Відкрити головне меню

SHROOM3 (англ. Shroom family member 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 996 амінокислот, а молекулярна маса — 216 857[5].

SHROOM3
Ідентифікатори
Символи SHROOM3, APXL3, SHRM, ShrmL, MSTP013, shroom family member 3
Зовнішні ІД MGI: 1351655 HomoloGene: 9263 GeneCards: SHROOM3
Пов'язані генетичні захворювання
Захворювання нирок[1]
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_020859
NM_001077595
NM_001077596
NM_015756
RefSeq (білок)
NP_065910
NP_001071063
NP_001071064
NP_056571
Локус (UCSC) Хр. 4: 76.44 – 76.78 Mb Хр. 5: 92.68 – 92.97 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей
Послідовність амінокислот
1020304050
MMRTTEDFHKPSATLNSNTATKGRYIYLEAFLEGGAPWGFTLKGGLEHGE
PLIISKVEEGGKADTLSSKLQAGDEVVHINEVTLSSSRKEAVSLVKGSYK
TLRLVVRRDVCTDPGHADTGASNFVSPEHLTSGPQHRKAAWSGGVKLRLK
HRRSEPAGRPHSWHTTKSGEKQPDASMMQISQGMIGPPWHQSYHSSSSTS
DLSNYDHAYLRRSPDQCSSQGSMESLEPSGAYPPCHLSPAKSTGSIDQLS
HFHNKRDSAYSSFSTSSSILEYPHPGISGRERSGSMDNTSARGGLLEGMR
QADIRYVKTVYDTRRGVSAEYEVNSSALLLQGREARASANGQGYDKWSNI
PRGKGVPPPSWSQQCPSSLETATDNLPPKVGAPLPPARSDSYAAFRHRER
PSSWSSLDQKRLCRPQANSLGSLKSPFIEEQLHTVLEKSPENSPPVKPKH
NYTQKAQPGQPLLPTSIYPVPSLEPHFAQVPQPSVSSNGMLYPALAKESG
YIAPQGACNKMATIDENGNQNGSGRPGFAFCQPLEHDLLSPVEKKPEATA
KYVPSKVHFCSVPENEEDASLKRHLTPPQGNSPHSNERKSTHSNKPSSHP
HSLKCPQAQAWQAGEDKRSSRLSEPWEGDFQEDHNANLWRRLEREGLGQS
LSGNFGKTKSAFSSLQNIPESLRRHSSLELGRGTQEGYPGGRPTCAVNTK
AEDPGRKAAPDLGSHLDRQVSYPRPEGRTGASASFNSTDPSPEEPPAPSH
PHTSSLGRRGPGPGSASALQGFQYGKPHCSVLEKVSKFEQREQGSQRPSV
GGSGFGHNYRPHRTVSTSSTSGNDFEETKAHIRFSESAEPLGNGEQHFKN
GELKLEEASRQPCGQQLSGGASDSGRGPQRPDARLLRSQSTFQLSSEPER
EPEWRDRPGSPESPLLDAPFSRAYRNSIKDAQSRVLGATSFRRRDLELGA
PVASRSWRPRPSSAHVGLRSPEASASASPHTPRERHSVTPAEGDLARPVP
PAARRGARRRLTPEQKKRSYSEPEKMNEVGIVEEAEPAPLGPQRNGMRFP
ESSVADRRRLFERDGKACSTLSLSGPELKQFQQSALADYIQRKTGKRPTS
AAGCSLQEPGPLRERAQSAYLQPGPAALEGSGLASASSLSSLREPSLQPR
REATLLPATVAETQQAPRDRSSSFAGGRRLGERRRGDLLSGANGGTRGTQ
RGDETPREPSSWGARAGKSMSAEDLLERSDVLAGPVHVRSRSSPATADKR
QDVLLGQDSGFGLVKDPCYLAGPGSRSLSCSERGQEEMLPLFHHLTPRWG
GSGCKAIGDSSVPSECPGTLDHQRQASRTPCPRPPLAGTQGLVTDTRAAP
LTPIGTPLPSAIPSGYCSQDGQTGRQPLPPYTPAMMHRSNGHTLTQPPGP
RGCEGDGPEHGVEEGTRKRVSLPQWPPPSRAKWAHAAREDSLPEESSAPD
FANLKHYQKQQSLPSLCSTSDPDTPLGAPSTPGRISLRISESVLRDSPPP
HEDYEDEVFVRDPHPKATSSPTFEPLPPPPPPPPSQETPVYSMDDFPPPP
PHTVCEAQLDSEDPEGPRPSFNKLSKVTIARERHMPGAAHVVGSQTLASR
LQTSIKGSEAESTPPSFMSVHAQLAGSLGGQPAPIQTQSLSHDPVSGTQG
LEKKVSPDPQKSSEDIRTEALAKEIVHQDKSLADILDPDSRLKTTMDLME
GLFPRDVNLLKENSVKRKAIQRTVSSSGCEGKRNEDKEAVSMLVNCPAYY
SVSAPKAELLNKIKEMPAEVNEEEEQADVNEKKAELIGSLTHKLETLQEA
KGSLLTDIKLNNALGEEVEALISELCKPNEFDKYRMFIGDLDKVVNLLLS
LSGRLARVENVLSGLGEDASNEERSSLYEKRKILAGQHEDARELKENLDR
RERVVLGILANYLSEEQLQDYQHFVKMKSTLLIEQRKLDDKIKLGQEQVK
CLLESLPSDFIPKAGALALPPNLTSEPIPAGGCTFSGIFPTLTSPL

Кодований геном білок за функціями належить до білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як пдтримання форми клітини, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з молекулою актину. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, клітинних контактах.

ЛітератураРедагувати

  • Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro.. DNA Res. 7: 143 — 150.  PubMed DOI:10.1093/dnares/7.2.143
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004.  PubMed DOI:10.1101/gr.2596504

ПриміткиРедагувати

Див. такожРедагувати