SGPL1

SGPL1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	4Q6R
Ідентифікатори
Символи	SGPL1, S1PL, SPL, sphingosine-1-phosphate lyase 1, NPHS14
Зовнішні ІД	OMIM: 603729 MGI: 1261415 HomoloGene: 2897 GeneCards: SGPL1
Пов'язані генетичні захворювання
	nephrotic syndrome 14, нефротичний синдром
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • каталітична активність; • lyase activity; • pyridoxal phosphate binding; • carboxy-lyase activity; • sphinganine-1-phosphate aldolase activity;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • endoplasmic reticulum membrane; • мембрана; • integral component of endoplasmic reticulum membrane; • ендоплазматичний ретикулум;
Біологічний процес	• fibroblast migration; • roof of mouth development; • luteinization; • Leydig cell differentiation; • estrogen metabolic process; • androgen metabolic process; • розвиток нирки; • ceramide metabolic process; • regulation of multicellular organism growth; • lipid metabolism; • carboxylic acid metabolic process; • skeletal system morphogenesis; • sphingolipid biosynthetic process; • post-embryonic development; • fatty acid metabolic process; • female gonad development; • васкулогенез; • nitrogen compound metabolic process; • Сперматогенез; • apoptotic signaling pathway; • platelet-derived growth factor receptor signaling pathway; • face morphogenesis; • GO:0097285 апоптоз; • sphingolipid metabolic process; • sphingolipid catabolic process; • кровотворення; • ameboidal-type cell migration;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	8879
	20397
	ENSG00000166224
	ENSMUSG00000020097
	O95470
	Q8R0X7
	NM_003901
	NM_009163; NM_001316673; NM_001316674
	NP_003892
	NP_001303602; NP_001303603; NP_033189
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

SGPL1 (англ. Sphingosine-1-phosphate lyase 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 568 амінокислот, а молекулярна маса — 63 524^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MPSTDLLMLK	AFEPYLEILE	VYSTKAKNYV	NGHCTKYEPW	QLIAWSVVWT
LLIVWGYEFV	FQPESLWSRF	KKKCFKLTRK	MPIIGRKIQD	KLNKTKDDIS
KNMSFLKVDK	EYVKALPSQG	LSSSAVLEKL	KEYSSMDAFW	QEGRASGTVY
SGEEKLTELL	VKAYGDFAWS	NPLHPDIFPG	LRKIEAEIVR	IACSLFNGGP
DSCGCVTSGG	TESILMACKA	YRDLAFEKGI	KTPEIVAPQS	AHAAFNKAAS
YFGMKIVRVP	LTKMMEVDVR	AMRRAISRNT	AMLVCSTPQF	PHGVIDPVPE
VAKLAVKYKI	PLHVDACLGG	FLIVFMEKAG	YPLEHPFDFR	VKGVTSISAD
THKYGYAPKG	SSLVLYSDKK	YRNYQFFVDT	DWQGGIYASP	TIAGSRPGGI
SAACWAALMH	FGENGYVEAT	KQIIKTARFL	KSELENIKGI	FVFGNPQLSV
IALGSRDFDI	YRLSNLMTAK	GWNLNQLQFP	PSIHFCITLL	HARKRVAIQF
LKDIRESVTQ	IMKNPKAKTT	GMGAIYGMAQ	TTVDRNMVAE	LSSVFLDSLY
STDTVTQGSQ	MNGSPKPH

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до ліаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як апоптоз, метаболізм ліпідів, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з піридоксаль-фосфатом. Локалізований у мембрані, ендоплазматичному ретикулумі.

Література

Van Veldhoven P.P., Gijsbers S., Mannaerts G.P., Vermeesch J.R., Brys V. (2000). Human sphingosine-1-phosphate lyase: cDNA cloning, functional expression studies and mapping to chromosome 10q22. Biochim. Biophys. Acta. 1487: 128—134. PMID 11018465 DOI:10.1016/S1388-1981(00)00079-2
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Zhan X., Desiderio D.M. (2006). Nitroproteins from a human pituitary adenoma tissue discovered with a nitrotyrosine affinity column and tandem mass spectrometry. Anal. Biochem. 354: 279—289. PMID 16777052 DOI:10.1016/j.ab.2006.05.024