SIX2

SIX2 (англ. SIX homeobox 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 291 амінокислот, а молекулярна маса — 32 286.

SIX2
Ідентифікатори
Символи	SIX2, SIX homeobox 2
Зовнішні ІД	OMIM: 604994 MGI: 102778 HomoloGene: 56518 GeneCards: SIX2
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • sequence-specific DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • transcription factor binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0032403 protein-containing complex binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0000975 transcription cis-regulatory region binding Клітинна компонента • клітинне ядро • transcription regulator complex Біологічний процес • embryonic skeletal system morphogenesis • regulation of chondrocyte differentiation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of chondrocyte proliferation • chondrocyte differentiation • protein import into nucleus • розвиток нирки • negative regulation of cell differentiation • anatomical structure morphogenesis • mesenchymal stem cell maintenance involved in nephron morphogenesis • mesenchymal to epithelial transition involved in metanephros morphogenesis • mesenchymal cell differentiation involved in kidney development • mesenchymal stem cell proliferation • transcription by RNA polymerase II • regulation of branching involved in ureteric bud morphogenesis • multicellular organism development • nephron morphogenesis • nephron development • middle ear morphogenesis • embryonic digestive tract morphogenesis • embryonic cranial skeleton morphogenesis • regulation of ossification • проліферація • mesodermal cell fate specification • anterior/posterior axis specification • metanephros development • cell migration • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • condensed mesenchymal cell proliferation • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:1903374 anatomical structure development Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10736	20472
Ensembl	ENSG00000170577	ENSMUSG00000024134
UniProt	Q9NPC8 Q8TBA2	Q62232
RefSeq (мРНК)	NM_016932	NM_011380
RefSeq (білок)	NP_058628 NP_058628.3	NP_035510
Локус (UCSC)	Хр. 2: 45.01 – 45.01 Mb	Хр. 17: 85.99 – 86 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSMLPTFGFT		QEQVACVCEV		LQQGGNIERL		GRFLWSLPAC		EHLHKNESVL
KAKAVVAFHR		GNFRELYKIL		ESHQFSPHNH		AKLQQLWLKA		HYIEAEKLRG
RPLGAVGKYR		VRRKFPLPRS		IWDGEETSYC		FKEKSRSVLR		EWYAHNPYPS
PREKRELAEA		TGLTTTQVSN		WFKNRRQRDR		AAEAKERENN		ENSNSNSHNP
LNGSGKSVLG		SSEDEKTPSG		TPDHSSSSPA		LLLSPPPPGL		PSLHSLGHPP
GPSAVPVPVP		GGGGADPLQH		HHGLQDSILN		PMSANLVDLG		S

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку. Задіяний у такому біологічному процесі як поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Див. також

• Хромосома 2