SHMT1

SHMT1 (англ. Serine hydroxymethyltransferase 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 483 амінокислот, а молекулярна маса — 53 083.

SHMT1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1BJ4
Ідентифікатори
Символи	SHMT1, CSHMT, SHMT, serine hydroxymethyltransferase 1
Зовнішні ІД	OMIM: 182144 MGI: 98299 HomoloGene: 3074 GeneCards: SHMT1
Онтологія гена Молекулярна функція • transferase activity • serine binding • protein homodimerization activity • amino acid binding • L-allo-threonine aldolase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • каталітична активність • pyridoxal phosphate binding • identical protein binding • translation repressor activity, mRNA regulatory element binding • glycine hydroxymethyltransferase activity • mRNA 5'-UTR binding • zinc ion binding • cobalt ion binding Клітинна компонента • гіалоплазма • мітохондрія • екзосома • клітинне ядро • цитоплазма Біологічний процес • cellular response to tetrahydrofolate • glycine metabolic process • one-carbon metabolic process • tetrahydrofolate interconversion • protein tetramerization • L-serine catabolic process • tetrahydrofolate metabolic process • folic acid metabolic process • glycine biosynthetic process from serine • dTMP biosynthetic process • glycine biosynthetic process • purine nucleobase biosynthetic process • protein homotetramerization • carnitine biosynthetic process • L-serine metabolic process • negative regulation of translation • cellular response to leukemia inhibitory factor Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6470	20425
Ensembl	ENSG00000176974 ENSG00000284320	ENSMUSG00000020534
UniProt	P34896	P50431
RefSeq (мРНК)	NM_001281786 NM_004169 NM_148918	NM_009171
RefSeq (білок)	NP_001268715 NP_004160 NP_683718	NP_033197
Локус (UCSC)	Хр. 17: 18.33 – 18.36 Mb	Хр. 11: 60.68 – 60.7 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MTMPVNGAHK		DADLWSSHDK		MLAQPLKDSD		VEVYNIIKKE		SNRQRVGLEL
IASENFASRA		VLEALGSCLN		NKYSEGYPGQ		RYYGGTEFID		ELETLCQKRA
LQAYKLDPQC		WGVNVQPYSG		SPANFAVYTA		LVEPHGRIMG		LDLPDGGHLT
HGFMTDKKKI		SATSIFFESM		PYKVNPDTGY		INYDQLEENA		RLFHPKLIIA
GTSCYSRNLE		YARLRKIADE		NGAYLMADMA		HISGLVAAGV		VPSPFEHCHV
VTTTTHKTLR		GCRAGMIFYR		KGVKSVDPKT		GKEILYNLES		LINSAVFPGL
QGGPHNHAIA		GVAVALKQAM		TLEFKVYQHQ		VVANCRALSE		ALTELGYKIV
TGGSDNHLIL		VDLRSKGTDG		GRAEKVLEAC		SIACNKNTCP		GDRSALRPSG
LRLGTPALTS		RGLLEKDFQK		VAHFIHRGIE		LTLQIQSDTG		VRATLKEFKE
RLAGDKYQAA		VQALREEVES		FASLFPLPGL		PDF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до трансфераз. Задіяний у таких біологічних процесах, як одновуглецевий метаболізм, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з піридоксаль-фосфатом. Локалізований у цитоплазмі.

Література

• Chave K.J., Snell K., Sanders P.G. (1997). Isolation and characterisation of human genomic sequences encoding cytosolic serine hydroxymethyltransferase. Biochem. Soc. Trans. 25: 53—53. PMID 9056951 DOI:10.1042/bst025053s
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Renwick S.B., Snell K., Baumann U. (1998). The crystal structure of human cytosolic serine hydroxymethyltransferase: a target for cancer chemotherapy. Structure. 6: 1105—1116. PMID 9753690 DOI:10.1016/S0969-2126(98)00112-9

Див. також

• Хромосома 17