SLAMF1

SLAMF1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1M27, 1KA7, 1I3Z, 1D4T, 1D4W, 1KA6
Ідентифікатори
Символи	SLAMF1, CD150, CDw150, SLAM, signaling lymphocytic activation molecule family member 1
Зовнішні ІД	OMIM: 603492 MGI: 1351314 HomoloGene: 48162 GeneCards: SLAMF1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0003823, GO:0051635 antigen binding; • virus receptor activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • transmembrane signaling receptor activity; • identical protein binding; • signaling receptor activity;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • мембрана; • клітинна мембрана; • extracellular region; • cell surface; • phagocytic vesicle; • екзосома; • external side of plasma membrane;
Біологічний процес	• адаптивна імунна відповідь; • процес імунної системи; • natural killer cell proliferation; • T-helper 1 cell cytokine production; • negative regulation of interleukin-6 production; • positive regulation of JNK cascade; • адгезія клітин; • negative regulation of CD40 signaling pathway; • negative regulation of T cell cytokine production; • myeloid dendritic cell activation involved in immune response; • regulation of vesicle fusion; • positive regulation of cell population proliferation; • positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade; • Фагоцитоз; • lymphocyte activation; • viral entry into host cell; • negative regulation of tumor necrosis factor production; • вроджений імунітет; • GO:0048552 regulation of catalytic activity; • GO:0022415 viral process; • positive regulation of activated T cell proliferation; • negative regulation of interleukin-12 production; • natural killer cell differentiation; • GO:0072468 сигнальна трансдукція; • leukocyte chemotaxis involved in inflammatory response; • positive regulation of macrophage chemotaxis; • positive regulation of dendritic cell chemotaxis;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	6504
	27218
	ENSG00000117090
	ENSMUSG00000015316
	Q13291
	Q9QUM4
	NM_003037; NM_001330754
	NM_013730; NM_001360898
	NP_001317683; NP_003028
	NP_038758; NP_001347827
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

SLAMF1 (англ. Signaling lymphocytic activation molecule family member 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 335 амінокислот, а молекулярна маса — 37 231^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MDPKGLLSLT	FVLFLSLAFG	ASYGTGGRMM	NCPKILRQLG	SKVLLPLTYE
RINKSMNKSI	HIVVTMAKSL	ENSVENKIVS	LDPSEAGPPR	YLGDRYKFYL
ENLTLGIRES	RKEDEGWYLM	TLEKNVSVQR	FCLQLRLYEQ	VSTPEIKVLN
KTQENGTCTL	ILGCTVEKGD	HVAYSWSEKA	GTHPLNPANS	SHLLSLTLGP
QHADNIYICT	VSNPISNNSQ	TFSPWPGCRT	DPSETKPWAV	YAGLLGGVIM
ILIMVVILQL	RRRGKTNHYQ	TTVEKKSLTI	YAQVQKPGPL	QKKLDSFPAQ
DPCTTIYVAA	TEPVPESVQE	TNSITVYASV	TLPES

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів клітини-хазяїна для входу вірусу, рецепторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, адаптивний імунітет, імунітет, вроджений імунітет, взаємодія хазяїн-вірус, поліморфізм. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані. Також секретований назовні.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Ferrand V., Li C., Romeo G., Yin L. (2003). Absence of SLAM mutations in EBV-associated lymphoproliferative disease patients. J. Med. Virol. 70: 131—136. PMID 12629654 DOI:10.1002/jmv.10373
Tatsuo H., Ono N., Tanaka K., Yanagi Y. (2000). SLAM (CDw150) is a cellular receptor for measles virus. Nature. 406: 893—897. PMID 10972291 DOI:10.1038/35022579
Li C., Iosef C., Jia C.Y., Han V.K., Li S.S. (2003). Dual functional roles for the X-linked lymphoproliferative syndrome gene product SAP/SH2D1A in signaling through the signaling lymphocyte activation molecule (SLAM) family of immune receptors. J. Biol. Chem. 278: 3852—3859. PMID 12458214 DOI:10.1074/jbc.M206649200

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10903 (англ.) . Архів оригіналу за 7 квітня 2016. Процитовано 25 серпня 2017.
↑ UniProt, Q13291 (англ.) . Архів оригіналу за 2 жовтня 2013. Процитовано 25 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 1

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10903 (англ.) . Архів оригіналу за 7 квітня 2016. Процитовано 25 серпня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q13291 (англ.) . Архів оригіналу за 2 жовтня 2013. Процитовано 25 серпня 2017.

[3]

[4]

[1]

[2]