SHANK3
білок-кодуючий ген Homo Sapiens
SHANK3 (англ. SH3 and multiple ankyrin repeat domains 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 731 амінокислот, а молекулярна маса — 184 667[5].
Послідовність амінокислот
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MDGPGASAVV | VRVGIPDLQQ | TKCLRLDPAA | PVWAAKQRVL | CALNHSLQDA | ||||
LNYGLFQPPS | RGRAGKFLDE | ERLLQEYPPN | LDTPLPYLEF | RYKRRVYAQN | ||||
LIDDKQFAKL | HTKANLKKFM | DYVQLHSTDK | VARLLDKGLD | PNFHDPDSGE | ||||
CPLSLAAQLD | NATDLLKVLK | NGGAHLDFRT | RDGLTAVHCA | TRQRNAAALT | ||||
TLLDLGASPD | YKDSRGLTPL | YHSALGGGDA | LCCELLLHDH | AQLGITDENG | ||||
WQEIHQACRF | GHVQHLEHLL | FYGADMGAQN | ASGNTALHIC | ALYNQESCAR | ||||
VLLFRGANRD | VRNYNSQTAF | QVAIIAGNFE | LAEVIKTHKD | SDVVPFRETP | ||||
SYAKRRRLAG | PSGLASPRPL | QRSASDINLK | GEAQPAASPG | PSLRSLPHQL | ||||
LLQRLQEEKD | RDRDADQESN | ISGPLAGRAG | QSKISPSGPG | GPGPAPGPGP | ||||
APPAPPAPPP | RGPKRKLYSA | VPGRKFIAVK | AHSPQGEGEI | PLHRGEAVKV | ||||
LSIGEGGFWE | GTVKGRTGWF | PADCVEEVQM | RQHDTRPETR | EDRTKRLFRH | ||||
YTVGSYDSLT | SHSDYVIDDK | VAVLQKRDHE | GFGFVLRGAK | AETPIEEFTP | ||||
TPAFPALQYL | ESVDVEGVAW | RAGLRTGDFL | IEVNGVNVVK | VGHKQVVALI | ||||
RQGGNRLVMK | VVSVTRKPEE | DGARRRAPPP | PKRAPSTTLT | LRSKSMTAEL | ||||
EELASIRRRK | GEKLDEMLAA | AAEPTLRPDI | ADADSRAATV | KQRPTSRRIT | ||||
PAEISSLFER | QGLPGPEKLP | GSLRKGIPRT | KSVGEDEKLA | SLLEGRFPRS | ||||
TSMQDPVREG | RGIPPPPQTA | PPPPPAPYYF | DSGPPPAFSP | PPPPGRAYDT | ||||
VRSSFKPGLE | ARLGAGAAGL | YEPGAALGPL | PYPERQKRAR | SMIILQDSAP | ||||
ESGDAPRPPP | AATPPERPKR | RPRPPGPDSP | YANLGAFSAS | LFAPSKPQRR | ||||
KSPLVKQLQV | EDAQERAALA | VGSPGPGGGS | FAREPSPTHR | GPRPGGLDYG | ||||
AGDGPGLAFG | GPGPAKDRRL | EERRRSTVFL | SVGAIEGSAP | GADLPSLQPS | ||||
RSIDERLLGT | GPTAGRDLLL | PSPVSALKPL | VSGPSLGPSG | STFIHPLTGK | ||||
PLDPSSPLAL | ALAARERALA | SQAPSRSPTP | VHSPDADRPG | PLFVDVQARD | ||||
PERGSLASPA | FSPRSPAWIP | VPARREAEKV | PREERKSPED | KKSMILSVLD | ||||
TSLQRPAGLI | VVHATSNGQE | PSRLGGAEEE | RPGTPELAPA | PMQSAAVAEP | ||||
LPSPRAQPPG | GTPADAGPGQ | GSSEEEPELV | FAVNLPPAQL | SSSDEETREE | ||||
LARIGLVPPP | EEFANGVLLA | TPLAGPGPSP | TTVPSPASGK | PSSEPPPAPE | ||||
SAADSGVEEA | DTRSSSDPHL | ETTSTISTVS | SMSTLSSESG | ELTDTHTSFA | ||||
DGHTFLLEKP | PVPPKPKLKS | PLGKGPVTFR | DPLLKQSSDS | ELMAQQHHAA | ||||
SAGLASAAGP | ARPRYLFQRR | SKLWGDPVES | RGLPGPEDDK | PTVISELSSR | ||||
LQQLNKDTRS | LGEEPVGGLG | SLLDPAKKSP | IAAARLFSSL | GELSSISAQR | ||||
SPGGPGGGAS | YSVRPSGRYP | VARRAPSPVK | PASLERVEGL | GAGAGGAGRP | ||||
FGLTPPTILK | SSSLSIPHEP | KEVRFVVRSV | SARSRSPSPS | PLPSPASGPG | ||||
PGAPGPRRPF | QQKPLQLWSK | FDVGDWLESI | HLGEHRDRFE | DHEIEGAHLP | ||||
ALTKDDFVEL | GVTRVGHRMN | IERALRQLDG | S |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Білок має сайт для зв'язування з молекулою актину. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані, клітинних контактах, клітинних відростках, синапсах.
Література ред.
- Hirosawa M., Nagase T., Murahashi Y., Kikuno R., Ohara O. (2001). Identification of novel transcribed sequences on human chromosome 22 by expressed sequence tag mapping. DNA Res. 8: 1—9. PMID 11258795 DOI:10.1093/dnares/8.1.1
- Soltau M., Richter D., Kreienkamp H.-J. (2002). The insulin receptor substrate IRSp53 links postsynaptic shank1 to the small G-protein cdc42. Mol. Cell. Neurosci. 21: 575—583. PMID 12504591 DOI:10.1006/mcne.2002.1201
- Sheng M., Kim E. (2000). The Shank family of scaffold proteins. J. Cell Sci. 113: 1851—1856. PMID 10806096
Примітки ред.
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з SHANK3 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14294 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q9BYB0 (англ.) . Архів оригіналу за 23 липня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також ред.
Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |