SGTA

SGTA
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2VYI, 4CPG, 4GOD, 4GOE, 4GOF
Ідентифікатори
Символи	SGTA, SGT, alphaSGT, hSGT, small glutamine rich tetratricopeptide repeat containing alpha, small glutamine rich tetratricopeptide repeat co-chaperone alpha, SGT1, Vpu
Зовнішні ІД	OMIM: 603419 MGI: 1098703 HomoloGene: 31122 GeneCards: SGTA
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • BAT3 complex binding; • protein self-association; • identical protein binding; • GO:0032947 molecular adaptor activity;
Клітинна компонента	• гіалоплазма; • мембрана; • клітинне ядро; • цитоплазма; • presynapse; • extrinsic component of synaptic vesicle membrane; • TRC complex;
Біологічний процес	• positive regulation of ER-associated ubiquitin-dependent protein catabolic process; • GO:0022415 viral process; • ubiquitin-dependent ERAD pathway; • negative regulation of ER-associated ubiquitin-dependent protein catabolic process; • negative regulation of ubiquitin-dependent protein catabolic process; • tail-anchored membrane protein insertion into ER membrane; • chaperone-mediated protein folding; • posttranslational protein targeting to endoplasmic reticulum membrane; • positive regulation of chaperone-mediated protein folding;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	6449
	52551
	ENSG00000104969
	ENSMUSG00000004937
	O43765
	Q8BJU0
	NM_003021
	NM_024499; NM_001358549; NM_001358550
	NP_003012
	NP_078775; NP_001345478; NP_001345479
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

SGTA (англ. Small glutamine rich tetratricopeptide repeat containing alpha) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 313 амінокислот, а молекулярна маса — 34 063^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MDNKKRLAYA	IIQFLHDQLR	HGGLSSDAQE	SLEVAIQCLE	TAFGVTVEDS
DLALPQTLPE	IFEAAATGKE	MPQDLRSPAR	TPPSEEDSAE	AERLKTEGNE
QMKVENFEAA	VHFYGKAIEL	NPANAVYFCN	RAAAYSKLGN	YAGAVQDCER
AICIDPAYSK	AYGRMGLALS	SLNKHVEAVA	YYKKALELDP	DNETYKSNLK
IAELKLREAP	SPTGGVGSFD	IAGLLNNPGF	MSMASNLMNN	PQIQQLMSGM
ISGGNNPLGT	PGTSPSQNDL	ASLIQAGQQF	AQQMQQQNPE	LIEQLRSQIR
SRTPSASNDD	QQE

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до шаперонів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, ацетилювання. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Liu F.H., Wu S.J., Hu S.M., Hsiao C.D., Wang C. (1999). Specific interaction of the 70-kDa heat shock cognate protein with the tetratricopeptide repeats. J. Biol. Chem. 274: 34425—34432. PMID 10567422 DOI:10.1074/jbc.274.48.34425
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Liou S.T., Wang C. (2005). Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein is composed of three structural units with distinct functions. Arch. Biochem. Biophys. 435: 253—263. PMID 15708368 DOI:10.1016/j.abb.2004.12.020
Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
Boal F., Le Pevelen S., Cziepluch C., Scotti P., Lang J. (2007). Cysteine-string protein isoform beta (Cspbeta) is targeted to the trans-Golgi network as a non-palmitoylated CSP in clonal beta-cells. Biochim. Biophys. Acta. 1773: 109—119. PMID 17034881 DOI:10.1016/j.bbamcr.2006.08.054
Leznicki P., High S. (2012). SGTA antagonizes BAG6-mediated protein triage. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 109: 19214—19219. PMID 23129660 DOI:10.1073/pnas.1209997109

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10819 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, O43765 (англ.) . Архів оригіналу за 9 квітня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 19

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10819 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, O43765 (англ.) . Архів оригіналу за 9 квітня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

[3]

[4]

[1]

[2]