса — 95 198^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MPSALAIFTC	RPNSHPFQER	HVYLDEPIKI	GRSVARCRPA	QNNATFDCKV
LSRNHALVWF	DHKTGKFYLQ	DTKSSNGTFI	NSQRLSRGSE	ESPPCEILSG
DIIQFGVDVT	ENTRKVTHGC	IVSTIKLFLP	DGMEARLRSD	VIHAPLPSPV
DKVAANTPSM	YSQELFQLSQ	YLQEALHREQ	MLEQKLATLQ	RLLAITQEAS
DTSWQALIDE	DRLLSRLEVM	GNQLQACSKN	QTEDSLRKEL	IALQEDKHNY
ETTAKESLRR	VLQEKIEVVR	KLSEVERSLS	NTEDECTHLK	EMNERTQEEL
RELANKYNGA	VNEIKDLSDK	LKVAEGKQEE	IQQKGQAEKK	ELQHKIDEME
EKEQELQAKI	EALQADNDFT	NERLTALQVR	LEHLQEKTLK	ECSSLEHLLS
KSGGDCTFIH	QFIECQKKLI	VEGHLTKAVE	ETKLSKENQT	RAKESDFSDT
LSPSKEKSSD	DTTDAQMDEQ	DLNEPLAKVS	LLKDDLQGAQ	SEIEAKQEIQ
HLRKELIEAQ	ELARTSKQKC	FELQALLEEE	RKAYRNQVEE	STKQIQVLQA
QLQRLHIDTE	NLREEKDSEI	TSTRDELLSA	RDEILLLHQA	AAKVASERDT
DIASLQEELK	KVRAELERWR	KAASEYEKEI	TSLQNSFQLR	CQQCEDQQRE
EATRLQGELE	KLRKEWNALE	TECHSLKREN	VLLSSELQRQ	EKELHNSQKQ
SLELTSDLSI	LQMSRKELEN	QVGSLKEQHL	RDSADLKTLL	SKAENQAKDV
QKEYEKTQTV	LSELKLKFEM	TEQEKQSITD	ELKQCKNNLK	LLREKGNNKP
WPWMPMLAAL	VAVTAIVLYV	PGLARASP

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі як альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, мембрані.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Nagase T., Kikuno R., Nakayama M., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVIII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 273—281. PMID 10997877 DOI:10.1093/dnares/7.4.271