SLITRK2
білок-кодуючий ген Homo Sapiens
SLITRK2 (англ. SLIT and NTRK like family member 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на X-хромосомі.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 845 амінокислот, а молекулярна маса — 95 404[4].
| SLITRK2 | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Ідентифікатори | |||||||
| Символи | SLITRK2, CXorf2, SLITL1, SLIT and NTRK like family member 2, CXorf1, TMEM257 | ||||||
| Зовнішні ІД | OMIM: 300561 MGI: 2679449 HomoloGene: 13054 GeneCards: SLITRK2 | ||||||
| Шаблон експресії | |||||||
   |
|||||||
| Більше даних | |||||||
| Ортологи | |||||||
| Види | Людина | Миша | |||||
| Entrez |
|
|
|||||
| Ensembl |
|
|
|||||
| UniProt |
|
|
|||||
| RefSeq (мРНК) |
|
| |||||
| RefSeq (білок) |
|
| |||||
| Локус (UCSC) | Хр. X: 145.82 – 145.83 Mb | Хр. X: 65.69 – 65.7 Mb | |||||
| PubMed search | [1] | [2] | |||||
| Вікідані | |||||||
| |||||||
Послідовність амінокислот
| 10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| MLSGVWFLSV | LTVAGILQTE | SRKTAKDICK | IRCLCEEKEN | VLNINCENKG | ||||
| FTTVSLLQPP | QYRIYQLFLN | GNLLTRLYPN | EFVNYSNAVT | LHLGNNGLQE | ||||
| IRTGAFSGLK | TLKRLHLNNN | KLEILREDTF | LGLESLEYLQ | ADYNYISAIE | ||||
| AGAFSKLNKL | KVLILNDNLL | LSLPSNVFRF | VLLTHLDLRG | NRLKVMPFAG | ||||
| VLEHIGGIME | IQLEENPWNC | TCDLLPLKAW | LDTITVFVGE | IVCETPFRLH | ||||
| GKDVTQLTRQ | DLCPRKSASD | SSQRGSHADT | HVQRLSPTMN | PALNPTRAPK | ||||
| ASRPPKMRNR | PTPRVTVSKD | RQSFGPIMVY | QTKSPVPLTC | PSSCVCTSQS | ||||
| SDNGLNVNCQ | ERKFTNISDL | QPKPTSPKKL | YLTGNYLQTV | YKNDLLEYSS | ||||
| LDLLHLGNNR | IAVIQEGAFT | NLTSLRRLYL | NGNYLEVLYP | SMFDGLQSLQ | ||||
| YLYLEYNVIK | EIKPLTFDAL | INLQLLFLNN | NLLRSLPDNI | FGGTALTRLN | ||||
| LRNNHFSHLP | VKGVLDQLPA | FIQIDLQENP | WDCTCDIMGL | KDWTEHANSP | ||||
| VIINEVTCES | PAKHAGEILK | FLGREAICPD | SPNLSDGTVL | SMNHNTDTPR | ||||
| SLSVSPSSYP | ELHTEVPLSV | LILGLLVVFI | LSVCFGAGLF | VFVLKRRKGV | ||||
| PSVPRNTNNL | DVSSFQLQYG | SYNTETHDKT | DGHVYNYIPP | PVGQMCQNPI | ||||
| YMQKEGDPVA | YYRNLQEFSY | SNLEEKKEEP | ATPAYTISAT | ELLEKQATPR | ||||
| EPELLYQNIA | ERVKELPSAG | LVHYNFCTLP | KRQFAPSYES | RRQNQDRINK | ||||
| TVLYGTPRKC | FVGQSKPNHP | LLQAKPQSEP | DYLEVLEKQT | AISQL |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.
Література
ред.- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Nagase T., Nakayama M., Nakajima D., Kikuno R., Ohara O. (2001). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XX. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 8: 85—95. PMID 11347906 DOI:10.1093/dnares/8.2.85
- Aruga J., Yokota N., Mikoshiba K. (2003). Human SLITRK family genes: genomic organization and expression profiling in normal brain and brain tumor tissue. Gene. 315: 87—94. PMID 14557068 DOI:10.1016/S0378-1119(03)00715-7
- Beaubien F., Raja R., Kennedy T.E., Fournier A.E., Cloutier J.F. (2016). Slitrk1 is localized to excitatory synapses and promotes their development. Sci. Rep. 6: 27343—27343. PMID 27273464 DOI:10.1038/srep27343
Примітки
ред.- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:13449 (англ.) . Архів оригіналу за 15 березня 2016. Процитовано 12 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q9H156 (англ.) . Архів оригіналу за 22 грудня 2016. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
ред.| На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |
|
Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |